Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWV6

Prkrip1, PRKR-interacting protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 186 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prkrip1Q9CWV6 Gm15222-201ENSMUST00000127359 344 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Prkrip1Q9CWV6 Rsf1os2-203ENSMUST00000155074 998 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Prkrip1Q9CWV6 Zfp414-204ENSMUST00000166627 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Prkrip1Q9CWV6 Gm38161-201ENSMUST00000195344 576 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Prkrip1Q9CWV6 Gm31105-201ENSMUST00000211421 687 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Prkrip1Q9CWV6 Fam159a-201ENSMUST00000053157 593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Prkrip1Q9CWV6 Atpif1-201ENSMUST00000067496 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Prkrip1Q9CWV6 Zfp414-201ENSMUST00000073570 1197 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Prkrip1Q9CWV6 Stk33-203ENSMUST00000121378 1304 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Prkrip1Q9CWV6 Gsg1-201ENSMUST00000087729 1307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Prkrip1Q9CWV6 Nkd2-201ENSMUST00000022051 4016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Prkrip1Q9CWV6 Rabggtb-201ENSMUST00000089950 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Prkrip1Q9CWV6 Stx11-201ENSMUST00000042861 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Prkrip1Q9CWV6 Gm21964-203ENSMUST00000219454 1513 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Prkrip1Q9CWV6 Pir-201ENSMUST00000033749 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Prkrip1Q9CWV6 4930423D22Rik-201ENSMUST00000221909 1674 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Prkrip1Q9CWV6 Lrrc27-201ENSMUST00000016124 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Prkrip1Q9CWV6 Hnrnpf-201ENSMUST00000035493 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Prkrip1Q9CWV6 Rubie-203ENSMUST00000227803 2430 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Prkrip1Q9CWV6 Kmt2e-202ENSMUST00000115128 7317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Prkrip1Q9CWV6 Steap3-204ENSMUST00000112643 2873 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Prkrip1Q9CWV6 Ubtf-203ENSMUST00000107115 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Prkrip1Q9CWV6 Epb41l5-208ENSMUST00000191046 6870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Prkrip1Q9CWV6 Sema3d-201ENSMUST00000030868 6307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Prkrip1Q9CWV6 Lmnb2-201ENSMUST00000057623 3531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Prkrip1Q9CWV6 AC122860.2-201ENSMUST00000217967 2671 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Prkrip1Q9CWV6 4931409K22Rik-201ENSMUST00000088302 2613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Prkrip1Q9CWV6 Rps6ka6-210ENSMUST00000137712 2410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Prkrip1Q9CWV6 Mapkapk5-204ENSMUST00000111783 1513 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Prkrip1Q9CWV6 Sectm1a-203ENSMUST00000106119 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Prkrip1Q9CWV6 Irs1-201ENSMUST00000069799 9144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Prkrip1Q9CWV6 Tssc4-202ENSMUST00000105920 895 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Prkrip1Q9CWV6 Crybb3-205ENSMUST00000120506 804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Prkrip1Q9CWV6 Gm16215-201ENSMUST00000161990 637 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Prkrip1Q9CWV6 Flg-208ENSMUST00000180308 1076 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Prkrip1Q9CWV6 Platr12-202ENSMUST00000189722 549 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Prkrip1Q9CWV6 Gm2495-201ENSMUST00000191160 466 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Prkrip1Q9CWV6 Gm37047-201ENSMUST00000191992 533 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Prkrip1Q9CWV6 Ip6k2-210ENSMUST00000194875 748 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Prkrip1Q9CWV6 Gm43416-201ENSMUST00000201916 1015 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Prkrip1Q9CWV6 Gm35960-201ENSMUST00000202712 767 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Prkrip1Q9CWV6 Gm44772-201ENSMUST00000207623 1191 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Prkrip1Q9CWV6 Aprt-209ENSMUST00000213062 560 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Prkrip1Q9CWV6 Gm5867-201ENSMUST00000063197 592 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Prkrip1Q9CWV6 Gm13199-201ENSMUST00000071016 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Prkrip1Q9CWV6 Gm11563-201ENSMUST00000092695 1012 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Prkrip1Q9CWV6 Cacna1b-203ENSMUST00000100348 7182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Prkrip1Q9CWV6 Slc22a5-201ENSMUST00000019044 3062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Prkrip1Q9CWV6 Map1b-203ENSMUST00000223725 2669 