Protein–RNA interactions for Protein: A2AGT5

Ckap5, Cytoskeleton-associated protein 5, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,032 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ckap5A2AGT5 Sept10-201ENSMUST00000165971 2532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Ckap5A2AGT5 B230344G16Rik-201ENSMUST00000180782 2024 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Ckap5A2AGT5 Npepps-219ENSMUST00000172108 2924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Ckap5A2AGT5 0610010K14Rik-203ENSMUST00000100950 545 ntTSL 2 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Ckap5A2AGT5 Gm13492-201ENSMUST00000119772 665 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Ckap5A2AGT5 Hnf4aos-203ENSMUST00000141329 839 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Ckap5A2AGT5 Snhg17-206ENSMUST00000152125 1046 ntTSL 3 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Ckap5A2AGT5 Gm20482-202ENSMUST00000174729 825 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Ckap5A2AGT5 Rnf141-207ENSMUST00000176716 1080 ntTSL 2 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Ckap5A2AGT5 9430007M09Rik-201ENSMUST00000201947 804 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Ckap5A2AGT5 4933436H12Rik-201ENSMUST00000207304 658 ntTSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Ckap5A2AGT5 Morn2-202ENSMUST00000227729 656 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Ckap5A2AGT5 Med27-201ENSMUST00000028139 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Ckap5A2AGT5 Acin1-201ENSMUST00000022793 4735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Ckap5A2AGT5 Usp10-210ENSMUST00000144458 3726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Ckap5A2AGT5 Trp53i11-202ENSMUST00000111266 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Ckap5A2AGT5 2900089D17Rik-201ENSMUST00000124015 2475 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Ckap5A2AGT5 Gm14703-201ENSMUST00000145894 1820 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Ckap5A2AGT5 Ifnlr1-201ENSMUST00000074408 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Ckap5A2AGT5 Per1-201ENSMUST00000021271 4671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Ckap5A2AGT5 Mrc2-202ENSMUST00000100335 5795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Ckap5A2AGT5 Zfp64-203ENSMUST00000109162 2848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Ckap5A2AGT5 Tsku-206ENSMUST00000179780 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Ckap5A2AGT5 Misp-201ENSMUST00000046833 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Ckap5A2AGT5 Acot4-201ENSMUST00000021652 6203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Ckap5A2AGT5 Klhl38-201ENSMUST00000022985 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Ckap5A2AGT5 Slc39a8-201ENSMUST00000029810 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Ckap5A2AGT5 Pik3cd-214ENSMUST00000177654 4765 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Ckap5A2AGT5 Camsap2-202ENSMUST00000192001 6329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Ckap5A2AGT5 Pyroxd1-201ENSMUST00000041852 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Ckap5A2AGT5 Rpl3-ps1-201ENSMUST00000120557 1210 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Ckap5A2AGT5 Pdlim2-205ENSMUST00000129174 729 ntTSL 2 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Ckap5A2AGT5 Fgfr3-ps-201ENSMUST00000195511 1137 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Ckap5A2AGT5 Hax1-206ENSMUST00000197786 857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Ckap5A2AGT5 Gm5565-201ENSMUST00000199463 1162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Ckap5A2AGT5 4933421D24Rik-201ENSMUST00000209302 1286 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Ckap5A2AGT5 Gm42067-201ENSMUST00000209642 647 ntTSL 2 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Ckap5A2AGT5 Rps3a1-201ENSMUST00000029722 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Ckap5A2AGT5 Gm9025-201ENSMUST00000122415 1575 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Ckap5A2AGT5 AC113060.1-201ENSMUST00000225689 1573 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Ckap5A2AGT5 AC167669.2-201ENSMUST00000224417 1620 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Ckap5A2AGT5 Jmjd8-201ENSMUST00000026832 2091 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Ckap5A2AGT5 Ttc25-202ENSMUST00000092684 2240 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Ckap5A2AGT5 Slc26a5-201ENSMUST00000030878 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Ckap5A2AGT5 Slc25a25-205ENSMUST00000113310 3278 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Ckap5A2AGT5 Mtm1-201ENSMUST00000025391 3286 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Ckap5A2AGT5 Disp1-205ENSMUST00000195372 4901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Ckap5A2AGT5 Atp2a3-203ENSMUST00000108485 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Ckap5A2AGT5 Pphln1-203ENSMUST00000109256 3759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Ckap5A2AGT5 