Protein–RNA interactions for Protein: Q9QYF1

Rdh11, Retinol dehydrogenase 11, mousemouse

Predictions only

Length 316 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rdh11Q9QYF1 Afap1l1-201ENSMUST00000120472 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Rdh11Q9QYF1 Mslnl-201ENSMUST00000047098 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Rdh11Q9QYF1 Zfp207-206ENSMUST00000165565 2311 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Rdh11Q9QYF1 Slc22a15-201ENSMUST00000106928 6573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Rdh11Q9QYF1 Vps4b-201ENSMUST00000094646 4633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Rdh11Q9QYF1 Neu2-204ENSMUST00000165109 1824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Rdh11Q9QYF1 Hoxd3os1-202ENSMUST00000139005 1701 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Rdh11Q9QYF1 AC155298.2-201ENSMUST00000225485 6226 ntBASIC12.62□□□□□ -0.39
Rdh11Q9QYF1 Smpd2-201ENSMUST00000019965 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Rdh11Q9QYF1 Eif4enif1-202ENSMUST00000110048 3712 ntTSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Rdh11Q9QYF1 Drc1-201ENSMUST00000101448 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Rdh11Q9QYF1 Gm36445-201ENSMUST00000209344 1432 ntTSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Rdh11Q9QYF1 Rcbtb2-202ENSMUST00000110952 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Rdh11Q9QYF1 Aldh9a1-201ENSMUST00000028004 2835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Rdh11Q9QYF1 Zc3h4-201ENSMUST00000098789 6039 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.61□□□□□ -0.39
Rdh11Q9QYF1 9130019O22Rik-202ENSMUST00000164345 2735 ntTSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Rdh11Q9QYF1 Usp18-201ENSMUST00000032198 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Rdh11Q9QYF1 Adam33-202ENSMUST00000110232 3165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Rdh11Q9QYF1 Zbtb44-205ENSMUST00000216649 3157 ntTSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Rdh11Q9QYF1 Ggnbp1-203ENSMUST00000133257 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Rdh11Q9QYF1 D6Ertd527e-203ENSMUST00000203747 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.61□□□□□ -0.39
Rdh11Q9QYF1 Arl14ep-201ENSMUST00000028536 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Rdh11Q9QYF1 Pnck-203ENSMUST00000114473 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Rdh11Q9QYF1 Ahsg-201ENSMUST00000023583 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Rdh11Q9QYF1 Mcpt9-201ENSMUST00000095798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Rdh11Q9QYF1 Phactr3-205ENSMUST00000108917 4858 ntTSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Rdh11Q9QYF1 Gal3st4-203ENSMUST00000161647 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Rdh11Q9QYF1 Cd34-201ENSMUST00000016638 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Rdh11Q9QYF1 Dcaf6-201ENSMUST00000027856 4110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Rdh11Q9QYF1 9330198N18Rik-201ENSMUST00000146702 1247 ntTSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Rdh11Q9QYF1 Cd180-203ENSMUST00000170878 842 ntTSL 3 BASIC12.61□□□□□ -0.39
Rdh11Q9QYF1 Cd180-205ENSMUST00000172138 518 ntTSL 2 BASIC12.61□□□□□ -0.39
Rdh11Q9QYF1 Gm27501-201ENSMUST00000183599 107 ntBASIC12.61□□□□□ -0.39
Rdh11Q9QYF1 Pced1c-ps-201ENSMUST00000187740 751 ntBASIC12.61□□□□□ -0.39
Rdh11Q9QYF1 Gm43822-201ENSMUST00000200285 476 ntBASIC12.61□□□□□ -0.39
Rdh11Q9QYF1 Gm44066-201ENSMUST00000203263 519 ntTSL 3 BASIC12.61□□□□□ -0.39
Rdh11Q9QYF1 Atp6v0c-ps1-201ENSMUST00000206596 463 ntBASIC12.61□□□□□ -0.39
Rdh11Q9QYF1 Gm9257-201ENSMUST00000221254 232 ntBASIC12.61□□□□□ -0.39
Rdh11Q9QYF1 Gm4935-201ENSMUST00000221316 1198 ntBASIC12.61□□□□□ -0.39
Rdh11Q9QYF1 Otud6a-201ENSMUST00000060241 873 ntAPPRIS P1 BASIC12.61□□□□□ -0.39
Rdh11Q9QYF1 Fxyd1-202ENSMUST00000071697 522 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.61□□□□□ -0.39
Rdh11Q9QYF1 Gad1-205ENSMUST00000130998 1705 ntTSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Rdh11Q9QYF1 Vps4b-202ENSMUST00000112736 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Rdh11Q9QYF1 Urgcp-204ENSMUST00000120306 3972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Rdh11Q9QYF1 Ncoa7-201ENSMUST00000068567 5105 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.61□□□□□ -0.39
Rdh11Q9QYF1 Cyth2-208ENSMUST00000211783 1983 ntTSL 5 BASIC12.61□□□□□ -0.39
Rdh11Q9QYF1 Acbd5-213ENSMUST00000227809 1986 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.61□□□□□ -0.39
Rdh11Q9QYF1 Foxd4-201ENSMUST00000058600 2345 ntAPPRIS P1 BASIC12.61□□□□□ -0.39
