Protein–RNA interactions for Protein: P09225

Lta, Lymphotoxin-alpha, mousemouse

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Length 202 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LtaP09225 Brd3-202ENSMUST00000077737 5272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
LtaP09225 Hectd2-208ENSMUST00000169036 3842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
LtaP09225 Gns-201ENSMUST00000040344 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
LtaP09225 Dcaf11-204ENSMUST00000121622 2379 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
LtaP09225 Mtch2-211ENSMUST00000150232 2377 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
LtaP09225 Gm44401-201ENSMUST00000204462 2375 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
LtaP09225 Tcf4-204ENSMUST00000114978 2437 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
LtaP09225 Usp24-204ENSMUST00000165709 10594 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
LtaP09225 Mknk1-201ENSMUST00000019677 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
LtaP09225 Urgcp-203ENSMUST00000118076 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
LtaP09225 Cacnb4-206ENSMUST00000178799 7981 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
LtaP09225 Sdad1-201ENSMUST00000031364 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
LtaP09225 Ebf1-202ENSMUST00000101326 3422 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
LtaP09225 Grid1-201ENSMUST00000043349 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
LtaP09225 Gm13392-201ENSMUST00000117708 150 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
LtaP09225 A330102I10Rik-202ENSMUST00000140415 682 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
LtaP09225 Gm12167-201ENSMUST00000148132 578 ntTSL 2 BASIC10.46□□□□□ -0.73
LtaP09225 Gm16191-202ENSMUST00000148464 484 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
LtaP09225 Ablim2-213ENSMUST00000150146 415 ntTSL 2 BASIC10.46□□□□□ -0.73
LtaP09225 Egfl7-211ENSMUST00000152988 723 ntTSL 2 BASIC10.46□□□□□ -0.73
LtaP09225 Mir1938-201ENSMUST00000158746 100 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
LtaP09225 Gm23363-201ENSMUST00000175024 79 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
LtaP09225 1700037C18Rik-205ENSMUST00000177323 915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
LtaP09225 1190007I07Rik-205ENSMUST00000185168 469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.46□□□□□ -0.73
LtaP09225 Gm43630-201ENSMUST00000201550 776 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
LtaP09225 AC110091.3-202ENSMUST00000217104 791 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
LtaP09225 AC160029.2-201ENSMUST00000218285 548 ntTSL 3 BASIC10.46□□□□□ -0.73
LtaP09225 Lim2-201ENSMUST00000004732 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
LtaP09225 Otos-201ENSMUST00000053144 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
LtaP09225 Vmn1r213-201ENSMUST00000076897 1155 ntAPPRIS P2 BASIC10.46□□□□□ -0.73
LtaP09225 Sdf4-202ENSMUST00000097734 973 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
LtaP09225 Olfr521-201ENSMUST00000098263 967 ntAPPRIS P1 BASIC10.46□□□□□ -0.73
LtaP09225 Mirg-202ENSMUST00000181543 1300 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
LtaP09225 Six4-202ENSMUST00000175693 6817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
LtaP09225 Olfr649-202ENSMUST00000106859 1382 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.46□□□□□ -0.74
LtaP09225 Srp54a-202ENSMUST00000220578 4498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
LtaP09225 Kdm4b-201ENSMUST00000025036 4577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
LtaP09225 Mtnr1a-201ENSMUST00000067984 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
LtaP09225 Lcor-201ENSMUST00000067795 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
LtaP09225 Pole3-201ENSMUST00000030091 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
LtaP09225 Dnmt3a-201ENSMUST00000020991 9685 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
LtaP09225 Myc-205ENSMUST00000161976 2338 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
LtaP09225 Myc-201ENSMUST00000022971 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
LtaP09225 Tfb2m-201ENSMUST00000027769 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
LtaP09225 Misp-201ENSMUST00000046833 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
LtaP09225 Pla2g15-204ENSMUST00000212963 2578 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
LtaP09225 Vps29-208ENSMUST00000155671 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
LtaP09225 Gm20683-201ENSMUST00000176751 2790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
LtaP09225 Gm3693-201ENSMUST00000182077 2865 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
