Protein–RNA interactions for Protein: D3YXK1

Samd1, Atherin, mousemouse

Predictions only

Length 519 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Samd1D3YXK1 Cers6-201ENSMUST00000028426 7038 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Samd1D3YXK1 5430419D17Rik-201ENSMUST00000050586 2928 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Samd1D3YXK1 Urgcp-202ENSMUST00000093362 5089 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Samd1D3YXK1 Arhgap31-201ENSMUST00000023487 7964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Samd1D3YXK1 1110032A03Rik-201ENSMUST00000042468 2082 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Samd1D3YXK1 Nt5c3b-202ENSMUST00000092689 1344 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Samd1D3YXK1 Mon1b-202ENSMUST00000179926 3470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Samd1D3YXK1 Ttll12-201ENSMUST00000016901 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Samd1D3YXK1 Ino80c-204ENSMUST00000153360 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Samd1D3YXK1 Sirt3-201ENSMUST00000026559 1461 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Samd1D3YXK1 Acvr1c-201ENSMUST00000028178 9162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Samd1D3YXK1 AF529169-201ENSMUST00000044491 7202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Samd1D3YXK1 Per1-206ENSMUST00000166748 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Samd1D3YXK1 Synj2-202ENSMUST00000080283 4793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Samd1D3YXK1 Ccdc125-201ENSMUST00000057325 2413 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Samd1D3YXK1 Kdm4a-202ENSMUST00000097911 4550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Samd1D3YXK1 Insrr-201ENSMUST00000029711 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Samd1D3YXK1 Vat1l-201ENSMUST00000049509 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Samd1D3YXK1 Rnf17-202ENSMUST00000223627 2077 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Samd1D3YXK1 Ndufa13-201ENSMUST00000110167 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Samd1D3YXK1 Kctd17-202ENSMUST00000159771 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Samd1D3YXK1 Ercc1-203ENSMUST00000160369 1175 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Samd1D3YXK1 Pcgf1-202ENSMUST00000165164 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Samd1D3YXK1 Hist1h3h-201ENSMUST00000188775 411 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Samd1D3YXK1 Gm29481-201ENSMUST00000189080 1049 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Samd1D3YXK1 Hist1h3i-201ENSMUST00000189457 411 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Samd1D3YXK1 2810429I04Rik-210ENSMUST00000189464 868 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Samd1D3YXK1 1700094J05Rik-202ENSMUST00000190491 997 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Samd1D3YXK1 Gm18307-201ENSMUST00000206864 949 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Samd1D3YXK1 Rpl18-208ENSMUST00000211061 552 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Samd1D3YXK1 Dpm3-201ENSMUST00000040824 404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Samd1D3YXK1 A730061H03Rik-201ENSMUST00000066106 465 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Samd1D3YXK1 Pcgf1-201ENSMUST00000092614 866 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Samd1D3YXK1 F630040K05Rik-202ENSMUST00000180558 2633 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Samd1D3YXK1 Gm4858-202ENSMUST00000194595 1810 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Samd1D3YXK1 Gm6211-201ENSMUST00000147973 4275 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Samd1D3YXK1 Cabp4-201ENSMUST00000025761 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Samd1D3YXK1 Arhgef40-202ENSMUST00000100639 4843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Samd1D3YXK1 Dnajc13-201ENSMUST00000035170 8012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Samd1D3YXK1 Gm5608-201ENSMUST00000210253 2290 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Samd1D3YXK1 Hoxd3os1-202ENSMUST00000139005 1701 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Samd1D3YXK1 Adck2-204ENSMUST00000140364 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Samd1D3YXK1 Zfp853-203ENSMUST00000212715 3133 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Samd1D3YXK1 Chrd-201ENSMUST00000007171 3275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Samd1D3YXK1 AC114008.2-201ENSMUST00000227699 1347 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Samd1D3YXK1 Ntm-203ENSMUST00000115237 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Samd1D3YXK1 2900005J15Rik-202ENSMUST00000171190 2025 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Samd1D3YXK1 Mettl3-201ENSMUST00000022767 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Samd1D3YXK1 Zmiz1-208ENSMUST00000162645 7482 