Protein–RNA interactions for Protein: P10284

Hoxb4, Homeobox protein Hox-B4, mousemouse

Predictions only

Length 250 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxb4P10284 Prn-201ENSMUST00000124100 2132 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Hoxb4P10284 Cds1-201ENSMUST00000031273 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Hoxb4P10284 Parm1-201ENSMUST00000040576 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Hoxb4P10284 Acp6-201ENSMUST00000090759 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Hoxb4P10284 Gli1-201ENSMUST00000026474 4057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Hoxb4P10284 AC159308.2-201ENSMUST00000213592 2325 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Hoxb4P10284 Rsrc1-206ENSMUST00000162036 1406 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Hoxb4P10284 Slc18b1-206ENSMUST00000179321 2843 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Hoxb4P10284 Dio1-201ENSMUST00000082426 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Hoxb4P10284 Zfp639-205ENSMUST00000193287 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Hoxb4P10284 Smg9-201ENSMUST00000002280 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Hoxb4P10284 Bhmt2-201ENSMUST00000015941 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Hoxb4P10284 Gm10457-201ENSMUST00000222619 1906 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Hoxb4P10284 Dnase1l1-201ENSMUST00000019232 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Hoxb4P10284 Ccnj-203ENSMUST00000120057 3783 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Hoxb4P10284 Pycr1-201ENSMUST00000026133 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Hoxb4P10284 Ccer1-201ENSMUST00000060703 1865 ntAPPRIS P1 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Hoxb4P10284 Scamp1-201ENSMUST00000022197 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Hoxb4P10284 Fndc3a-201ENSMUST00000089017 6143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Hoxb4P10284 Lpcat1-208ENSMUST00000223060 2141 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Hoxb4P10284 Il12a-201ENSMUST00000029345 1303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Hoxb4P10284 Art3-201ENSMUST00000113083 1561 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Hoxb4P10284 Rassf5-203ENSMUST00000112442 3388 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Hoxb4P10284 Usp53-201ENSMUST00000090379 6185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Hoxb4P10284 Slc35a2-202ENSMUST00000115660 3094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Hoxb4P10284 Cldn34d-201ENSMUST00000114054 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Hoxb4P10284 Gm13035-201ENSMUST00000117496 342 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Hoxb4P10284 Gm12380-201ENSMUST00000119012 544 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Hoxb4P10284 Gm14746-201ENSMUST00000120309 741 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Hoxb4P10284 Gm5257-201ENSMUST00000121823 790 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Hoxb4P10284 Gm11948-201ENSMUST00000142322 539 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Hoxb4P10284 Nop16-202ENSMUST00000148222 790 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Hoxb4P10284 D630008O14Rik-202ENSMUST00000149909 1043 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Hoxb4P10284 Parvaos-201ENSMUST00000154848 1285 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Hoxb4P10284 Ptges3-ps-201ENSMUST00000160012 480 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Hoxb4P10284 U2af1l4-215ENSMUST00000166257 546 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Hoxb4P10284 Gm4540-201ENSMUST00000170669 429 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Hoxb4P10284 Odaph-201ENSMUST00000178614 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Hoxb4P10284 Gm28011-201ENSMUST00000184097 175 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Hoxb4P10284 BB187690-201ENSMUST00000198619 1176 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Hoxb4P10284 Gm44759-201ENSMUST00000206057 430 ntTSL 3 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Hoxb4P10284 Rps2-ps12-201ENSMUST00000214262 785 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Hoxb4P10284 Gm32025-201ENSMUST00000217960 307 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Hoxb4P10284 1110019B22Rik-202ENSMUST00000218396 989 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Hoxb4P10284 Majin-201ENSMUST00000025699 1239 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Hoxb4P10284 Neil1-201ENSMUST00000034842 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Hoxb4P10284 Ssxb1-201ENSMUST00000037297 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Hoxb4P10284 Bcdin3d-201ENSMUST00000040313 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Hoxb4P10284 4930564D02Rik-201ENSMUST00000070584 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Hoxb4P10284 