Protein–RNA interactions for Protein: Q8BXQ8

Fam53c, Protein FAM53C, mousemouse

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Length 393 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam53cQ8BXQ8 Cfap157-201ENSMUST00000102813 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Fam53cQ8BXQ8 Dcaf7-201ENSMUST00000058438 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Fam53cQ8BXQ8 Hps1-209ENSMUST00000162061 2608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Fam53cQ8BXQ8 Cttn-201ENSMUST00000033407 2913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Fam53cQ8BXQ8 Supt6-201ENSMUST00000002121 6488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Fam53cQ8BXQ8 Sdf4-201ENSMUST00000050078 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Fam53cQ8BXQ8 Klhl6-201ENSMUST00000058839 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Fam53cQ8BXQ8 Gm19692-201ENSMUST00000203856 2084 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Fam53cQ8BXQ8 Plch2-210ENSMUST00000176194 5619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Fam53cQ8BXQ8 Tufm-202ENSMUST00000106392 1754 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Fam53cQ8BXQ8 Arhgef40-202ENSMUST00000100639 4843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Fam53cQ8BXQ8 Arl4a-201ENSMUST00000101472 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Fam53cQ8BXQ8 Dnajc8-205ENSMUST00000105939 746 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Fam53cQ8BXQ8 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Fam53cQ8BXQ8 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Fam53cQ8BXQ8 Gm28262-201ENSMUST00000185463 477 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Fam53cQ8BXQ8 Cldn25-ps-201ENSMUST00000197641 693 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Fam53cQ8BXQ8 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Fam53cQ8BXQ8 AC153937.1-201ENSMUST00000218734 412 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Fam53cQ8BXQ8 Gm17870-201ENSMUST00000219489 1174 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Fam53cQ8BXQ8 Tspyl-ps-201ENSMUST00000220692 1117 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Fam53cQ8BXQ8 Gm16476-201ENSMUST00000221544 139 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Fam53cQ8BXQ8 AC154572.2-201ENSMUST00000225105 997 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Fam53cQ8BXQ8 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Fam53cQ8BXQ8 AC154314.2-201ENSMUST00000223677 3502 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Fam53cQ8BXQ8 Ptgir-202ENSMUST00000144408 3305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Fam53cQ8BXQ8 Kmt2e-202ENSMUST00000115128 7317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Fam53cQ8BXQ8 Grm7-202ENSMUST00000172951 4197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Fam53cQ8BXQ8 Elavl2-204ENSMUST00000107110 3671 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Fam53cQ8BXQ8 Nefm-202ENSMUST00000111089 3680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Fam53cQ8BXQ8 Siglech-206ENSMUST00000171077 1934 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Fam53cQ8BXQ8 Lnx1-203ENSMUST00000113531 3098 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Fam53cQ8BXQ8 Coq8a-201ENSMUST00000027766 4026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Fam53cQ8BXQ8 Kdm2b-204ENSMUST00000118027 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Fam53cQ8BXQ8 Edc3-201ENSMUST00000043990 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Fam53cQ8BXQ8 Siglecg-201ENSMUST00000005592 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Fam53cQ8BXQ8 Pde10a-202ENSMUST00000089085 7717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Fam53cQ8BXQ8 Hap1-202ENSMUST00000138603 3316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Fam53cQ8BXQ8 Sox8-201ENSMUST00000025003 3000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Fam53cQ8BXQ8 Srrt-201ENSMUST00000040873 3024 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Fam53cQ8BXQ8 Chd1-202ENSMUST00000024627 7916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Fam53cQ8BXQ8 Igf2r-201ENSMUST00000024599 8887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Fam53cQ8BXQ8 Lig1-211ENSMUST00000177588 3174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Fam53cQ8BXQ8 Gm43931-201ENSMUST00000204817 2870 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Fam53cQ8BXQ8 Adgrl1-204ENSMUST00000131717 5152 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Fam53cQ8BXQ8 Rbpj-207ENSMUST00000201883 4961 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Fam53cQ8BXQ8 Gm8038-201ENSMUST00000164674 2044 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Fam53cQ8BXQ8 5033428I22Rik-201ENSMUST00000181638 2040 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Fam53cQ8BXQ8 Accs-201ENSMUST00000041593 2036 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Fam53cQ8BXQ8 Ptbp1-202ENSMUST00000095457 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Fam53cQ8BXQ8 Calhm2-201ENSMUST00000035822 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Fam53cQ8BXQ8 Cpt2-203ENSMUST00000106720 1015 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Fam53cQ8BXQ8 Chchd6-202ENSMUST00000113550 1042 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Fam53cQ8BXQ8 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Fam53cQ8BXQ8 H60b-202ENSMUST00000131558 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
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Fam53cQ8BXQ8 Egfl8-201ENSMUST00000015611 1150 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
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Fam53cQ8BXQ8 Lcn10-201ENSMUST00000058912 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Fam53cQ8BXQ8 Upk3bl-201ENSMUST00000006303 1045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
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Fam53cQ8BXQ8 Rplp1-201ENSMUST00000008036 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Fam53cQ8BXQ8 Egfl8-202ENSMUST00000097345 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Fam53cQ8BXQ8 Asrgl1-201ENSMUST00000049948 4195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Fam53cQ8BXQ8 Usp19-210ENSMUST00000193678 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
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Fam53cQ8BXQ8 Etv3-205ENSMUST00000170036 5127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Fam53cQ8BXQ8 Spag16-202ENSMUST00000113940 3559 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Fam53cQ8BXQ8 Fbxo18-201ENSMUST00000071564 3567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Fam53cQ8BXQ8 Lrrc7-205ENSMUST00000200137 7321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Fam53cQ8BXQ8 Birc3-201ENSMUST00000013949 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Fam53cQ8BXQ8 Fam172a-203ENSMUST00000163257 1436 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Fam53cQ8BXQ8 Cyb561d1-202ENSMUST00000106654 1914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Fam53cQ8BXQ8 Ccm2-202ENSMUST00000109721 1551 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Fam53cQ8BXQ8 Apol7a-203ENSMUST00000175919 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Fam53cQ8BXQ8 Gatad2a-201ENSMUST00000065169 3812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Fam53cQ8BXQ8 Gtf2ird2-201ENSMUST00000016086 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Fam53cQ8BXQ8 Pla2g4f-201ENSMUST00000054651 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Fam53cQ8BXQ8 Usp22-201ENSMUST00000041683 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Fam53cQ8BXQ8 E030013I19Rik-201ENSMUST00000148089 2754 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Fam53cQ8BXQ8 Gm38140-201ENSMUST00000193617 2755 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Fam53cQ8BXQ8 Mat2b-202ENSMUST00000101347 2053 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Fam53cQ8BXQ8 Grin1-206ENSMUST00000114314 3882 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Fam53cQ8BXQ8 Spats2l-211ENSMUST00000169772 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Fam53cQ8BXQ8 Pxylp1-201ENSMUST00000078478 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Fam53cQ8BXQ8 Pabpc1-201ENSMUST00000001809 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Fam53cQ8BXQ8 Prrxl1-201ENSMUST00000068938 1610 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Fam53cQ8BXQ8 Yeats2-201ENSMUST00000090052 5997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Fam53cQ8BXQ8 Cluh-201ENSMUST00000092915 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Fam53cQ8BXQ8 AU019823-201ENSMUST00000131351 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
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