Ptpn7-203ENSMUST00000187985 1990 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Ckap5A2AGT5 Ifi47-201ENSMUST00000046704 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Ckap5A2AGT5 Col26a1-202ENSMUST00000111103 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Ckap5A2AGT5 Gm26577-201ENSMUST00000180680 2184 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Ckap5A2AGT5 AC241621.2-201ENSMUST00000223991 2151 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Ckap5A2AGT5 Kcnt1-211ENSMUST00000171268 3771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Ckap5A2AGT5 Asic3-202ENSMUST00000196296 1593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Ckap5A2AGT5 Sh3bp2-202ENSMUST00000101316 3031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Ckap5A2AGT5 Qdpr-202ENSMUST00000117425 1231 ntTSL 3 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Ckap5A2AGT5 Gm15808-201ENSMUST00000119046 604 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Ckap5A2AGT5 Gm14019-201ENSMUST00000131514 403 ntTSL 3 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Ckap5A2AGT5 1700040D17Rik-201ENSMUST00000181305 998 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Ckap5A2AGT5 Gm28085-201ENSMUST00000189281 1137 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Ckap5A2AGT5 Pcbd1-201ENSMUST00000020298 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Ckap5A2AGT5 Mirlet7c-2-201ENSMUST00000083674 95 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Ckap5A2AGT5 Ccdc162-208ENSMUST00000179614 2739 ntTSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Ckap5A2AGT5 Phactr2-201ENSMUST00000079698 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Ckap5A2AGT5 Ccdc71-201ENSMUST00000061209 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Ckap5A2AGT5 Stk25-201ENSMUST00000027498 4249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Ckap5A2AGT5 Vps36-201ENSMUST00000033866 3574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Ckap5A2AGT5 Armc7-201ENSMUST00000035240 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Ckap5A2AGT5 Cdc45-201ENSMUST00000000028 2143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Ckap5A2AGT5 Tsta3-201ENSMUST00000023231 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Ckap5A2AGT5 Trpv1-201ENSMUST00000006106 2340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Ckap5A2AGT5 Ccnk-201ENSMUST00000101055 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Ckap5A2AGT5 Nynrin-202ENSMUST00000168479 7511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Ckap5A2AGT5 Ppp6r1-201ENSMUST00000064099 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Ckap5A2AGT5 Nup88-203ENSMUST00000108531 2453 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Ckap5A2AGT5 Gm28323-201ENSMUST00000186817 2499 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Ckap5A2AGT5 Gk5-202ENSMUST00000122383 4455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Ckap5A2AGT5 1700003G18Rik-201ENSMUST00000140689 633 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Ckap5A2AGT5 Armc2-208ENSMUST00000162405 1135 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Ckap5A2AGT5 Gm17376-201ENSMUST00000166016 84 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Ckap5A2AGT5 Tmcc1-205ENSMUST00000173031 1024 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Ckap5A2AGT5 Gm11523-203ENSMUST00000184482 802 ntTSL 3 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Ckap5A2AGT5 Gm8176-201ENSMUST00000191297 1099 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Ckap5A2AGT5 Gm6082-201ENSMUST00000215204 454 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Ckap5A2AGT5 Lypd2-201ENSMUST00000023260 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Ckap5A2AGT5 Zdhhc12-201ENSMUST00000081838 1187 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Ckap5A2AGT5 Pik3cd-204ENSMUST00000105690 4921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Ckap5A2AGT5 Skp2-203ENSMUST00000190131 1819 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Ckap5A2AGT5 Rnf224-201ENSMUST00000091318 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Ckap5A2AGT5 Fem1a-201ENSMUST00000060253 6816 ntAPPRIS P1 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Ckap5A2AGT5 Ube3b-201ENSMUST00000074002 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Ckap5A2AGT5 Pxn-214ENSMUST00000212819 1689 ntTSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Ckap5A2AGT5 Gpr157-201ENSMUST00000094451 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Ckap5A2AGT5 Ankrd33b-204ENSMUST00000123325 7466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Ckap5A2AGT5 Gm33543-203ENSMUST00000211096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Ckap5A2AGT5 Rfx1-204ENSMUST00000211046 3677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Ckap5A2AGT5 Bcl6-201ENSMUST00000023151 3525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Ckap5A2AGT5 Acin1-202ENSMUST00000022794 2365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
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