Protein–RNA interactions for Protein: K7N6U2

Gm3542, Predicted gene 3542, mousemouse

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Length 270 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3542K7N6U2 Trib1-202ENSMUST00000118228 3081 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Gm3542K7N6U2 Rassf5-201ENSMUST00000027688 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Gm3542K7N6U2 Vwa8-201ENSMUST00000040990 7054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Gm3542K7N6U2 Fam83e-201ENSMUST00000129507 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Gm3542K7N6U2 Mbp-207ENSMUST00000114674 2108 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Gm3542K7N6U2 Rcsd1-202ENSMUST00000097474 5001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Gm3542K7N6U2 Ctsl-201ENSMUST00000021933 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Gm3542K7N6U2 Caprin2-202ENSMUST00000111569 3697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Gm3542K7N6U2 Dis3l-203ENSMUST00000120760 3661 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Gm3542K7N6U2 Wwox-201ENSMUST00000004756 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Gm3542K7N6U2 Smim14-205ENSMUST00000139122 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Gm3542K7N6U2 Tfap2a-202ENSMUST00000110193 2863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Gm3542K7N6U2 Pdgfc-201ENSMUST00000029652 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Gm3542K7N6U2 Adad1-203ENSMUST00000144629 3101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Gm3542K7N6U2 Atg16l1-201ENSMUST00000027512 3130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Gm3542K7N6U2 Spag1-201ENSMUST00000047348 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Gm3542K7N6U2 Tars2-202ENSMUST00000074339 2313 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Gm3542K7N6U2 Nrxn1-202ENSMUST00000072671 8118 ntTSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Gm3542K7N6U2 Mecom-206ENSMUST00000172694 4381 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Gm3542K7N6U2 Arhgap11a-203ENSMUST00000110948 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Gm3542K7N6U2 Eml3-201ENSMUST00000096241 3322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Gm3542K7N6U2 Tmsb10-201ENSMUST00000114048 623 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Gm3542K7N6U2 Gm13996-201ENSMUST00000118456 430 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
Gm3542K7N6U2 Rap1a-ps2-201ENSMUST00000118467 559 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
Gm3542K7N6U2 Gm9083-201ENSMUST00000120423 819 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
Gm3542K7N6U2 Rpsa-ps12-201ENSMUST00000120596 892 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
Gm3542K7N6U2 Cabp2-202ENSMUST00000159556 781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Gm3542K7N6U2 U2af1l4-206ENSMUST00000163654 781 ntTSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Gm3542K7N6U2 U2af1l4-221ENSMUST00000167361 860 ntTSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Gm3542K7N6U2 1700030M09Rik-202ENSMUST00000181679 964 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Gm3542K7N6U2 4930539M17Rik-201ENSMUST00000194792 846 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Gm3542K7N6U2 Gm43050-201ENSMUST00000201062 338 ntTSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Gm3542K7N6U2 Gm31224-201ENSMUST00000212682 513 ntTSL 3 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Gm3542K7N6U2 AC155813.1-201ENSMUST00000213224 590 ntTSL 3 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Gm3542K7N6U2 AC154222.2-201ENSMUST00000225848 607 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
Gm3542K7N6U2 Atp6v1g1-201ENSMUST00000035301 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Gm3542K7N6U2 Gnas-204ENSMUST00000087877 3947 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Gm3542K7N6U2 Esr1-204ENSMUST00000105590 6339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Gm3542K7N6U2 Tm9sf1-201ENSMUST00000002391 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Gm3542K7N6U2 Camk4-201ENSMUST00000042868 12331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Gm3542K7N6U2 Sphk2-201ENSMUST00000072836 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Gm3542K7N6U2 Prkca-201ENSMUST00000059595 8409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Gm3542K7N6U2 1810032O08Rik-201ENSMUST00000106378 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Gm3542K7N6U2 Gm36266-201ENSMUST00000196660 1749 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Gm3542K7N6U2 Smg5-201ENSMUST00000001451 4448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Gm3542K7N6U2 Ngly1-207ENSMUST00000224656 2329 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.65□□□□□ -0.39
Gm3542K7N6U2 Ptpn6-201ENSMUST00000004377 2308 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.39
Gm3542K7N6U2 Dmkn-205ENSMUST00000165887 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.39
