Protein–RNA interactions for Protein: Q91YH5

Atl3, Atlastin-3, mousemouse

Predictions only

Length 541 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atl3Q91YH5 Lrrc3c-201ENSMUST00000142268 902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Atl3Q91YH5 Fam168a-206ENSMUST00000208013 1129 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Atl3Q91YH5 Gm2824-203ENSMUST00000226189 1228 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Atl3Q91YH5 H2-Oa-201ENSMUST00000025192 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Atl3Q91YH5 Tex26-201ENSMUST00000031667 1137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Atl3Q91YH5 Olfr1346-201ENSMUST00000056144 1051 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Atl3Q91YH5 Gm10012-201ENSMUST00000078252 192 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Atl3Q91YH5 Clcn3-201ENSMUST00000004430 4175 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Atl3Q91YH5 Fbxw17-201ENSMUST00000046974 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Atl3Q91YH5 Spata33-202ENSMUST00000212161 2941 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Atl3Q91YH5 Pbrm1-206ENSMUST00000112094 5154 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Atl3Q91YH5 Cdc7-203ENSMUST00000117196 2864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Atl3Q91YH5 Grid2ip-203ENSMUST00000120825 3865 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Atl3Q91YH5 Gnai3-201ENSMUST00000000001 3262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Atl3Q91YH5 Oit3-201ENSMUST00000009798 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Atl3Q91YH5 Mettl17-201ENSMUST00000047899 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Atl3Q91YH5 1500009C09Rik-202ENSMUST00000143238 1552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Atl3Q91YH5 Sp3-202ENSMUST00000102689 4181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Atl3Q91YH5 Slc14a1-203ENSMUST00000160639 2047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Atl3Q91YH5 Tlr9-201ENSMUST00000062241 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Atl3Q91YH5 Atg7-210ENSMUST00000182793 2459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Atl3Q91YH5 Nupl1-206ENSMUST00000225111 2936 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Atl3Q91YH5 Pnma3-201ENSMUST00000060418 3405 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Atl3Q91YH5 Agbl3-202ENSMUST00000115012 790 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Atl3Q91YH5 Agbl3-203ENSMUST00000115014 805 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Atl3Q91YH5 Rhox2d-201ENSMUST00000115179 685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Atl3Q91YH5 Gm11724-201ENSMUST00000125577 472 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Atl3Q91YH5 Cox6c-203ENSMUST00000153512 738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Atl3Q91YH5 Gm6652-201ENSMUST00000186414 1070 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Atl3Q91YH5 Poc1a-205ENSMUST00000191434 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Atl3Q91YH5 2310016G11Rik-202ENSMUST00000209111 733 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Atl3Q91YH5 Isca2-201ENSMUST00000021667 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Atl3Q91YH5 AC110817.1-201ENSMUST00000225706 605 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Atl3Q91YH5 AC132317.1-201ENSMUST00000227227 962 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Atl3Q91YH5 A430005L14Rik-201ENSMUST00000058393 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Atl3Q91YH5 Unk-202ENSMUST00000106452 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Atl3Q91YH5 Pde10a-202ENSMUST00000089085 7717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Atl3Q91YH5 Npc1-201ENSMUST00000025279 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Atl3Q91YH5 Zbtb42-203ENSMUST00000174780 3160 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Atl3Q91YH5 Plekhd1-201ENSMUST00000140770 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Atl3Q91YH5 Cpeb1-201ENSMUST00000098331 3111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Atl3Q91YH5 Ggnbp1-203ENSMUST00000133257 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Atl3Q91YH5 Cacna1b-203ENSMUST00000100348 7182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Atl3Q91YH5 Vps4b-202ENSMUST00000112736 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Atl3Q91YH5 Fggy-202ENSMUST00000079223 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Atl3Q91YH5 Gtf2ird1-202ENSMUST00000074114 3330 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Atl3Q91YH5 Pabpc2-201ENSMUST00000063219 2586 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Atl3Q91YH5 Eif4enif1-213ENSMUST00000179770 3676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Atl3Q91YH5 Nkd2-201ENSMUST00000022051 4016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Atl3Q91YH5 Tcf4-205ENSMUST00000114980 