Protein–RNA interactions for Protein: A2A8L5

Ptprf, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase F, mousemouse

Predictions only

Length 1,898 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprfA2A8L5 Eno3-206ENSMUST00000170716 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
PtprfA2A8L5 Dmac2-201ENSMUST00000077338 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
PtprfA2A8L5 Vars-201ENSMUST00000087315 4137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
PtprfA2A8L5 Pak1-201ENSMUST00000033040 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
PtprfA2A8L5 Gm27194-201ENSMUST00000175753 2936 ntBASIC12.77□□□□□ -0.36
PtprfA2A8L5 Gm23200-201ENSMUST00000104379 132 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
PtprfA2A8L5 6030468B19Rik-201ENSMUST00000106331 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
PtprfA2A8L5 Stau1-204ENSMUST00000109238 2976 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
PtprfA2A8L5 Gm4909-201ENSMUST00000118749 794 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
PtprfA2A8L5 Stard10-207ENSMUST00000173270 670 ntTSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
PtprfA2A8L5 Kcnk7-201ENSMUST00000052448 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
PtprfA2A8L5 Clec4b2-201ENSMUST00000088455 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
PtprfA2A8L5 Mmgt2-203ENSMUST00000129162 1828 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
PtprfA2A8L5 AC121805.2-201ENSMUST00000218808 2538 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
PtprfA2A8L5 5430419D17Rik-201ENSMUST00000050586 2928 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
PtprfA2A8L5 Pltp-202ENSMUST00000109316 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
PtprfA2A8L5 Gm44758-201ENSMUST00000206096 2068 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
PtprfA2A8L5 Gsn-205ENSMUST00000201185 2607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
PtprfA2A8L5 Abhd1-202ENSMUST00000201125 1352 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
PtprfA2A8L5 Mdm2-202ENSMUST00000105263 3145 ntTSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
PtprfA2A8L5 Cyth1-201ENSMUST00000017276 3135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
PtprfA2A8L5 Irak2-202ENSMUST00000089022 2974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
PtprfA2A8L5 Serinc2-202ENSMUST00000120126 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
PtprfA2A8L5 Parp2-201ENSMUST00000036126 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
PtprfA2A8L5 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
PtprfA2A8L5 Xrra1-202ENSMUST00000207855 1334 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
PtprfA2A8L5 Arhgef18-201ENSMUST00000004684 5271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
PtprfA2A8L5 Kif9-204ENSMUST00000198043 2233 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
PtprfA2A8L5 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
PtprfA2A8L5 A230072I06Rik-201ENSMUST00000098935 1839 ntAPPRIS P1 BASIC12.77□□□□□ -0.37
PtprfA2A8L5 Nrg1-201ENSMUST00000073884 2452 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
PtprfA2A8L5 Pcnx2-204ENSMUST00000131127 3782 ntTSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
PtprfA2A8L5 Gm44929-202ENSMUST00000209134 1653 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
PtprfA2A8L5 Arf4os-201ENSMUST00000166902 566 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
PtprfA2A8L5 Gm19208-201ENSMUST00000213861 912 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
PtprfA2A8L5 Gm33115-201ENSMUST00000220913 743 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
PtprfA2A8L5 Ubtf-203ENSMUST00000107115 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
PtprfA2A8L5 Casc4-204ENSMUST00000110586 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
PtprfA2A8L5 Irf1-202ENSMUST00000108920 2137 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
PtprfA2A8L5 Gm44292-201ENSMUST00000205194 2364 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
PtprfA2A8L5 Dmac2-202ENSMUST00000085953 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
PtprfA2A8L5 Dnmt3l-202ENSMUST00000123940 1452 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
PtprfA2A8L5 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
PtprfA2A8L5 Pcp4l1-201ENSMUST00000111332 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
PtprfA2A8L5 Mkrn1-201ENSMUST00000031985 3046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
PtprfA2A8L5 Prkar1b-203ENSMUST00000110890 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
PtprfA2A8L5 Rnf168-201ENSMUST00000014218 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