Rdh11Q9QYF1 Glod4-201ENSMUST00000017430 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Rdh11Q9QYF1 Zfp595-205ENSMUST00000171466 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Rdh11Q9QYF1 Slc8a2-201ENSMUST00000168693 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Rdh11Q9QYF1 B230369F24Rik-201ENSMUST00000141846 2560 ntTSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Rdh11Q9QYF1 Mogat2-201ENSMUST00000064231 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Rdh11Q9QYF1 Aqr-201ENSMUST00000043160 4888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Rdh11Q9QYF1 Eif4g3-204ENSMUST00000105830 3252 ntTSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Rdh11Q9QYF1 Nt5c3b-203ENSMUST00000107397 1348 ntTSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Rdh11Q9QYF1 Bscl2-203ENSMUST00000159634 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Rdh11Q9QYF1 Gm16793-201ENSMUST00000181322 1680 ntTSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Rdh11Q9QYF1 Dcaf4-208ENSMUST00000223291 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Rdh11Q9QYF1 Sgk3-201ENSMUST00000097826 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Rdh11Q9QYF1 Hlf-201ENSMUST00000004051 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Rdh11Q9QYF1 Def8-203ENSMUST00000093049 1909 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Rdh11Q9QYF1 Camsap3-202ENSMUST00000171962 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Rdh11Q9QYF1 Ocrl-203ENSMUST00000115020 3210 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Rdh11Q9QYF1 5330426L24Rik-201ENSMUST00000200008 2175 ntBASIC12.6□□□□□ -0.39
Rdh11Q9QYF1 Ptp4a3-202ENSMUST00000163582 3808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Rdh11Q9QYF1 Chchd10-203ENSMUST00000219839 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Rdh11Q9QYF1 Sh3bp2-202ENSMUST00000101316 3031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Rdh11Q9QYF1 Itgal-201ENSMUST00000106306 5195 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Rdh11Q9QYF1 Hhipl2-202ENSMUST00000192527 2310 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Rdh11Q9QYF1 Ptpn7-203ENSMUST00000187985 1990 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Rdh11Q9QYF1 Tcp10b-202ENSMUST00000116666 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Rdh11Q9QYF1 Stau1-201ENSMUST00000049412 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Rdh11Q9QYF1 Fbxw7-201ENSMUST00000029727 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Rdh11Q9QYF1 Hnrnpk-232ENSMUST00000225674 2704 ntBASIC12.6□□□□□ -0.39
Rdh11Q9QYF1 Ndufs5-202ENSMUST00000106206 599 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Rdh11Q9QYF1 Cdkn1a-202ENSMUST00000119901 748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Rdh11Q9QYF1 BC046401-201ENSMUST00000155786 847 ntTSL 3 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Rdh11Q9QYF1 Gm16251-201ENSMUST00000162649 338 ntTSL 3 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Rdh11Q9QYF1 Gm27516-201ENSMUST00000184237 98 ntBASIC12.6□□□□□ -0.39
Rdh11Q9QYF1 Pfdn1-201ENSMUST00000025204 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Rdh11Q9QYF1 Chchd1-201ENSMUST00000071215 616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Rdh11Q9QYF1 Rpl36-201ENSMUST00000080492 404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Rdh11Q9QYF1 Trpt1-201ENSMUST00000088223 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Rdh11Q9QYF1 Olfr521-201ENSMUST00000098263 967 ntAPPRIS P1 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Rdh11Q9QYF1 Cavin1-201ENSMUST00000060792 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Rdh11Q9QYF1 Mnt-201ENSMUST00000000291 4590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Rdh11Q9QYF1 4931406C07Rik-208ENSMUST00000216955 1750 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Rdh11Q9QYF1 Cyth1-203ENSMUST00000106302 3119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Rdh11Q9QYF1 BC030867-201ENSMUST00000100392 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Rdh11Q9QYF1 Gm20683-201ENSMUST00000176751 2790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Rdh11Q9QYF1 Elk1-201ENSMUST00000009550 3548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Rdh11Q9QYF1 Uspl1-205ENSMUST00000121416 3792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Rdh11Q9QYF1 Syt1-202ENSMUST00000105276 4820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Rdh11Q9QYF1 Med28-205ENSMUST00000156481 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Rdh11Q9QYF1 Gm43273-201ENSMUST00000199649 2594 ntBASIC12.6□□□□□ -0.39
Rdh11Q9QYF1 Ppp1r15a-201ENSMUST00000042105 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Rdh11Q9QYF1 Fpr1-201ENSMUST00000061516 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Rdh11Q9QYF1 Kcnn1-204ENSMUST00000212086 2964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Rdh11Q9QYF1 Ebna1bp2-201ENSMUST00000030501 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.6 ms