Protein–RNA interactions for Protein: P18533

Ig heavy chain V region 733, mousemouse

Predictions only

Length 117 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P18533 AC125209.1-201ENSMUST00000225812 766 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
P18533 Mlana-201ENSMUST00000025719 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
P18533 Gm10478-201ENSMUST00000084451 396 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
P18533 Sertad1-201ENSMUST00000008528 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
P18533 Stim1-201ENSMUST00000033289 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
P18533 Gm3756-201ENSMUST00000169182 1355 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
P18533 Ak4-201ENSMUST00000102780 4186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
P18533 D730001G18Rik-202ENSMUST00000191407 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
P18533 Dio1-201ENSMUST00000082426 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
P18533 Tspan32-202ENSMUST00000075172 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
P18533 Gm2237-202ENSMUST00000170694 2090 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
P18533 Fam198a-202ENSMUST00000213773 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
P18533 Cwc27-201ENSMUST00000022228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
P18533 St6galnac6-202ENSMUST00000081879 2345 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
P18533 Mid1-215ENSMUST00000171433 2546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
P18533 Dync1i1-204ENSMUST00000115559 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
P18533 Casc4-202ENSMUST00000089912 3602 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
P18533 Rhot1-204ENSMUST00000092857 3687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
P18533 Zbtb7b-201ENSMUST00000029677 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
P18533 Fbxo41-201ENSMUST00000159062 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
P18533 Ubtf-203ENSMUST00000107115 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
P18533 Ddx10-201ENSMUST00000065630 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
P18533 Gm39822-201ENSMUST00000212253 2284 ntTSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
P18533 Irak1-203ENSMUST00000101458 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
P18533 4930588K23Rik-201ENSMUST00000156827 1963 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
P18533 Gm26531-201ENSMUST00000181727 1967 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
P18533 Lsp1-201ENSMUST00000018963 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
P18533 Pik3cd-214ENSMUST00000177654 4765 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
P18533 Setdb1-203ENSMUST00000107171 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
P18533 2610507B11Rik-201ENSMUST00000010421 7443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
P18533 Jph2-201ENSMUST00000017961 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
P18533 Cnmd-203ENSMUST00000165835 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
P18533 Gm4366-201ENSMUST00000201488 1342 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
P18533 Rps13-203ENSMUST00000205490 1317 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
P18533 Spata3-202ENSMUST00000113344 1047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
P18533 Mospd4-201ENSMUST00000180618 576 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
P18533 Gm26602-201ENSMUST00000181321 285 ntAPPRIS P1 BASIC11.98□□□□□ -0.49
P18533 Gm27017-201ENSMUST00000183031 656 ntTSL 3 BASIC11.98□□□□□ -0.49
P18533 Gm39404-201ENSMUST00000216350 313 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
P18533 Gm7046-201ENSMUST00000221351 977 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
P18533 Rad23b-201ENSMUST00000030134 3810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
P18533 Cldnd2-201ENSMUST00000040227 664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
P18533 Khdrbs2-205ENSMUST00000189878 3259 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
P18533 Pqlc2-202ENSMUST00000105801 2756 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.98□□□□□ -0.49
P18533 Dync1li1-201ENSMUST00000047404 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
P18533 Dhx30-201ENSMUST00000062368 3806 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
P18533 Gm2420-201ENSMUST00000119864 2149 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
P18533 Ripor2-201ENSMUST00000038477 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
P18533 Nfatc4-201ENSMUST00000024179 3267 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
P18533 AC126262.1-201ENSMUST00000221802 1904 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
P18533 Reep2-201ENSMUST00000043484 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
P18533 Aaas-201ENSMUST00000041208 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
P18533 Slc26a5-201ENSMUST00000030878 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
P18533 Ddx39b-202ENSMUST00000172549 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
P18533 Egr3-204ENSMUST00000225200 3940 ntAPPRIS P2 BASIC11.97□□□□□ -0.49
P18533 5430400D12Rik-201ENSMUST00000181717 1690 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
P18533 Dnm2-206ENSMUST00000172482 2613 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
P18533 Ipo13-201ENSMUST00000036156 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
P18533 Etv3-202ENSMUST00000119109 5309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
P18533 Setd3-202ENSMUST00000109879 2387 ntTSL 3 BASIC11.97□□□□□ -0.49
P18533 Gcfc2-201ENSMUST00000043195 4192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
P18533 Efemp2-209ENSMUST00000167371 1382 ntTSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
P18533 Phyhd1-202ENSMUST00000091132 1353 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
P18533 Yipf1-201ENSMUST00000075693 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
P18533 Tnfrsf18-202ENSMUST00000103173 1189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
P18533 Gm13562-201ENSMUST00000125198 797 ntTSL 2 BASIC11.97□□□□□ -0.49
P18533 Gm833-201ENSMUST00000143133 884 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
P18533 Gm14285-201ENSMUST00000146049 380 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
P18533 Usp46os2-201ENSMUST00000152787 831 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
P18533 Atp6v0e-201ENSMUST00000015719 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
P18533 Men1-210ENSMUST00000166909 295 ntTSL 3 BASIC11.97□□□□□ -0.49
P18533 Gm38293-201ENSMUST00000193209 600 ntTSL 2 BASIC11.97□□□□□ -0.49
P18533 Gm42627-201ENSMUST00000197347 224 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
P18533 AC158605.1-202ENSMUST00000217860 540 ntTSL 2 BASIC11.97□□□□□ -0.49
P18533 Trem3-201ENSMUST00000048065 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
P18533 Cryba4-201ENSMUST00000086629 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
P18533 Gm44758-201ENSMUST00000206096 2068 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
P18533 Prpf40a-206ENSMUST00000209364 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
P18533 Fosb-207ENSMUST00000208505 3523 ntTSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
P18533 C1qtnf9-201ENSMUST00000025940 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
P18533 Nsmce2-202ENSMUST00000168722 2679 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
P18533 Phldb1-212ENSMUST00000138356 5600 ntTSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
P18533 Tcf4-250ENSMUST00000202458 2610 ntTSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
P18533 Brf2-201ENSMUST00000033877 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
P18533 Sec62-201ENSMUST00000029256 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
P18533 Btaf1-201ENSMUST00000099494 7204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
P18533 Ahctf1-201ENSMUST00000027768 8506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
P18533 Scyl2-201ENSMUST00000092227 3566 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
P18533 Kcnn2-205ENSMUST00000183850 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
P18533 Zfp369-203ENSMUST00000130799 1580 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
P18533 Gm14243-201ENSMUST00000131401 2172 ntTSL 2 BASIC11.96□□□□□ -0.49
P18533 Ntrk2-208ENSMUST00000225583 2719 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
P18533 Cdh11-201ENSMUST00000075190 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
P18533 Ahsg-201ENSMUST00000023583 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
P18533 Pik3cd-204ENSMUST00000105690 4921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
P18533 Gmppb-201ENSMUST00000047947 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
P18533 Sh3bp2-202ENSMUST00000101316 3031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
P18533 Lrrc57-203ENSMUST00000102498 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
P18533 Acap1-201ENSMUST00000001631 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
P18533 Gm44089-201ENSMUST00000203624 1930 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.4 ms