PtprfA2A8L5 Slc29a2-201ENSMUST00000025826 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
PtprfA2A8L5 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
PtprfA2A8L5 Cd34-202ENSMUST00000110815 2554 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
PtprfA2A8L5 Dnmt3b-206ENSMUST00000103151 3956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
PtprfA2A8L5 Eml5-210ENSMUST00000223282 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
PtprfA2A8L5 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
PtprfA2A8L5 Gm43721-201ENSMUST00000199677 2313 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
PtprfA2A8L5 Myo1c-201ENSMUST00000069057 4547 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
PtprfA2A8L5 Gm15782-201ENSMUST00000121073 445 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
PtprfA2A8L5 Gm13381-202ENSMUST00000177012 640 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
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PtprfA2A8L5 Gm42920-201ENSMUST00000196616 409 ntTSL 3 BASIC12.76□□□□□ -0.37
PtprfA2A8L5 Gm8959-201ENSMUST00000213150 571 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
PtprfA2A8L5 Cym-201ENSMUST00000029504 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
PtprfA2A8L5 Syngr4-201ENSMUST00000039049 967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
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PtprfA2A8L5 Usp20-201ENSMUST00000061544 1360 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
PtprfA2A8L5 Bahd1-201ENSMUST00000036578 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
PtprfA2A8L5 Trim50-202ENSMUST00000111180 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
PtprfA2A8L5 Plod2-201ENSMUST00000070522 3649 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
PtprfA2A8L5 Pex2-204ENSMUST00000165309 2038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
PtprfA2A8L5 Kcnip4-207ENSMUST00000176191 2116 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
PtprfA2A8L5 Zfp961-202ENSMUST00000131237 2689 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.75□□□□□ -0.37
PtprfA2A8L5 Gsdma2-201ENSMUST00000017355 1314 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
PtprfA2A8L5 Myo1c-204ENSMUST00000108431 4718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
PtprfA2A8L5 Hspa2-202ENSMUST00000219555 2526 ntAPPRIS P1 BASIC12.75□□□□□ -0.37
PtprfA2A8L5 Gm5846-201ENSMUST00000193146 1414 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
PtprfA2A8L5 Mul1-202ENSMUST00000105813 3944 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
PtprfA2A8L5 Spcs3-201ENSMUST00000067476 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
PtprfA2A8L5 Tacr2-201ENSMUST00000020278 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
PtprfA2A8L5 Ubn2-201ENSMUST00000039127 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
PtprfA2A8L5 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
PtprfA2A8L5 Lrfn3-201ENSMUST00000046351 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
PtprfA2A8L5 Rbm3-204ENSMUST00000115617 1152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
PtprfA2A8L5 Gm16099-202ENSMUST00000151873 660 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
PtprfA2A8L5 Gm22902-201ENSMUST00000158488 302 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
PtprfA2A8L5 4930578M07Rik-202ENSMUST00000212946 552 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
PtprfA2A8L5 Gm10371-202ENSMUST00000228010 1081 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
PtprfA2A8L5 Klk1b27-201ENSMUST00000079859 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
PtprfA2A8L5 Ccdc28a-202ENSMUST00000080860 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
PtprfA2A8L5 Tnni3-201ENSMUST00000098859 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
PtprfA2A8L5 Snx14-207ENSMUST00000174806 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
PtprfA2A8L5 Tsku-207ENSMUST00000206414 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
PtprfA2A8L5 4931440F15Rik-201ENSMUST00000104962 3274 ntAPPRIS P1 BASIC12.75□□□□□ -0.37
PtprfA2A8L5 Pnn-201ENSMUST00000021381 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
PtprfA2A8L5 Kdelr1-201ENSMUST00000002855 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
PtprfA2A8L5 Cpne4-201ENSMUST00000057742 3959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
PtprfA2A8L5 Zfp429-201ENSMUST00000109732 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
PtprfA2A8L5 Gm45003-201ENSMUST00000205875 2158 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
PtprfA2A8L5 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
PtprfA2A8L5 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
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