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Atl3Q91YH5 AC157950.1-201ENSMUST00000217561 2168 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Atl3Q91YH5 Pkp1-201ENSMUST00000027667 4669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Atl3Q91YH5 Poc1b-201ENSMUST00000020113 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Atl3Q91YH5 Vps4b-201ENSMUST00000094646 4633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Atl3Q91YH5 Vcl-201ENSMUST00000022369 5267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Atl3Q91YH5 Ralgapb-203ENSMUST00000109486 8383 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Atl3Q91YH5 Sorcs1-206ENSMUST00000209783 3489 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Atl3Q91YH5 Itfg2-206ENSMUST00000203374 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Atl3Q91YH5 Zfp41-201ENSMUST00000054555 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Atl3Q91YH5 Gm11803-201ENSMUST00000119966 444 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Atl3Q91YH5 Gm16296-201ENSMUST00000159905 325 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Atl3Q91YH5 Gm17208-201ENSMUST00000168388 535 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Atl3Q91YH5 AA465934-202ENSMUST00000176545 356 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Atl3Q91YH5 Gm27390-201ENSMUST00000184516 176 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Atl3Q91YH5 Lrcol1-202ENSMUST00000185691 764 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Atl3Q91YH5 Gm29481-201ENSMUST00000189080 1049 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Atl3Q91YH5 1700072B07Rik-201ENSMUST00000191141 445 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Atl3Q91YH5 1700029B24Rik-201ENSMUST00000194040 497 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Atl3Q91YH5 Gm43763-201ENSMUST00000201761 683 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Atl3Q91YH5 Srgn-201ENSMUST00000020271 938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Atl3Q91YH5 Timm10-201ENSMUST00000028470 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Atl3Q91YH5 Otud6a-201ENSMUST00000060241 873 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Atl3Q91YH5 Mrps21-201ENSMUST00000067298 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Atl3Q91YH5 Ephb6-201ENSMUST00000114732 3762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Atl3Q91YH5 Adam22-203ENSMUST00000088744 9245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Atl3Q91YH5 Chrd-201ENSMUST00000007171 3275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Atl3Q91YH5 Slc39a8-201ENSMUST00000029810 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Atl3Q91YH5 2310035C23Rik-201ENSMUST00000039173 4328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Atl3Q91YH5 Gm36266-201ENSMUST00000196660 1749 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Atl3Q91YH5 Tekt3-201ENSMUST00000035732 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Atl3Q91YH5 Xndc1-201ENSMUST00000094130 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Atl3Q91YH5 Rara-207ENSMUST00000164748 3129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Atl3Q91YH5 Trip4-201ENSMUST00000117083 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Atl3Q91YH5 Synpo-209ENSMUST00000143275 5040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Atl3Q91YH5 Rbpj-207ENSMUST00000201883 4961 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Atl3Q91YH5 Terf2ip-201ENSMUST00000052138 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Atl3Q91YH5 Rtbdn-201ENSMUST00000067472 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Atl3Q91YH5 Hnf1b-203ENSMUST00000108114 2659 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Atl3Q91YH5 Rab31-201ENSMUST00000070673 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Atl3Q91YH5 Folr1-204ENSMUST00000106985 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Atl3Q91YH5 Gm9115-201ENSMUST00000120192 1348 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Atl3Q91YH5 Inpp5e-205ENSMUST00000145701 4147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Atl3Q91YH5 Ndufs5-202ENSMUST00000106206 599 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Atl3Q91YH5 Prkaca-ps1-201ENSMUST00000120823 919 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Atl3Q91YH5 Rpl19-ps12-201ENSMUST00000121251 591 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Atl3Q91YH5 Gm16229-201ENSMUST00000133270 1232 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Atl3Q91YH5 Gm11684-201ENSMUST00000144975 757 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Atl3Q91YH5 Gm13066-201ENSMUST00000145263 884 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Atl3Q91YH5 Gm8810-201ENSMUST00000172895 754 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Atl3Q91YH5 C330013E15Rik-201ENSMUST00000181034 878 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60 ms