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Prkrip1Q9CWV6 Myh7-201ENSMUST00000102803 6135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Prkrip1Q9CWV6 Slc25a45-202ENSMUST00000125114 2599 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Prkrip1Q9CWV6 Tle1-201ENSMUST00000030095 2569 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Prkrip1Q9CWV6 Kcnj5-203ENSMUST00000216033 2440 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Prkrip1Q9CWV6 Gm43677-201ENSMUST00000198098 2378 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Prkrip1Q9CWV6 Hkdc1-201ENSMUST00000020277 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Prkrip1Q9CWV6 Smarca1-205ENSMUST00000141084 1965 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Prkrip1Q9CWV6 Serpinb2-202ENSMUST00000064916 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Prkrip1Q9CWV6 Arhgef3-204ENSMUST00000225949 3198 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Prkrip1Q9CWV6 Caln1-201ENSMUST00000086029 1801 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Prkrip1Q9CWV6 Cnot7-211ENSMUST00000149992 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Prkrip1Q9CWV6 Adi1-201ENSMUST00000020957 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Prkrip1Q9CWV6 Ankrd42-201ENSMUST00000056106 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Prkrip1Q9CWV6 B230209E15Rik-201ENSMUST00000209115 1597 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Prkrip1Q9CWV6 Bop1-201ENSMUST00000023217 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Prkrip1Q9CWV6 Fhad1-201ENSMUST00000036701 1366 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Prkrip1Q9CWV6 Gm15703-201ENSMUST00000120250 880 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Prkrip1Q9CWV6 U2af1l4-215ENSMUST00000166257 546 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Prkrip1Q9CWV6 1700095B10Rik-201ENSMUST00000182349 978 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Prkrip1Q9CWV6 Med27-201ENSMUST00000028139 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Prkrip1Q9CWV6 Upk3bl-201ENSMUST00000006303 1045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Prkrip1Q9CWV6 Ppp1r14d-201ENSMUST00000076084 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Prkrip1Q9CWV6 Git2-202ENSMUST00000086564 2984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Prkrip1Q9CWV6 Podn-202ENSMUST00000106708 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Prkrip1Q9CWV6 Vps4b-202ENSMUST00000112736 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Prkrip1Q9CWV6 Sall4-201ENSMUST00000029061 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Prkrip1Q9CWV6 Dysf-214ENSMUST00000204354 6432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Prkrip1Q9CWV6 Ush1c-209ENSMUST00000222454 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Prkrip1Q9CWV6 Avpr2-201ENSMUST00000033765 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Prkrip1Q9CWV6 Gng5-202ENSMUST00000118280 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Prkrip1Q9CWV6 Hnrnpa2b1-203ENSMUST00000114459 1728 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Prkrip1Q9CWV6 Lig3-202ENSMUST00000080461 3056 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Prkrip1Q9CWV6 Pdyn-201ENSMUST00000028883 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Prkrip1Q9CWV6 2310035C23Rik-201ENSMUST00000039173 4328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Prkrip1Q9CWV6 Abhd14b-209ENSMUST00000216130 1624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Prkrip1Q9CWV6 Krt17-201ENSMUST00000080893 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Prkrip1Q9CWV6 Acsm4-201ENSMUST00000047045 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Prkrip1Q9CWV6 Gabpb1-204ENSMUST00000103227 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Prkrip1Q9CWV6 Sun2-203ENSMUST00000100439 3768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Prkrip1Q9CWV6 Acta1-201ENSMUST00000034453 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Prkrip1Q9CWV6 Arid3a-201ENSMUST00000019708 5361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Prkrip1Q9CWV6 Ocln-203ENSMUST00000159459 1950 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Prkrip1Q9CWV6 Mdga2-201ENSMUST00000037181 9833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Prkrip1Q9CWV6 Nrg1-201ENSMUST00000073884 2452 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Prkrip1Q9CWV6 Esco2-201ENSMUST00000022613 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Prkrip1Q9CWV6 Ccdc94-201ENSMUST00000086869 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Prkrip1Q9CWV6 Ttc17-202ENSMUST00000094801 3408 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Prkrip1Q9CWV6 Gm26703-201ENSMUST00000181370 2864 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Prkrip1Q9CWV6 Dnmt3l-205ENSMUST00000138785 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Prkrip1Q9CWV6 Dcun1d3-201ENSMUST00000059851 5985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Prkrip1Q9CWV6 Pcdh1-202ENSMUST00000159405 3880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.3 ms