LtaP09225 Prpf38b-201ENSMUST00000029480 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
LtaP09225 Rgs12-201ENSMUST00000030984 5472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
LtaP09225 Fyttd1-201ENSMUST00000023489 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
LtaP09225 Lgals12-202ENSMUST00000099729 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
LtaP09225 Gpc2-205ENSMUST00000161827 2586 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
LtaP09225 Gm27196-201ENSMUST00000184787 2582 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
LtaP09225 Armc7-201ENSMUST00000035240 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
LtaP09225 Gm7002-201ENSMUST00000221386 2165 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
LtaP09225 Plxnb2-201ENSMUST00000060808 6394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
LtaP09225 Ahcyl2-205ENSMUST00000125911 2039 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
LtaP09225 Def8-203ENSMUST00000093049 1909 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
LtaP09225 4930444K16Rik-201ENSMUST00000220438 1767 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
LtaP09225 Trappc2l-201ENSMUST00000015157 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
LtaP09225 Gm38157-201ENSMUST00000194178 1698 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
LtaP09225 Rabggtb-201ENSMUST00000089950 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
LtaP09225 2310026I22Rik-201ENSMUST00000180941 1300 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
LtaP09225 Gm8793-201ENSMUST00000183069 1303 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
LtaP09225 Gm23931-201ENSMUST00000103842 109 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
LtaP09225 Rpl19-ps12-201ENSMUST00000121251 591 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
LtaP09225 Gm12291-201ENSMUST00000121627 311 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
LtaP09225 Mtmr2-209ENSMUST00000156801 617 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
LtaP09225 Cabp2-201ENSMUST00000159148 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
LtaP09225 Hmga2-203ENSMUST00000159699 3810 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
LtaP09225 U2af1l4-215ENSMUST00000166257 546 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
LtaP09225 Gm18584-201ENSMUST00000203098 964 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
LtaP09225 AC138604.1-201ENSMUST00000226969 739 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
LtaP09225 Rpl18a-201ENSMUST00000054220 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
LtaP09225 Krtap19-2-201ENSMUST00000076186 605 ntAPPRIS P1 BASIC10.45□□□□□ -0.74
LtaP09225 A530020G20Rik-202ENSMUST00000181070 3660 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
LtaP09225 Zscan29-205ENSMUST00000163766 3611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
LtaP09225 Runx1-201ENSMUST00000023673 5861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
LtaP09225 Map6-201ENSMUST00000068973 3430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
LtaP09225 Asxl1-205ENSMUST00000227428 6981 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
LtaP09225 Pfkfb3-220ENSMUST00000192949 4801 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
LtaP09225 Pcdhb22-202ENSMUST00000192409 6609 ntAPPRIS P1 BASIC10.45□□□□□ -0.74
LtaP09225 Set-202ENSMUST00000102866 2824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
LtaP09225 Ncaph-201ENSMUST00000110387 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
LtaP09225 Gm42480-201ENSMUST00000198434 2595 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
LtaP09225 Ssh1-202ENSMUST00000112298 5584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
LtaP09225 Zbtb7b-201ENSMUST00000029677 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
LtaP09225 Lingo1-202ENSMUST00000114247 2287 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
LtaP09225 Arl4a-205ENSMUST00000146905 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
LtaP09225 Fbxw7-201ENSMUST00000029727 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
LtaP09225 Slc34a3-201ENSMUST00000006638 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
LtaP09225 Fn1-216ENSMUST00000189821 7410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
LtaP09225 CT009713.10-201ENSMUST00000225013 1986 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
LtaP09225 4933417C20Rik-201ENSMUST00000193962 1874 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
LtaP09225 Ccrl2-203ENSMUST00000199839 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
LtaP09225 Rdh19-201ENSMUST00000077530 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
LtaP09225 Th-201ENSMUST00000000219 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
LtaP09225 Aamp-202ENSMUST00000178235 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.3 ms