Protein–RNA interactions for Protein: O54941

Smarce1, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily E member 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 411 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smarce1O54941 4933417C20Rik-201ENSMUST00000193962 1874 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
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Smarce1O54941 Mgme1-202ENSMUST00000110027 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Smarce1O54941 Col14a1-202ENSMUST00000110217 6457 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Smarce1O54941 Jarid2-201ENSMUST00000044608 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Smarce1O54941 Krt40-201ENSMUST00000074253 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Smarce1O54941 Ccdc94-201ENSMUST00000086869 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Smarce1O54941 Irf8-201ENSMUST00000047737 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Smarce1O54941 Gorasp1-201ENSMUST00000035099 3906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Smarce1O54941 Gm26905-201ENSMUST00000180798 6621 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Smarce1O54941 Fbn1-202ENSMUST00000103234 11971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Smarce1O54941 Rxfp3-201ENSMUST00000058007 4275 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Smarce1O54941 Gm43858-201ENSMUST00000199418 1778 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Smarce1O54941 2610507I01Rik-201ENSMUST00000154354 1360 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Smarce1O54941 Gm12859-201ENSMUST00000117834 427 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Smarce1O54941 Gm14224-201ENSMUST00000147187 864 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Smarce1O54941 Rsf1os2-203ENSMUST00000155074 998 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Smarce1O54941 Mmgt2-207ENSMUST00000155759 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Smarce1O54941 Gm2495-201ENSMUST00000191160 466 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Smarce1O54941 H2-Bl-209ENSMUST00000194244 862 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Smarce1O54941 Aip-201ENSMUST00000025767 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Smarce1O54941 Mir339-201ENSMUST00000083659 96 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Smarce1O54941 Sgk3-202ENSMUST00000166384 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Smarce1O54941 Adora1-202ENSMUST00000086465 4968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Smarce1O54941 Ralgps2-209ENSMUST00000189316 2924 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Smarce1O54941 Npepps-215ENSMUST00000167806 2307 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Smarce1O54941 Sdad1-201ENSMUST00000031364 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Smarce1O54941 Gm9195-201ENSMUST00000208955 8870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Smarce1O54941 Tktl2-201ENSMUST00000002025 2021 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Smarce1O54941 Hps3-201ENSMUST00000012580 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Smarce1O54941 Usp10-210ENSMUST00000144458 3726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Smarce1O54941 Tbata-201ENSMUST00000035894 1506 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Smarce1O54941 Adprhl1-205ENSMUST00000204916 5228 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Smarce1O54941 Sectm1b-201ENSMUST00000039309 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Smarce1O54941 Spag8-202ENSMUST00000107870 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Smarce1O54941 Dsp-201ENSMUST00000124830 9592 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Smarce1O54941 Brf2-201ENSMUST00000033877 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Smarce1O54941 Adam32-201ENSMUST00000119720 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Smarce1O54941 Fbxw7-201ENSMUST00000029727 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Smarce1O54941 Cdc37l1-208ENSMUST00000225310 4079 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Smarce1O54941 Dnajb4-201ENSMUST00000029669 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Smarce1O54941 Ttc34-201ENSMUST00000050220 3200 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Smarce1O54941 Gm16564-201ENSMUST00000162545 3010 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Smarce1O54941 Rwdd2a-201ENSMUST00000034988 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Smarce1O54941 Sec11a-202ENSMUST00000117383 1094 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
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Smarce1O54941 Gm17634-201ENSMUST00000181383 1285 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Smarce1O54941 Kansl3-206ENSMUST00000187628 336 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
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Smarce1O54941 Fkbp7-201ENSMUST00000002809 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Smarce1O54941 Cd302-201ENSMUST00000028356 1257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Smarce1O54941 Txn1-201ENSMUST00000030051 1051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Smarce1O54941 Gm13199-201ENSMUST00000071016 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Smarce1O54941 H2afv-201ENSMUST00000093346 519 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
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Smarce1O54941 Riok1-201ENSMUST00000021866 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Smarce1O54941 Sgk3-201ENSMUST00000097826 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Smarce1O54941 Plekhd1-201ENSMUST00000140770 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Smarce1O54941 Nub1-202ENSMUST00000197407 3546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Smarce1O54941 Prrxl1-201ENSMUST00000068938 1610 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
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Smarce1O54941 Brdt-201ENSMUST00000031215 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
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Smarce1O54941 Vsx1-201ENSMUST00000046095 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Smarce1O54941 Pir-201ENSMUST00000033749 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Smarce1O54941 Galntl6-208ENSMUST00000204128 5680 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Smarce1O54941 Sirt2-202ENSMUST00000122915 1828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Smarce1O54941 Gm44758-201ENSMUST00000206096 2068 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Smarce1O54941 Abcd1-201ENSMUST00000002084 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Smarce1O54941 Dner-201ENSMUST00000049126 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Smarce1O54941 Fn1-213ENSMUST00000188674 7680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Smarce1O54941 Fn1-217ENSMUST00000190780 7694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Smarce1O54941 Abcd1-202ENSMUST00000114461 2323 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Smarce1O54941 Gm12132-201ENSMUST00000130945 1391 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Smarce1O54941 Eef1akmt4-201ENSMUST00000115522 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Smarce1O54941 Gm7488-201ENSMUST00000117148 684 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Smarce1O54941 Gm13834-201ENSMUST00000123757 137 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Smarce1O54941 P2rx4-204ENSMUST00000139631 1030 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Smarce1O54941 P2rx4-206ENSMUST00000142664 1111 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Smarce1O54941 Gm19184-201ENSMUST00000196798 928 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Smarce1O54941 AC155252.1-201ENSMUST00000226462 1208 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Smarce1O54941 Mbtd1-201ENSMUST00000063645 2138 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Smarce1O54941 Ccdc58-201ENSMUST00000099937 747 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Smarce1O54941 Pcdhac1-201ENSMUST00000007584 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Smarce1O54941 Sorcs1-206ENSMUST00000209783 3489 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Smarce1O54941 Zfp219-202ENSMUST00000166169 3017 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Smarce1O54941 Tfe3-205ENSMUST00000115678 2658 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Smarce1O54941 Eps15l1-203ENSMUST00000212121 2686 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Smarce1O54941 March7-203ENSMUST00000102748 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Smarce1O54941 CT009757.3-201ENSMUST00000223367 2320 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Smarce1O54941 St6galnac6-202ENSMUST00000081879 2345 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Smarce1O54941 Gm5780-201ENSMUST00000217774 1834 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Smarce1O54941 Rab31-201ENSMUST00000070673 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
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