Gm10770-201ENSMUST00000099418 714 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Hoxb4P10284 Tssk5-201ENSMUST00000071119 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Hoxb4P10284 Mastl-201ENSMUST00000028119 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Hoxb4P10284 Adck5-214ENSMUST00000162503 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Hoxb4P10284 Ubxn11-201ENSMUST00000070246 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Hoxb4P10284 Pgd-201ENSMUST00000084124 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Hoxb4P10284 Gm14132-201ENSMUST00000117188 1719 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Hoxb4P10284 Dda1-206ENSMUST00000138892 1738 ntTSL 3 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Hoxb4P10284 Pdia2-201ENSMUST00000039113 1721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Hoxb4P10284 Spert-204ENSMUST00000169658 1474 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Hoxb4P10284 Olfr987-203ENSMUST00000216347 1453 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Hoxb4P10284 Acot7-202ENSMUST00000075363 1457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Hoxb4P10284 Adcy1-201ENSMUST00000020706 12259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Hoxb4P10284 Chmp4c-201ENSMUST00000029049 6188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Hoxb4P10284 Ash2l-201ENSMUST00000068892 3307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Hoxb4P10284 Nrxn1-209ENSMUST00000161402 4953 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Hoxb4P10284 Lurap1l-201ENSMUST00000055922 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Hoxb4P10284 Tomm70a-201ENSMUST00000166897 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Hoxb4P10284 Lims2-201ENSMUST00000025254 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Hoxb4P10284 Zfp839-201ENSMUST00000170060 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Hoxb4P10284 Ece2-204ENSMUST00000133344 3042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Hoxb4P10284 Pdlim3-201ENSMUST00000034053 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Hoxb4P10284 Sema3b-201ENSMUST00000073448 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Hoxb4P10284 Ppp1r1b-206ENSMUST00000150762 1801 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Hoxb4P10284 Eif2a-201ENSMUST00000029387 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Hoxb4P10284 Mdfic-203ENSMUST00000125326 3635 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Hoxb4P10284 Nr2e3-201ENSMUST00000034831 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Hoxb4P10284 Pcdha2-201ENSMUST00000115662 5361 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Hoxb4P10284 Gm11696-203ENSMUST00000188296 1793 ntTSL 3 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Hoxb4P10284 Gm44562-201ENSMUST00000207194 1347 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Hoxb4P10284 Sln-201ENSMUST00000048485 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Hoxb4P10284 Scaf4-201ENSMUST00000039280 4165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Hoxb4P10284 Aqp11-205ENSMUST00000206389 3737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Hoxb4P10284 7420426K07Rik-201ENSMUST00000098460 1504 ntAPPRIS P1 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Hoxb4P10284 Tagln2-201ENSMUST00000111228 716 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Hoxb4P10284 Gm12899-201ENSMUST00000120565 551 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Hoxb4P10284 Gm6039-201ENSMUST00000121667 1250 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Hoxb4P10284 Mup-ps15-201ENSMUST00000121741 539 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Hoxb4P10284 Gm11728-201ENSMUST00000150628 660 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Hoxb4P10284 Gm11655-201ENSMUST00000153899 765 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Hoxb4P10284 Gm25043-201ENSMUST00000158604 212 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Hoxb4P10284 Vmn1r139-201ENSMUST00000169730 894 ntAPPRIS P1 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Hoxb4P10284 Vmn1r112-201ENSMUST00000174538 894 ntAPPRIS P1 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Hoxb4P10284 Vmn1r157-201ENSMUST00000178215 894 ntAPPRIS P1 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Hoxb4P10284 Rwdd2a-202ENSMUST00000179212 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Hoxb4P10284 Ank3-234ENSMUST00000182993 1233 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Hoxb4P10284 Mir7076-201ENSMUST00000183519 74 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Hoxb4P10284 1190007I07Rik-205ENSMUST00000185168 469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Hoxb4P10284 Gm37026-201ENSMUST00000191917 535 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Hoxb4P10284 Gm36997-201ENSMUST00000195090 707 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Hoxb4P10284 Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50 ms