Protein–RNA interactions for Protein: P61087

Ube2k, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 K, mousemouse

Predictions only

Length 200 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ube2kP61087 Mcee-203ENSMUST00000206194 532 ntTSL 2 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Ube2kP61087 Atp6v0c-ps1-201ENSMUST00000206596 463 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
Ube2kP61087 Dkkl1-204ENSMUST00000210741 662 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Ube2kP61087 Aprt-209ENSMUST00000213062 560 ntTSL 2 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Ube2kP61087 Syce1l-201ENSMUST00000034219 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Ube2kP61087 6430531B16Rik-201ENSMUST00000097970 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Ube2kP61087 Rhog-202ENSMUST00000106923 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Ube2kP61087 Olfml3-201ENSMUST00000029440 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Ube2kP61087 Tm7sf2-203ENSMUST00000159084 1351 ntTSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Ube2kP61087 Adm-201ENSMUST00000033054 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Ube2kP61087 Lpar5-201ENSMUST00000088292 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Ube2kP61087 Egr1-202ENSMUST00000165033 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Ube2kP61087 Sgce-207ENSMUST00000126151 1522 ntTSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Ube2kP61087 Robo3-201ENSMUST00000034643 4712 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Ube2kP61087 Gm7324-201ENSMUST00000094051 1647 ntAPPRIS P1 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Ube2kP61087 Msh4-201ENSMUST00000005630 3325 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Ube2kP61087 Olfr707-203ENSMUST00000210644 1817 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Ube2kP61087 Nagk-202ENSMUST00000113850 1918 ntTSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Ube2kP61087 Timd2-201ENSMUST00000055102 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Ube2kP61087 Satb1-208ENSMUST00000144331 6243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Ube2kP61087 Samd4-202ENSMUST00000100672 4165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Ube2kP61087 Zfp12-203ENSMUST00000077485 4294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Ube2kP61087 Vezf1-201ENSMUST00000018521 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Ube2kP61087 Sstr5-201ENSMUST00000051864 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Ube2kP61087 Wscd1-201ENSMUST00000021168 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Ube2kP61087 Flcn-202ENSMUST00000091246 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Ube2kP61087 Gm5936-201ENSMUST00000114116 2857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Ube2kP61087 Gm5640-201ENSMUST00000114119 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Ube2kP61087 DXBay18-201ENSMUST00000080324 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Ube2kP61087 Gm14685-201ENSMUST00000088459 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Ube2kP61087 Itga4-201ENSMUST00000099972 9767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Ube2kP61087 Gm26857-201ENSMUST00000181580 3347 ntTSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Ube2kP61087 Ercc4-201ENSMUST00000023206 3480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Ube2kP61087 Slc39a6-201ENSMUST00000070726 3882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Ube2kP61087 Hcn1-201ENSMUST00000006991 14141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Ube2kP61087 Gm10392-201ENSMUST00000100807 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Ube2kP61087 Brwd3-202ENSMUST00000101283 1066 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Ube2kP61087 Spaca3-202ENSMUST00000103223 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Ube2kP61087 Gm22189-201ENSMUST00000103822 86 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
Ube2kP61087 Gnb2-202ENSMUST00000111020 1470 ntTSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Ube2kP61087 Rgs12-207ENSMUST00000114285 2924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Ube2kP61087 Ube2j2-206ENSMUST00000118192 922 ntTSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Ube2kP61087 Gm14057-201ENSMUST00000120631 482 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
Ube2kP61087 Slc12a8-206ENSMUST00000122427 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Ube2kP61087 1700001C02Rik-203ENSMUST00000127815 660 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Ube2kP61087 Crx-203ENSMUST00000172758 1469 ntTSL 3 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Ube2kP61087 Gm5354-201ENSMUST00000182417 973 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
Ube2kP61087 Rnf113a2-201ENSMUST00000183146 1383 ntAPPRIS P1 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Ube2kP61087 4930488N24Rik-201ENSMUST00000188802 1527 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
