Protein–RNA interactions for Protein: Q925N4

Cldn16, Claudin-16, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn16Q925N4 Crybg3-201ENSMUST00000044604 5231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Cldn16Q925N4 B4galnt3-203ENSMUST00000212457 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Cldn16Q925N4 5830411N06Rik-202ENSMUST00000093984 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Cldn16Q925N4 Gm15082-201ENSMUST00000147045 1960 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Cldn16Q925N4 Ctbp2-209ENSMUST00000166439 1997 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Cldn16Q925N4 Grm7-202ENSMUST00000172951 4197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Cldn16Q925N4 Epb41l2-207ENSMUST00000218903 4115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Cldn16Q925N4 Slc13a2-201ENSMUST00000001122 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Cldn16Q925N4 Micu1-204ENSMUST00000165563 2442 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Cldn16Q925N4 Gpr139-201ENSMUST00000084650 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Cldn16Q925N4 Nsd3-206ENSMUST00000142395 10105 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.79
Cldn16Q925N4 Treh-202ENSMUST00000071219 1927 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Cldn16Q925N4 Slc29a1-203ENSMUST00000097317 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Cldn16Q925N4 Nup98-201ENSMUST00000070165 4052 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Cldn16Q925N4 Ankrd42-205ENSMUST00000138267 2827 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Cldn16Q925N4 Arl13b-201ENSMUST00000089289 3528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.79
Cldn16Q925N4 Gstt3-201ENSMUST00000001715 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Cldn16Q925N4 Mest-211ENSMUST00000163949 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Cldn16Q925N4 Capn9-201ENSMUST00000093033 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Cldn16Q925N4 Gm26883-201ENSMUST00000180945 4878 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.79
Cldn16Q925N4 Cnbp-209ENSMUST00000204890 1614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Cldn16Q925N4 Arid5a-204ENSMUST00000115032 4640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Cldn16Q925N4 Adrb3-201ENSMUST00000081438 2795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Cldn16Q925N4 Flcn-202ENSMUST00000091246 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Cldn16Q925N4 Cd163l1-204ENSMUST00000209637 3210 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Cldn16Q925N4 Gm18630-201ENSMUST00000222109 1397 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Cldn16Q925N4 Mmp28-202ENSMUST00000103209 3438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Cldn16Q925N4 Gga3-201ENSMUST00000019135 3816 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Cldn16Q925N4 Arap1-202ENSMUST00000084896 4926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Cldn16Q925N4 Psen1-201ENSMUST00000041806 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Cldn16Q925N4 Msh4-201ENSMUST00000005630 3325 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Cldn16Q925N4 Pip4k2b-201ENSMUST00000018691 5053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Cldn16Q925N4 Clpb-211ENSMUST00000209579 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Cldn16Q925N4 Rbm8a-202ENSMUST00000196456 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Cldn16Q925N4 Fgd2-201ENSMUST00000024810 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Cldn16Q925N4 Cacnb2-203ENSMUST00000114723 3945 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Cldn16Q925N4 Col6a2-201ENSMUST00000001181 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Cldn16Q925N4 Ociad1-201ENSMUST00000031038 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Cldn16Q925N4 Ccdc126-202ENSMUST00000114491 2372 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Cldn16Q925N4 Epb41l1-203ENSMUST00000103136 6249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Cldn16Q925N4 Tmem176b-201ENSMUST00000101429 1238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Cldn16Q925N4 Rgs20-203ENSMUST00000119256 883 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Cldn16Q925N4 Gm11978-201ENSMUST00000122315 466 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Cldn16Q925N4 1700045H11Rik-201ENSMUST00000128056 593 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Cldn16Q925N4 Tex30-213ENSMUST00000156392 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Cldn16Q925N4 Ndufaf8-202ENSMUST00000185558 427 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Cldn16Q925N4 Lce1j-202ENSMUST00000186525 703 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Cldn16Q925N4 Gm18307-201ENSMUST00000206864 949 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Cldn16Q925N4 Gm6983-201ENSMUST00000214912 628 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Cldn16Q925N4 AC122305.4-201ENSMUST00000216159 1206 