Protein–RNA interactions for Protein: P81068

Irx1, Iroquois-class homeodomain protein IRX-1, mousemouse

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Length 480 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irx1P81068 Gh-201ENSMUST00000103071 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Irx1P81068 Bpifa6-201ENSMUST00000109753 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Irx1P81068 Prkcd-202ENSMUST00000112202 2005 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Irx1P81068 Selenoh-203ENSMUST00000117299 747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Irx1P81068 Gm9025-201ENSMUST00000122415 1575 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Irx1P81068 Rnaseh2a-206ENSMUST00000128972 1141 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Irx1P81068 Tex30-211ENSMUST00000150911 960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Irx1P81068 Dcaf10-204ENSMUST00000155551 7250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Irx1P81068 Rapgef3-217ENSMUST00000177352 3395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Irx1P81068 Gm26854-201ENSMUST00000180418 705 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Irx1P81068 Gm27838-201ENSMUST00000184829 128 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Irx1P81068 Gm34866-201ENSMUST00000196146 515 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Irx1P81068 Gm45785-201ENSMUST00000209690 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Irx1P81068 Gm7730-201ENSMUST00000212486 454 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Irx1P81068 Cartpt-201ENSMUST00000022150 827 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Irx1P81068 Cartpt-202ENSMUST00000224142 1238 ntAPPRIS P1 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Irx1P81068 AC113060.1-201ENSMUST00000225689 1573 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Irx1P81068 Nek4-201ENSMUST00000050171 2793 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Irx1P81068 Rspo3-201ENSMUST00000092623 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Irx1P81068 2900055J20Rik-201ENSMUST00000096572 723 ntAPPRIS P1 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Irx1P81068 Tbl1xr1-211ENSMUST00000202747 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Irx1P81068 Slc39a3-205ENSMUST00000168076 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Irx1P81068 Cdnf-201ENSMUST00000036350 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Irx1P81068 Slc6a20a-201ENSMUST00000040960 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Irx1P81068 Nrd1-201ENSMUST00000065977 4311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Irx1P81068 Mlx-202ENSMUST00000107302 1826 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Irx1P81068 Camk2b-206ENSMUST00000101585 1650 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Irx1P81068 Chia1-201ENSMUST00000079132 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Irx1P81068 Tmem269-202ENSMUST00000212054 1504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Irx1P81068 C130050O18Rik-201ENSMUST00000052176 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Irx1P81068 Cd40-201ENSMUST00000017799 2986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Irx1P81068 Zmynd15-201ENSMUST00000039093 2804 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Irx1P81068 Snap23-201ENSMUST00000028743 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Irx1P81068 B4galt1-201ENSMUST00000030121 3983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Irx1P81068 Dnajb6-201ENSMUST00000008733 2918 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Irx1P81068 Cops4-201ENSMUST00000045993 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Irx1P81068 Ccdc114-201ENSMUST00000038720 2460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Irx1P81068 Crx-203ENSMUST00000172758 1469 ntTSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Irx1P81068 Cyp2ab1-205ENSMUST00000182741 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Irx1P81068 AC122371.1-201ENSMUST00000220876 1477 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Irx1P81068 Poc1b-201ENSMUST00000020113 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Irx1P81068 Pank4-202ENSMUST00000070953 2706 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Irx1P81068 Zscan20-202ENSMUST00000097877 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Irx1P81068 Syt7-204ENSMUST00000223586 1344 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Irx1P81068 Pde6c-201ENSMUST00000025956 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Irx1P81068 Ccdc187-201ENSMUST00000057224 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Irx1P81068 Klf11-201ENSMUST00000020982 4086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Irx1P81068 Grid1-201ENSMUST00000043349 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Irx1P81068 Armc7-201ENSMUST00000035240 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Irx1P81068 Tfr2-204ENSMUST00000196471 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Irx1P81068 Foxp1-205ENSMUST00000113324 2121 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Irx1P81068 Foxp1-207ENSMUST00000113328 2121 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Irx1P81068 Foxp1-228ENSMUST00000177307 2121 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Irx1P81068 Zkscan3-207ENSMUST00000223831 2101 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Irx1P81068 Gm15336-201ENSMUST00000128894 1571 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Irx1P81068 Adamts14-202ENSMUST00000120336 3645 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Irx1P81068 Rnf223-201ENSMUST00000209248 2908 ntAPPRIS P1 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Irx1P81068 Amer2-201ENSMUST00000022561 10506 ntAPPRIS P1 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Irx1P81068 Lmntd1-201ENSMUST00000111706 2350 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Irx1P81068 Olfr283-202ENSMUST00000215830 2392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Irx1P81068 Gfpt1-202ENSMUST00000113655 1255 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Irx1P81068 Rpl9-203ENSMUST00000120094 680 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Irx1P81068 Spcs2-ps-201ENSMUST00000122326 682 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Irx1P81068 Rpl34-203ENSMUST00000133802 711 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Irx1P81068 Gm16215-201ENSMUST00000161990 637 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Irx1P81068 Pfdn6-204ENSMUST00000174048 560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Irx1P81068 Tmem61-202ENSMUST00000177702 561 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Irx1P81068 Gm38144-201ENSMUST00000192790 465 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Irx1P81068 AC073947.2-201ENSMUST00000215888 1130 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Irx1P81068 AC132467.2-202ENSMUST00000227726 559 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Irx1P81068 Aip-201ENSMUST00000025767 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Irx1P81068 Nradd-201ENSMUST00000035069 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Irx1P81068 Gm18262-201ENSMUST00000222560 1946 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Irx1P81068 Psmd9-201ENSMUST00000100729 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Irx1P81068 Pdzrn4-202ENSMUST00000169942 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Irx1P81068 Gm37849-201ENSMUST00000194722 1881 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Irx1P81068 Scd2-201ENSMUST00000026221 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Irx1P81068 Gm595-201ENSMUST00000114928 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Irx1P81068 Pcnt-202ENSMUST00000217838 9341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Irx1P81068 Prr18-202ENSMUST00000163887 3251 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Irx1P81068 Prex1-203ENSMUST00000109246 2386 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Irx1P81068 Acly-203ENSMUST00000107389 4426 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Irx1P81068 Klhl22-208ENSMUST00000165790 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Irx1P81068 Mecr-201ENSMUST00000030742 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Irx1P81068 Gm12766-201ENSMUST00000140298 1823 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Irx1P81068 Pkp1-201ENSMUST00000027667 4669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Irx1P81068 Ccdc88c-201ENSMUST00000068411 7542 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Irx1P81068 BC017643-201ENSMUST00000038709 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Irx1P81068 Cyb561d1-202ENSMUST00000106654 1914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Irx1P81068 Hoxc10-201ENSMUST00000001699 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Irx1P81068 Gm16793-201ENSMUST00000181322 1680 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Irx1P81068 Oxr1-203ENSMUST00000090096 4515 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Irx1P81068 Adck2-204ENSMUST00000140364 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Irx1P81068 Git1-201ENSMUST00000037285 3512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Irx1P81068 Epb41l5-201ENSMUST00000027632 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Irx1P81068 Trip13-201ENSMUST00000022053 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Irx1P81068 Armcx2-201ENSMUST00000035559 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Irx1P81068 2010315B03Rik-202ENSMUST00000177714 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Irx1P81068 Ppcs-202ENSMUST00000106316 954 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Irx1P81068 Pdpn-202ENSMUST00000119654 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
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