Protein–RNA interactions for Protein: P20033

Pdgfa, Platelet-derived growth factor subunit A, mousemouse

Predictions only

Length 211 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PdgfaP20033 Ush1c-206ENSMUST00000154292 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
PdgfaP20033 Ero1lb-201ENSMUST00000071973 4239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
PdgfaP20033 Gjb4-202ENSMUST00000106090 1446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
PdgfaP20033 Gjb4-201ENSMUST00000060419 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
PdgfaP20033 Spop-202ENSMUST00000107724 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
PdgfaP20033 Tmem115-201ENSMUST00000010189 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
PdgfaP20033 Nsun7-204ENSMUST00000202994 3632 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
PdgfaP20033 Gm26519-201ENSMUST00000181193 2249 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
PdgfaP20033 Wdcp-205ENSMUST00000220215 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
PdgfaP20033 Zfp142-203ENSMUST00000113737 7473 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
PdgfaP20033 Pla2g6-206ENSMUST00000173163 3018 ntTSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
PdgfaP20033 Ctgf-201ENSMUST00000020171 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
PdgfaP20033 BC055324-202ENSMUST00000097493 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
PdgfaP20033 Dach2-201ENSMUST00000067219 2520 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
PdgfaP20033 Kalrn-210ENSMUST00000114964 2693 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
PdgfaP20033 Orc2-201ENSMUST00000027198 3561 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
PdgfaP20033 Actn1-201ENSMUST00000021554 3734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
PdgfaP20033 Bcl2l15-202ENSMUST00000106822 1902 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
PdgfaP20033 Fam161a-203ENSMUST00000109557 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
PdgfaP20033 Sp7-201ENSMUST00000078508 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
PdgfaP20033 Yeats2-201ENSMUST00000090052 5997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
PdgfaP20033 Ppp1r9b-202ENSMUST00000107748 3095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
PdgfaP20033 Vmn1r198-202ENSMUST00000226786 6195 ntAPPRIS P2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
PdgfaP20033 Mzf1-205ENSMUST00000182515 3340 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
PdgfaP20033 Tcf4-230ENSMUST00000201205 2270 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
PdgfaP20033 Nudt1-203ENSMUST00000110825 599 ntTSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
PdgfaP20033 Gm13392-201ENSMUST00000117708 150 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
PdgfaP20033 Gm13226-201ENSMUST00000117838 404 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
PdgfaP20033 Gm15957-201ENSMUST00000118893 974 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
PdgfaP20033 Gm15821-201ENSMUST00000121995 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
PdgfaP20033 Gm12786-201ENSMUST00000129617 644 ntTSL 3 BASIC12.76□□□□□ -0.37
PdgfaP20033 Hoxa7-203ENSMUST00000140316 643 ntTSL 3 BASIC12.76□□□□□ -0.37
PdgfaP20033 Shisa5-203ENSMUST00000154184 1038 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
PdgfaP20033 Ercc1-203ENSMUST00000160369 1175 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
PdgfaP20033 1700122O11Rik-201ENSMUST00000178823 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
PdgfaP20033 Apoa5-203ENSMUST00000213878 727 ntTSL 3 BASIC12.76□□□□□ -0.37
PdgfaP20033 Duoxa1-201ENSMUST00000028653 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.76□□□□□ -0.37
PdgfaP20033 4933434E20Rik-202ENSMUST00000029552 1080 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
PdgfaP20033 Bst2-201ENSMUST00000051672 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
PdgfaP20033 Rufy2-203ENSMUST00000122231 2664 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
PdgfaP20033 Rfx6-204ENSMUST00000219364 2682 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
PdgfaP20033 Pxn-202ENSMUST00000086523 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
PdgfaP20033 Lcmt1-201ENSMUST00000033025 1369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
PdgfaP20033 Atp1b2-201ENSMUST00000047889 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
PdgfaP20033 Fhl2-202ENSMUST00000185893 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
PdgfaP20033 Clec4g-201ENSMUST00000058040 1441 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
PdgfaP20033 Utp23-203ENSMUST00000137116 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
PdgfaP20033 Cyp2ab1-205ENSMUST00000182741 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
PdgfaP20033 Eng-202ENSMUST00000113272 3021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
