Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXD8

Limd1, LIM domain-containing protein 1, mousemouse

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Length 668 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Limd1Q9QXD8 Zfp108-201ENSMUST00000072713 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Limd1Q9QXD8 Gm4864-201ENSMUST00000219894 1461 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
Limd1Q9QXD8 Rubcn-204ENSMUST00000119810 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Limd1Q9QXD8 Alg2-201ENSMUST00000044148 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Limd1Q9QXD8 Slc6a8-201ENSMUST00000033752 3964 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Limd1Q9QXD8 Chchd3-202ENSMUST00000115091 1363 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Limd1Q9QXD8 Gm17089-201ENSMUST00000171098 1394 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Limd1Q9QXD8 B230369F24Rik-201ENSMUST00000141846 2560 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Limd1Q9QXD8 Opa1-206ENSMUST00000160597 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Limd1Q9QXD8 Ero1lb-202ENSMUST00000220811 3341 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Limd1Q9QXD8 Rpl15-203ENSMUST00000100799 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Limd1Q9QXD8 Gm6370-201ENSMUST00000110611 1142 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Limd1Q9QXD8 Gm14109-201ENSMUST00000118814 309 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
Limd1Q9QXD8 Gm4760-201ENSMUST00000119663 1030 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
Limd1Q9QXD8 Gng2-205ENSMUST00000161247 419 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Limd1Q9QXD8 Gstp1-201ENSMUST00000169613 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Limd1Q9QXD8 Lsm2-207ENSMUST00000173004 870 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Limd1Q9QXD8 Gm6309-201ENSMUST00000174320 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Limd1Q9QXD8 Gm20825-201ENSMUST00000178149 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Limd1Q9QXD8 Gm27341-201ENSMUST00000183570 106 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
Limd1Q9QXD8 1700020N18Rik-201ENSMUST00000188956 547 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Limd1Q9QXD8 Gm28745-201ENSMUST00000190069 305 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
Limd1Q9QXD8 H2-Oa-201ENSMUST00000025192 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Limd1Q9QXD8 Il25-201ENSMUST00000037863 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Limd1Q9QXD8 Eef1d-203ENSMUST00000089680 973 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Limd1Q9QXD8 Col1a2-201ENSMUST00000031668 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Limd1Q9QXD8 H2-Q1-201ENSMUST00000073208 2024 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Limd1Q9QXD8 B230206H07Rik-202ENSMUST00000134845 3269 ntTSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Limd1Q9QXD8 Fam43a-201ENSMUST00000059078 3075 ntAPPRIS P1 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Limd1Q9QXD8 Aim2-202ENSMUST00000147604 2839 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Limd1Q9QXD8 Ewsr1-201ENSMUST00000063232 1320 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Limd1Q9QXD8 Crry-ps-201ENSMUST00000079090 1309 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
Limd1Q9QXD8 Lypd6-201ENSMUST00000053208 3620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Limd1Q9QXD8 Gabrg3-201ENSMUST00000068394 1724 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Limd1Q9QXD8 Zfp385b-203ENSMUST00000111830 2642 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Limd1Q9QXD8 Phkg1-201ENSMUST00000026617 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Limd1Q9QXD8 Scg3-201ENSMUST00000034699 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Limd1Q9QXD8 Brpf1-210ENSMUST00000204626 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Limd1Q9QXD8 Rcan1-201ENSMUST00000023672 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Limd1Q9QXD8 2900026A02Rik-201ENSMUST00000050125 5876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Limd1Q9QXD8 Kpna7-203ENSMUST00000116454 1500 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Limd1Q9QXD8 Ssh3-202ENSMUST00000113852 2735 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Limd1Q9QXD8 Arhgap11a-203ENSMUST00000110948 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Limd1Q9QXD8 Arhgef39-201ENSMUST00000054538 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Limd1Q9QXD8 Ins2-203ENSMUST00000105931 472 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Limd1Q9QXD8 Gm14130-201ENSMUST00000118417 987 ntBASIC14.12□□□□□ -0.15
Limd1Q9QXD8 Gm13263-201ENSMUST00000121271 838 ntBASIC14.12□□□□□ -0.15