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Samd1D3YXK1 Ank2-221ENSMUST00000182994 2715 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Samd1D3YXK1 Rbbp5-207ENSMUST00000190997 2856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Samd1D3YXK1 Etv3-205ENSMUST00000170036 5127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Samd1D3YXK1 Nxf1-201ENSMUST00000010241 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Samd1D3YXK1 Adamtsl4-202ENSMUST00000117782 4036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Samd1D3YXK1 Kif28-202ENSMUST00000211943 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Samd1D3YXK1 Kcnt1-211ENSMUST00000171268 3771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Samd1D3YXK1 Samhd1-203ENSMUST00000109549 3245 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Samd1D3YXK1 Olfr464-205ENSMUST00000217112 2232 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Samd1D3YXK1 1810058I24Rik-203ENSMUST00000152147 2521 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Samd1D3YXK1 Igfbp4-201ENSMUST00000017637 3831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Samd1D3YXK1 Trim15-201ENSMUST00000025329 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Samd1D3YXK1 Hsd3b7-201ENSMUST00000046863 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Samd1D3YXK1 Dip2a-202ENSMUST00000105417 6383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Samd1D3YXK1 Tcf25-202ENSMUST00000108840 2582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Samd1D3YXK1 Ablim1-211ENSMUST00000111555 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Samd1D3YXK1 Gimap8-202ENSMUST00000203083 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Samd1D3YXK1 Ddx46-202ENSMUST00000172272 5676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Samd1D3YXK1 Arhgap4-203ENSMUST00000114405 6299 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Samd1D3YXK1 Itfg2-203ENSMUST00000142615 3191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Samd1D3YXK1 Afg3l1-201ENSMUST00000001520 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Samd1D3YXK1 Selenoh-202ENSMUST00000102647 654 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Samd1D3YXK1 Trav4-2-201ENSMUST00000103637 370 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Samd1D3YXK1 Ngb-202ENSMUST00000110176 908 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Samd1D3YXK1 Thy1-201ENSMUST00000114840 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Samd1D3YXK1 Gm4984-201ENSMUST00000115987 360 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Samd1D3YXK1 Gm15240-201ENSMUST00000118156 720 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Samd1D3YXK1 Med28-203ENSMUST00000119579 636 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Samd1D3YXK1 Gm5912-201ENSMUST00000122282 1438 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Samd1D3YXK1 Ift20-203ENSMUST00000128788 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Samd1D3YXK1 B230217C12Rik-204ENSMUST00000170806 1118 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Samd1D3YXK1 Ndufs6-201ENSMUST00000022097 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Samd1D3YXK1 Scd2-201ENSMUST00000026221 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Samd1D3YXK1 Oraov1-201ENSMUST00000033388 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Samd1D3YXK1 Swi5-201ENSMUST00000050410 775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Samd1D3YXK1 Dnajc5g-201ENSMUST00000066544 1565 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Samd1D3YXK1 Orc2-201ENSMUST00000027198 3561 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Samd1D3YXK1 H2-Ob-201ENSMUST00000095342 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Samd1D3YXK1 H2-Q6-202ENSMUST00000174699 2085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Samd1D3YXK1 Jade2-203ENSMUST00000109091 6099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Samd1D3YXK1 Rapgef3-205ENSMUST00000129223 3750 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Samd1D3YXK1 Cplx4-201ENSMUST00000025397 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Samd1D3YXK1 Msh4-201ENSMUST00000005630 3325 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Samd1D3YXK1 Cfp-201ENSMUST00000001156 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Samd1D3YXK1 Wbp2nl-201ENSMUST00000023089 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Samd1D3YXK1 Dhx57-202ENSMUST00000086555 5077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Samd1D3YXK1 Armcx2-201ENSMUST00000035559 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Samd1D3YXK1 Patj-201ENSMUST00000030290 2495 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Samd1D3YXK1 Rara-207ENSMUST00000164748 3129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Samd1D3YXK1 Nfe2l1-211ENSMUST00000167149 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Samd1D3YXK1 Zfp783-204ENSMUST00000130490 4419 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.4 ms