PdgfaP20033 Mrm3-201ENSMUST00000040577 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
PdgfaP20033 Lig1-201ENSMUST00000098814 3091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
PdgfaP20033 Gcom1-201ENSMUST00000163998 1726 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
PdgfaP20033 Plk-ps1-201ENSMUST00000119494 1787 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
PdgfaP20033 Rnps1-201ENSMUST00000088512 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
PdgfaP20033 Mrgprg-201ENSMUST00000058092 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
PdgfaP20033 Anxa8-201ENSMUST00000022519 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
PdgfaP20033 Uspl1-205ENSMUST00000121416 3792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
PdgfaP20033 Iffo2-202ENSMUST00000123827 2036 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
PdgfaP20033 Gm44758-201ENSMUST00000206096 2068 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
PdgfaP20033 Pde4d-220ENSMUST00000177907 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
PdgfaP20033 1200007C13Rik-201ENSMUST00000143649 2455 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
PdgfaP20033 Gm26588-202ENSMUST00000181355 2538 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
PdgfaP20033 Cpped1-203ENSMUST00000121750 2614 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
PdgfaP20033 Mfsd9-201ENSMUST00000039672 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
PdgfaP20033 Dpysl5-202ENSMUST00000101442 1309 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
PdgfaP20033 Rtn4rl1-201ENSMUST00000102514 3525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
PdgfaP20033 Arhgap11a-201ENSMUST00000102545 4958 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
PdgfaP20033 Ypel3-203ENSMUST00000106357 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
PdgfaP20033 Ccnc-203ENSMUST00000108240 1406 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
PdgfaP20033 Vps4b-202ENSMUST00000112736 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
PdgfaP20033 Grm4-202ENSMUST00000118489 2976 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
PdgfaP20033 Sgce-207ENSMUST00000126151 1522 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
PdgfaP20033 Sidt1-205ENSMUST00000136381 4404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
PdgfaP20033 Snhg9-201ENSMUST00000161706 183 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
PdgfaP20033 Sdc4-201ENSMUST00000017153 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
PdgfaP20033 A930007I19Rik-203ENSMUST00000181726 2099 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
PdgfaP20033 Hist1h3h-201ENSMUST00000188775 411 ntAPPRIS P1 BASIC12.75□□□□□ -0.37
PdgfaP20033 Hist1h3i-201ENSMUST00000189457 411 ntAPPRIS P1 BASIC12.75□□□□□ -0.37
PdgfaP20033 Neil1-203ENSMUST00000190245 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
PdgfaP20033 Lims1-202ENSMUST00000020078 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
PdgfaP20033 Samd11-204ENSMUST00000218788 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
PdgfaP20033 AC155258.1-201ENSMUST00000219303 253 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
PdgfaP20033 Gm17794-201ENSMUST00000220252 955 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
PdgfaP20033 Ush1c-209ENSMUST00000222454 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
PdgfaP20033 AC140451.2-201ENSMUST00000228030 664 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
PdgfaP20033 Tulp2-201ENSMUST00000024233 1749 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
PdgfaP20033 Kcnt1-201ENSMUST00000037580 5881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
PdgfaP20033 Tmc4-201ENSMUST00000038743 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
PdgfaP20033 Shc1-201ENSMUST00000039110 3250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
PdgfaP20033 Lrrc3-201ENSMUST00000057608 4296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
PdgfaP20033 Il2rb-201ENSMUST00000089398 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
PdgfaP20033 Rbms2-201ENSMUST00000092033 1481 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
PdgfaP20033 Nt5c3b-202ENSMUST00000092689 1344 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
PdgfaP20033 Zbtb7b-201ENSMUST00000029677 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
PdgfaP20033 Gtf2ird1-202ENSMUST00000074114 3330 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
PdgfaP20033 Cchcr1-205ENSMUST00000173903 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
PdgfaP20033 Bcl11a-201ENSMUST00000000881 3061 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
PdgfaP20033 Tinf2-201ENSMUST00000007733 2956 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
PdgfaP20033 Zfp64-203ENSMUST00000109162 2848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
PdgfaP20033 Lrrfip1-204ENSMUST00000097650 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
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