Protein–RNA interactions for Protein: Q9CRC3

UPF0235 protein C15orf40 homolog, mousemouse

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Length 126 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9CRC3 Six4-202ENSMUST00000175693 6817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Q9CRC3 Herc4-208ENSMUST00000219577 3914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Q9CRC3 Gm38115-201ENSMUST00000194317 2413 ntTSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Q9CRC3 Gm14137-201ENSMUST00000069711 3067 ntAPPRIS P1 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Q9CRC3 0610038B21Rik-201ENSMUST00000181420 1687 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Q9CRC3 Trak1-201ENSMUST00000045903 4827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Q9CRC3 Cnot10-201ENSMUST00000070117 2853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Q9CRC3 Gm10544-201ENSMUST00000180516 2239 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Q9CRC3 Fzd6-201ENSMUST00000022906 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Q9CRC3 Nxph2-201ENSMUST00000102945 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Q9CRC3 BC048403-201ENSMUST00000065600 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Q9CRC3 Fibcd1-201ENSMUST00000028188 4751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Q9CRC3 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Q9CRC3 Cit-202ENSMUST00000102560 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Q9CRC3 Cln3-201ENSMUST00000032962 2386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Q9CRC3 Sec22b-201ENSMUST00000029476 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Q9CRC3 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Q9CRC3 Tomm5-204ENSMUST00000107810 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Q9CRC3 Rab15-204ENSMUST00000122419 856 ntTSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Q9CRC3 Gm13376-201ENSMUST00000128743 448 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Q9CRC3 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Q9CRC3 Dusp3-205ENSMUST00000143177 391 ntTSL 3 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Q9CRC3 Gm11682-201ENSMUST00000144689 516 ntTSL 3 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Q9CRC3 1700023H06Rik-201ENSMUST00000161006 1044 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Q9CRC3 Ssty1-201ENSMUST00000180056 699 ntAPPRIS P1 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Q9CRC3 Gm29310-201ENSMUST00000185468 696 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Q9CRC3 Gm21825-201ENSMUST00000185728 696 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Q9CRC3 Gm29109-201ENSMUST00000185895 696 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Q9CRC3 Gm21896-201ENSMUST00000186520 696 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Q9CRC3 Gm21873-201ENSMUST00000186728 696 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Q9CRC3 Gm21794-201ENSMUST00000187056 696 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Q9CRC3 Gm21880-201ENSMUST00000187275 696 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Q9CRC3 Gm21826-201ENSMUST00000187451 696 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Q9CRC3 Gm21198-201ENSMUST00000188393 696 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Q9CRC3 Gm21749-201ENSMUST00000189343 696 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Q9CRC3 Gm21901-201ENSMUST00000189568 696 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Q9CRC3 Gm29424-201ENSMUST00000189716 696 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Q9CRC3 Gm28599-201ENSMUST00000189838 694 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Q9CRC3 Gm21867-201ENSMUST00000189917 696 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Q9CRC3 Gm29269-201ENSMUST00000190087 696 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Q9CRC3 Gm21722-201ENSMUST00000190153 696 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Q9CRC3 Gm28423-201ENSMUST00000190701 696 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Q9CRC3 Gm21899-201ENSMUST00000190745 696 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Q9CRC3 Gm21910-201ENSMUST00000191163 696 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Q9CRC3 Gm21849-201ENSMUST00000191571 696 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Q9CRC3 Gm28678-201ENSMUST00000191593 696 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Q9CRC3 Gm20910-201ENSMUST00000193268 696 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Q9CRC3 Gm21871-201ENSMUST00000194621 696 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Q9CRC3 Igkv2-116-201ENSMUST00000199327 362 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Q9CRC3 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Q9CRC3 Klk15-201ENSMUST00000068625 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Q9CRC3 G430095P16Rik-201ENSMUST00000098571 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Q9CRC3 Chtop-201ENSMUST00000001043 3257 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Q9CRC3 Gm37600-201ENSMUST00000193764 3292 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Q9CRC3 Ebp-201ENSMUST00000033509 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Q9CRC3 Runx3-201ENSMUST00000056977 3884 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Q9CRC3 Dlk2-201ENSMUST00000061722 1532 ntTSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Q9CRC3 Avpr2-202ENSMUST00000101470 2787 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Q9CRC3 Arfgap2-201ENSMUST00000028691 2791 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Q9CRC3 Slc17a5-202ENSMUST00000117645 3114 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Q9CRC3 Alx1-203ENSMUST00000167156 2689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Q9CRC3 Prpf40b-208ENSMUST00000136980 3047 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Q9CRC3 Lgals12-203ENSMUST00000159983 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Q9CRC3 Gm36235-201ENSMUST00000223158 1694 ntTSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Q9CRC3 Plcd4-204ENSMUST00000113747 2720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Q9CRC3 Hmga1-201ENSMUST00000114888 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Q9CRC3 Zbtb21-201ENSMUST00000052089 5410 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Q9CRC3 Lgsn-201ENSMUST00000062560 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Q9CRC3 Gm9881-201ENSMUST00000068783 3205 ntAPPRIS P1 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Q9CRC3 Sez6l2-201ENSMUST00000106332 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Q9CRC3 Cacna1c-205ENSMUST00000112825 7577 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Q9CRC3 Polr3e-201ENSMUST00000033173 4194 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Q9CRC3 Ndst1-201ENSMUST00000169273 6070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Q9CRC3 Rnf25-202ENSMUST00000113721 1451 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Q9CRC3 Commd1-201ENSMUST00000057843 1459 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Q9CRC3 Madd-211ENSMUST00000111373 5641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Q9CRC3 Tcirg1-204ENSMUST00000126070 3041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Q9CRC3 Rbm6-201ENSMUST00000035201 3999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Q9CRC3 Gm2916-202ENSMUST00000181779 1702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Q9CRC3 Pbrm1-207ENSMUST00000112095 7907 ntTSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Q9CRC3 Spats2l-201ENSMUST00000163239 2313 ntTSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Q9CRC3 Sp2-202ENSMUST00000107623 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Q9CRC3 Gm21038-201ENSMUST00000222205 1383 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Q9CRC3 Gstm7-201ENSMUST00000004137 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Q9CRC3 Ccl22-201ENSMUST00000034231 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Q9CRC3 Gm38037-201ENSMUST00000192600 1624 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Q9CRC3 Tctn1-201ENSMUST00000111738 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Q9CRC3 Zfp532-202ENSMUST00000169679 5003 ntTSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Q9CRC3 Gm12644-201ENSMUST00000119935 606 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Q9CRC3 Gemin7-204ENSMUST00000122055 609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Q9CRC3 3000002C10Rik-202ENSMUST00000133495 1008 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Q9CRC3 Gm11455-201ENSMUST00000149285 733 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Q9CRC3 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Q9CRC3 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Q9CRC3 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Q9CRC3 Tspan32-211ENSMUST00000207211 1220 ntTSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Q9CRC3 Colca2-202ENSMUST00000215038 1269 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Q9CRC3 Gm32635-201ENSMUST00000221493 1162 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Q9CRC3 Bpifa1-201ENSMUST00000028985 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Q9CRC3 Olfr272-201ENSMUST00000051600 962 ntAPPRIS P1 BASIC10.05□□□□□ -0.8
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