Ube2kP61087 Gm31326-201ENSMUST00000191856 1048 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
Ube2kP61087 Gpatch4-203ENSMUST00000193398 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Ube2kP61087 Gm19931-201ENSMUST00000198920 368 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
Ube2kP61087 Gm45195-201ENSMUST00000205597 1008 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
Ube2kP61087 2810047C21Rik1-202ENSMUST00000210322 1179 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Ube2kP61087 Gm39228-201ENSMUST00000212456 301 ntTSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Ube2kP61087 Trip13-201ENSMUST00000022053 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Ube2kP61087 Slc25a5-ps-202ENSMUST00000223716 1786 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
Ube2kP61087 Wdyhv1-203ENSMUST00000226889 394 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
Ube2kP61087 Pop4-201ENSMUST00000032585 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Ube2kP61087 Myo16-201ENSMUST00000042103 6725 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Ube2kP61087 Cited1-201ENSMUST00000050551 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Ube2kP61087 Sema4f-201ENSMUST00000000641 4086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Ube2kP61087 Dnajc30-201ENSMUST00000071263 1661 ntAPPRIS P1 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Ube2kP61087 Immp2l-201ENSMUST00000080160 239 ntTSL 3 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Ube2kP61087 Tcea1-201ENSMUST00000081551 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Ube2kP61087 Ecsit-201ENSMUST00000098937 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Ube2kP61087 Asap3-201ENSMUST00000047526 4225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Ube2kP61087 Gm21982-201ENSMUST00000146232 3821 ntTSL 2 BASIC10.71□□□□□ -0.7
Ube2kP61087 Prkd1-201ENSMUST00000002765 3653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Ube2kP61087 Cyth1-204ENSMUST00000106305 3179 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Ube2kP61087 Pak1-201ENSMUST00000033040 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Ube2kP61087 Acer1-201ENSMUST00000056113 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ube2kP61087 Cep128-210ENSMUST00000141429 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ube2kP61087 Fen1-201ENSMUST00000025651 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ube2kP61087 Smad4-202ENSMUST00000114939 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ube2kP61087 Gm38569-201ENSMUST00000205476 2228 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ube2kP61087 Stat3-202ENSMUST00000103114 6042 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ube2kP61087 Ctsl-201ENSMUST00000021933 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ube2kP61087 Slc29a1-203ENSMUST00000097317 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ube2kP61087 Tmem237-202ENSMUST00000094917 1869 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ube2kP61087 Vps36-201ENSMUST00000033866 3574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ube2kP61087 Ccng1-201ENSMUST00000020576 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ube2kP61087 Fosb-203ENSMUST00000207716 3546 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ube2kP61087 Krt35-201ENSMUST00000103127 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ube2kP61087 Neil1-203ENSMUST00000190245 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ube2kP61087 Trnt1-204ENSMUST00000113249 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ube2kP61087 Slc20a1-202ENSMUST00000110315 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ube2kP61087 C130050O18Rik-201ENSMUST00000052176 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ube2kP61087 Sh3bp5l-201ENSMUST00000073128 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ube2kP61087 Tspan32-205ENSMUST00000105924 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ube2kP61087 Gm3365-201ENSMUST00000216296 1480 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Ube2kP61087 Brinp2-201ENSMUST00000004133 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ube2kP61087 Fhad1-201ENSMUST00000036701 1366 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ube2kP61087 Psap-201ENSMUST00000004316 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ube2kP61087 Prdm1-201ENSMUST00000039174 5281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ube2kP61087 Prcd-202ENSMUST00000116318 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ube2kP61087 Gm15376-201ENSMUST00000122258 783 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Ube2kP61087 1700045H11Rik-201ENSMUST00000128056 593 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ube2kP61087 Vps53-204ENSMUST00000129256 650 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ube2kP61087 Pam16-201ENSMUST00000014445 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.4 ms