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Cldn16Q925N4 AC156560.2-201ENSMUST00000221232 264 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Cldn16Q925N4 AC099934.3-201ENSMUST00000223192 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Cldn16Q925N4 Itm2b-204ENSMUST00000228637 783 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Cldn16Q925N4 Hcfc1r1-201ENSMUST00000024697 946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Cldn16Q925N4 Smim11-201ENSMUST00000063641 517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Cldn16Q925N4 Ppil3-201ENSMUST00000081677 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Cldn16Q925N4 Nxf1-201ENSMUST00000010241 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Cldn16Q925N4 Ldb3-207ENSMUST00000227819 1499 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Cldn16Q925N4 Cyb5rl-203ENSMUST00000106758 2516 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Cldn16Q925N4 Gpa33-202ENSMUST00000060833 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Cldn16Q925N4 4930534D22Rik-201ENSMUST00000181438 2715 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Cldn16Q925N4 Uchl1os-201ENSMUST00000152002 1685 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Cldn16Q925N4 Bdnf-205ENSMUST00000111045 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Cldn16Q925N4 Tnn-202ENSMUST00000131919 3987 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Cldn16Q925N4 Gm11725-201ENSMUST00000125607 1850 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Cldn16Q925N4 Mixl1-201ENSMUST00000027778 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Cldn16Q925N4 Micalcl-201ENSMUST00000033033 2259 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Cldn16Q925N4 Cacna1c-203ENSMUST00000112790 7631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Cldn16Q925N4 Wdr25-202ENSMUST00000167816 2657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Cldn16Q925N4 Khdrbs2-205ENSMUST00000189878 3259 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Cldn16Q925N4 Mrps26-202ENSMUST00000145614 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Cldn16Q925N4 Incenp-201ENSMUST00000025562 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Cldn16Q925N4 Zfp28-201ENSMUST00000081022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Cldn16Q925N4 Rabepk-207ENSMUST00000145903 2968 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Cldn16Q925N4 Kcnv2-201ENSMUST00000056708 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Cldn16Q925N4 Dnmbp-201ENSMUST00000026209 4882 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Cldn16Q925N4 Gcn1l1-201ENSMUST00000064454 8555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Cldn16Q925N4 Apaf1-207ENSMUST00000161987 2710 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Cldn16Q925N4 Cpt1c-206ENSMUST00000212836 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Cldn16Q925N4 Vit-201ENSMUST00000024880 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Cldn16Q925N4 Xpot-203ENSMUST00000218004 6005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Cldn16Q925N4 Prx-204ENSMUST00000125990 4298 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Cldn16Q925N4 Rab31-201ENSMUST00000070673 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Cldn16Q925N4 Wdr17-211ENSMUST00000175915 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Cldn16Q925N4 Gba-202ENSMUST00000167998 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Cldn16Q925N4 Pdxdc1-204ENSMUST00000115804 2880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Cldn16Q925N4 Necap1-201ENSMUST00000032477 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Cldn16Q925N4 Zfp125-201ENSMUST00000079237 2488 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Cldn16Q925N4 Dnajc14-207ENSMUST00000219508 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Cldn16Q925N4 Pcdhgb7-201ENSMUST00000194928 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Cldn16Q925N4 Neu4-201ENSMUST00000050890 4511 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Cldn16Q925N4 Vmn1r45-207ENSMUST00000228492 2849 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Cldn16Q925N4 Smc4-201ENSMUST00000042901 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Cldn16Q925N4 Arhgef39-201ENSMUST00000054538 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Cldn16Q925N4 Prkcd-204ENSMUST00000112206 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Cldn16Q925N4 Gm44094-201ENSMUST00000204703 2030 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Cldn16Q925N4 AC123834.1-201ENSMUST00000225346 2043 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Cldn16Q925N4 Lztr1-201ENSMUST00000023444 3112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Cldn16Q925N4 Mrto4-202ENSMUST00000102503 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Cldn16Q925N4 Gm5687-201ENSMUST00000118252 640 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
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