Protein–RNA interactions for Protein: P56203

Ctsw, Cathepsin W, mousemouse

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Length 371 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CtswP56203 Bcas1os1-201ENSMUST00000133586 1239 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
CtswP56203 Pagr1b-201ENSMUST00000172958 693 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
CtswP56203 Gm45184-201ENSMUST00000206354 955 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
CtswP56203 Ppcdc-207ENSMUST00000214339 738 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
CtswP56203 Tpd52l1-205ENSMUST00000215515 857 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
CtswP56203 Timm9-203ENSMUST00000220482 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
CtswP56203 Olfr524-201ENSMUST00000051943 1058 ntAPPRIS P1 BASIC13.15□□□□□ -0.3
CtswP56203 Mrps21-201ENSMUST00000067298 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
CtswP56203 Dnal4-202ENSMUST00000069877 1011 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
CtswP56203 D730001G18Rik-202ENSMUST00000191407 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
CtswP56203 Casc4-202ENSMUST00000089912 3602 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
CtswP56203 Sh3bp5l-202ENSMUST00000116376 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
CtswP56203 Sema6c-202ENSMUST00000090823 4029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
CtswP56203 Uhrf1bp1l-201ENSMUST00000020112 6448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
CtswP56203 Pla2g6-201ENSMUST00000047816 2963 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
CtswP56203 Oxa1l-201ENSMUST00000000985 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
CtswP56203 Chodl-202ENSMUST00000069148 2051 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
CtswP56203 Parp10-202ENSMUST00000165738 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
CtswP56203 Syt2-204ENSMUST00000188842 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
CtswP56203 Stag1-206ENSMUST00000129269 6186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
CtswP56203 Gm29253-201ENSMUST00000185727 5231 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
CtswP56203 Mrpl55-203ENSMUST00000108785 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
CtswP56203 Olfr239-201ENSMUST00000112165 948 ntAPPRIS P1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
CtswP56203 Gm12058-201ENSMUST00000118614 437 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
CtswP56203 Gm13297-201ENSMUST00000120205 934 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
CtswP56203 Gm13342-201ENSMUST00000121055 207 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
CtswP56203 Gm11597-201ENSMUST00000121423 964 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
CtswP56203 Usp46os2-201ENSMUST00000152787 831 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
CtswP56203 C130026I21Rik-205ENSMUST00000161267 652 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
CtswP56203 H2afz-206ENSMUST00000173790 437 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
CtswP56203 Gm27017-201ENSMUST00000183031 656 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
CtswP56203 Gm28085-201ENSMUST00000189281 1137 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
CtswP56203 Gm19710-201ENSMUST00000200257 640 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
CtswP56203 Gm45720-201ENSMUST00000211881 484 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
CtswP56203 BC055324-201ENSMUST00000045876 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
CtswP56203 Efemp2-209ENSMUST00000167371 1382 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
CtswP56203 Cpeb3-210ENSMUST00000136286 5260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
CtswP56203 Azi2-201ENSMUST00000044454 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
CtswP56203 Ccdc81-201ENSMUST00000041195 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
CtswP56203 BC025446-201ENSMUST00000055719 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
CtswP56203 Nrsn2-201ENSMUST00000079278 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
CtswP56203 C130012C08Rik-201ENSMUST00000194287 3665 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
CtswP56203 Sgo2a-201ENSMUST00000027202 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
CtswP56203 Jmjd8-201ENSMUST00000026832 2091 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
CtswP56203 Kcnj12-203ENSMUST00000108717 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
CtswP56203 5730409E04Rik-202ENSMUST00000164362 2855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
CtswP56203 Scara5-201ENSMUST00000022610 3794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
CtswP56203 Tshr-201ENSMUST00000021343 1339 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CtswP56203 Sec62-201ENSMUST00000029256 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CtswP56203 Gmppb-201ENSMUST00000047947 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CtswP56203 Gm37737-201ENSMUST00000195013 1638 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
CtswP56203 Zfpm2-201ENSMUST00000053467 4974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CtswP56203 Dgcr14-201ENSMUST00000003621 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CtswP56203 Setdb2-201ENSMUST00000095775 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
CtswP56203 Cadm2-202ENSMUST00000120594 3248 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
CtswP56203 Mrps30-201ENSMUST00000022245 3319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CtswP56203 Afap1l1-201ENSMUST00000120472 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CtswP56203 Eif4enif1-202ENSMUST00000110048 3712 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
CtswP56203 Hif1a-201ENSMUST00000021530 4724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CtswP56203 Grin3a-201ENSMUST00000076674 7431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CtswP56203 Gm44579-201ENSMUST00000142443 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
CtswP56203 Ttc33-203ENSMUST00000118193 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CtswP56203 Gm38355-201ENSMUST00000192514 1570 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
CtswP56203 4930550L24Rik-201ENSMUST00000062542 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CtswP56203 Tnfrsf18-202ENSMUST00000103173 1189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CtswP56203 Tspan4-202ENSMUST00000117634 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CtswP56203 Serf1-203ENSMUST00000132053 516 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CtswP56203 Rmrp-201ENSMUST00000157463 271 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
CtswP56203 Gm8801-201ENSMUST00000173255 1064 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
CtswP56203 Gm9004-201ENSMUST00000218739 1222 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
CtswP56203 AL732506.1-201ENSMUST00000226420 281 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
CtswP56203 Morn2-202ENSMUST00000227729 656 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
CtswP56203 Lypd2-201ENSMUST00000023260 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CtswP56203 Nr0b2-201ENSMUST00000042706 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CtswP56203 Cryba4-201ENSMUST00000086629 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CtswP56203 Map6-205ENSMUST00000207883 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CtswP56203 Atg16l1-203ENSMUST00000113190 3102 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CtswP56203 Stx18-203ENSMUST00000114126 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CtswP56203 Smim14-205ENSMUST00000139122 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CtswP56203 Heg1-205ENSMUST00000152782 8161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
CtswP56203 Rab11a-208ENSMUST00000172298 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CtswP56203 Nrap-201ENSMUST00000040711 5334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CtswP56203 Smad4-202ENSMUST00000114939 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CtswP56203 A530020G20Rik-202ENSMUST00000181070 3660 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CtswP56203 Zbtb33-201ENSMUST00000049740 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CtswP56203 Mark2-215ENSMUST00000168872 2124 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
CtswP56203 Polr2a-202ENSMUST00000071213 5799 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
CtswP56203 Scarf1-201ENSMUST00000042808 2887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CtswP56203 Ildr1-202ENSMUST00000089618 2850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CtswP56203 Egr3-204ENSMUST00000225200 3940 ntAPPRIS P2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
CtswP56203 Gm9881-201ENSMUST00000068783 3205 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
CtswP56203 Tmem56-204ENSMUST00000135818 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CtswP56203 Gm4366-201ENSMUST00000201488 1342 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
CtswP56203 Yipf1-201ENSMUST00000075693 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CtswP56203 Hspa9-201ENSMUST00000025217 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CtswP56203 Dnaja2-201ENSMUST00000034138 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
CtswP56203 Usp53-202ENSMUST00000197314 3586 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
CtswP56203 Kdm2b-204ENSMUST00000118027 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
CtswP56203 Lypd1-202ENSMUST00000159417 6464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
CtswP56203 Ankrd13c-201ENSMUST00000040787 3903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
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