Limd1Q9QXD8 Gm14597-202ENSMUST00000129769 715 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Limd1Q9QXD8 Fundc1-204ENSMUST00000176638 448 ntTSL 3 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Limd1Q9QXD8 4921527H02Rik-201ENSMUST00000196028 246 ntBASIC14.12□□□□□ -0.15
Limd1Q9QXD8 Gm18753-201ENSMUST00000201000 566 ntBASIC14.12□□□□□ -0.15
Limd1Q9QXD8 Gm10046-201ENSMUST00000208208 632 ntTSL 2 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Limd1Q9QXD8 Gm45339-201ENSMUST00000210823 877 ntTSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Limd1Q9QXD8 AC165260.3-202ENSMUST00000224550 1031 ntBASIC14.12□□□□□ -0.15
Limd1Q9QXD8 AC161537.1-201ENSMUST00000226199 1015 ntBASIC14.12□□□□□ -0.15
Limd1Q9QXD8 Crabp2-201ENSMUST00000005019 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Limd1Q9QXD8 Gm43823-201ENSMUST00000197391 1808 ntBASIC14.12□□□□□ -0.15
Limd1Q9QXD8 Gm15326-202ENSMUST00000128198 1422 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Limd1Q9QXD8 Acbd5-213ENSMUST00000227809 1986 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Limd1Q9QXD8 Mid1-215ENSMUST00000171433 2546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Limd1Q9QXD8 Fbxo48-201ENSMUST00000061327 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Limd1Q9QXD8 Nme8-202ENSMUST00000091763 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Limd1Q9QXD8 Gapvd1-202ENSMUST00000102800 8339 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Limd1Q9QXD8 Cep164-204ENSMUST00000213154 6105 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Limd1Q9QXD8 Igf2os-203ENSMUST00000141681 4778 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Limd1Q9QXD8 Cd300lf-202ENSMUST00000106561 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Limd1Q9QXD8 Ficd-201ENSMUST00000065698 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Limd1Q9QXD8 Xrra1-202ENSMUST00000207855 1334 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Limd1Q9QXD8 B230344G16Rik-201ENSMUST00000180782 2024 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Limd1Q9QXD8 Hmga1-203ENSMUST00000117600 1635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Limd1Q9QXD8 Cpxm2-201ENSMUST00000033149 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Limd1Q9QXD8 Fnbp1-206ENSMUST00000113555 1776 ntTSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
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Limd1Q9QXD8 Fam57b-203ENSMUST00000205324 1915 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Limd1Q9QXD8 Cdc25c-201ENSMUST00000060710 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Limd1Q9QXD8 Dhx57-201ENSMUST00000038166 4918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Limd1Q9QXD8 Eif4g1-205ENSMUST00000115461 5507 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
Limd1Q9QXD8 Lpar2-202ENSMUST00000164890 5800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Limd1Q9QXD8 Sp2-201ENSMUST00000062652 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Limd1Q9QXD8 Ick-203ENSMUST00000117330 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.11□□□□□ -0.15
Limd1Q9QXD8 CT010488.1-201ENSMUST00000214890 1522 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Limd1Q9QXD8 Lztr1-201ENSMUST00000023444 3112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Limd1Q9QXD8 Dnmt3l-201ENSMUST00000000746 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Limd1Q9QXD8 Cage1-202ENSMUST00000089840 3449 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Limd1Q9QXD8 Clec18a-203ENSMUST00000188466 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
Limd1Q9QXD8 Clec18a-201ENSMUST00000039597 1998 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
Limd1Q9QXD8 Catip-201ENSMUST00000097697 2101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Limd1Q9QXD8 Cdk5rap3-201ENSMUST00000103152 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Limd1Q9QXD8 Stx18-203ENSMUST00000114126 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Limd1Q9QXD8 Atp2a3-204ENSMUST00000108486 4540 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
Limd1Q9QXD8 Pla2g10-202ENSMUST00000115807 964 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Limd1Q9QXD8 Has2os-201ENSMUST00000125401 485 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Limd1Q9QXD8 Dlx1as-202ENSMUST00000137251 647 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Limd1Q9QXD8 Alg13-207ENSMUST00000149330 479 ntTSL 2 BASIC14.11□□□□□ -0.15
Limd1Q9QXD8 C130026I21Rik-205ENSMUST00000161267 652 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.11□□□□□ -0.15
Limd1Q9QXD8 Gm17105-201ENSMUST00000163715 652 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Limd1Q9QXD8 Gm8018-201ENSMUST00000173536 789 ntBASIC14.11□□□□□ -0.15
Limd1Q9QXD8 Gm44094-201ENSMUST00000204703 2030 ntBASIC14.11□□□□□ -0.15
Limd1Q9QXD8 Gm18212-201ENSMUST00000211678 889 ntBASIC14.11□□□□□ -0.15
Limd1Q9QXD8 Glud1-201ENSMUST00000022322 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
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