Gm3542K7N6U2 Gngt2-201ENSMUST00000036088 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Gm3542K7N6U2 Lin54-208ENSMUST00000149714 3869 ntTSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Gm3542K7N6U2 Etl4-201ENSMUST00000045555 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Gm3542K7N6U2 Fam155a-201ENSMUST00000110969 3388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Gm3542K7N6U2 Crry-ps-201ENSMUST00000079090 1309 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
Gm3542K7N6U2 Trabd2b-201ENSMUST00000094894 6617 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Gm3542K7N6U2 Cabp7-201ENSMUST00000009219 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Gm3542K7N6U2 Pik3cd-205ENSMUST00000118704 4894 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Gm3542K7N6U2 Erg-203ENSMUST00000113848 2139 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Gm3542K7N6U2 4731419I09Rik-201ENSMUST00000180791 2820 ntTSL 2 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Gm3542K7N6U2 CT010488.1-201ENSMUST00000214890 1522 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Gm3542K7N6U2 Nup205-204ENSMUST00000201374 6411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Gm3542K7N6U2 Nfkb1-206ENSMUST00000164430 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Gm3542K7N6U2 Gm11851-201ENSMUST00000132219 692 ntTSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Gm3542K7N6U2 Hmgn1-202ENSMUST00000133885 261 ntTSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Gm3542K7N6U2 Gm14662-201ENSMUST00000145552 734 ntTSL 3 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Gm3542K7N6U2 Gm454-201ENSMUST00000160126 751 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Gm3542K7N6U2 Gstp1-201ENSMUST00000169613 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Gm3542K7N6U2 Brsk1-205ENSMUST00000206024 1216 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Gm3542K7N6U2 Fam168a-210ENSMUST00000216021 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Gm3542K7N6U2 AC153506.3-201ENSMUST00000219287 1029 ntTSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Gm3542K7N6U2 Spata24-201ENSMUST00000025209 701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Gm3542K7N6U2 2410015M20Rik-201ENSMUST00000052832 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Gm3542K7N6U2 Gm10312-201ENSMUST00000078515 489 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
Gm3542K7N6U2 Spata24-202ENSMUST00000096573 709 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Gm3542K7N6U2 Zfhx2os-202ENSMUST00000183750 4375 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Gm3542K7N6U2 Hrg-201ENSMUST00000023590 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Gm3542K7N6U2 Cnmd-203ENSMUST00000165835 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Gm3542K7N6U2 Gm29724-201ENSMUST00000214688 3062 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Gm3542K7N6U2 Tdg-208ENSMUST00000151390 3502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Gm3542K7N6U2 Qsox1-202ENSMUST00000111764 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Gm3542K7N6U2 Gm4864-201ENSMUST00000219894 1461 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
Gm3542K7N6U2 Clstn2-202ENSMUST00000162295 4174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Gm3542K7N6U2 Prkcq-201ENSMUST00000028118 3583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Gm3542K7N6U2 Egr2-203ENSMUST00000127820 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Gm3542K7N6U2 Tmem30a-201ENSMUST00000034878 3658 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Gm3542K7N6U2 Etfrf1-203ENSMUST00000111721 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Gm3542K7N6U2 Timp3-201ENSMUST00000020234 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Gm3542K7N6U2 Spock3-202ENSMUST00000117377 3066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Gm3542K7N6U2 Lime1-201ENSMUST00000048077 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Gm3542K7N6U2 Nup98-206ENSMUST00000211235 3748 ntTSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Gm3542K7N6U2 Ptp4a3-204ENSMUST00000167582 2640 ntTSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Gm3542K7N6U2 Gm38346-201ENSMUST00000192379 2639 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
Gm3542K7N6U2 Pcdhb18-201ENSMUST00000055949 5041 ntAPPRIS P1 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Gm3542K7N6U2 Nfatc4-201ENSMUST00000024179 3267 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Gm3542K7N6U2 Xrra1-201ENSMUST00000036155 2731 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Gm3542K7N6U2 Nr2c2-201ENSMUST00000113460 7647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Gm3542K7N6U2 Diaph3-202ENSMUST00000168889 4582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Gm3542K7N6U2 Diaph3-201ENSMUST00000022599 4582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Gm3542K7N6U2 Rasd2-202ENSMUST00000139848 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Gm3542K7N6U2 Fbxl5-211ENSMUST00000196483 2814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Gm3542K7N6U2 Prrxl1-202ENSMUST00000186452 2371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
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