Protein–RNA interactions for Protein: Q6KAU4

Mvb12b, Multivesicular body subunit 12B, mousemouse

Predictions only

Length 317 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mvb12bQ6KAU4 Catip-201ENSMUST00000097697 2101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Mvb12bQ6KAU4 Fnbp1-206ENSMUST00000113555 1776 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Mvb12bQ6KAU4 Gnb1l-211ENSMUST00000167778 3569 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Mvb12bQ6KAU4 Actr8-204ENSMUST00000224797 2328 ntAPPRIS P1 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Mvb12bQ6KAU4 Ythdf2-203ENSMUST00000152796 4129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Mvb12bQ6KAU4 Clec18a-203ENSMUST00000188466 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Mvb12bQ6KAU4 Clec18a-201ENSMUST00000039597 1998 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Mvb12bQ6KAU4 Gpnmb-203ENSMUST00000204260 2430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Mvb12bQ6KAU4 Ero1lb-202ENSMUST00000220811 3341 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Mvb12bQ6KAU4 Cyp2d26-201ENSMUST00000006094 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Mvb12bQ6KAU4 Rnf214-201ENSMUST00000058720 3964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Mvb12bQ6KAU4 Fam43a-201ENSMUST00000059078 3075 ntAPPRIS P1 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Mvb12bQ6KAU4 Rcan1-201ENSMUST00000023672 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Mvb12bQ6KAU4 Lypd6-201ENSMUST00000053208 3620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Mvb12bQ6KAU4 Aldh1a2-201ENSMUST00000034723 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Mvb12bQ6KAU4 Cdc26-202ENSMUST00000107459 654 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Mvb12bQ6KAU4 Rbm3-202ENSMUST00000115615 1183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Mvb12bQ6KAU4 Rbm3-203ENSMUST00000115616 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Mvb12bQ6KAU4 Gng2-205ENSMUST00000161247 419 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Mvb12bQ6KAU4 Gm8018-201ENSMUST00000173536 789 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Mvb12bQ6KAU4 Gm13381-202ENSMUST00000177012 640 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Mvb12bQ6KAU4 1700034G24Rik-202ENSMUST00000183186 1081 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Mvb12bQ6KAU4 Mir7070-201ENSMUST00000183657 86 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Mvb12bQ6KAU4 2610016A17Rik-202ENSMUST00000186768 689 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Mvb12bQ6KAU4 Gm43371-201ENSMUST00000202838 1031 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Mvb12bQ6KAU4 AC124171.1-201ENSMUST00000221151 567 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Mvb12bQ6KAU4 Blvrb-201ENSMUST00000037399 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Mvb12bQ6KAU4 BC049730-201ENSMUST00000051714 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Mvb12bQ6KAU4 Olfr524-201ENSMUST00000051943 1058 ntAPPRIS P1 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Mvb12bQ6KAU4 Mettl5-201ENSMUST00000060447 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Mvb12bQ6KAU4 Rpl30-201ENSMUST00000009039 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Mvb12bQ6KAU4 Gm17089-201ENSMUST00000171098 1394 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Mvb12bQ6KAU4 Zfp108-201ENSMUST00000072713 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Mvb12bQ6KAU4 Usp19-201ENSMUST00000006854 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Mvb12bQ6KAU4 Las1l-202ENSMUST00000113864 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Mvb12bQ6KAU4 Cobl-208ENSMUST00000172919 2566 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Mvb12bQ6KAU4 Gm44094-201ENSMUST00000204703 2030 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Mvb12bQ6KAU4 Srsf10-205ENSMUST00000126641 3754 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Mvb12bQ6KAU4 Scn4b-201ENSMUST00000060125 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Mvb12bQ6KAU4 Lrrc8e-201ENSMUST00000053035 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Mvb12bQ6KAU4 Prrt3-202ENSMUST00000204134 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Mvb12bQ6KAU4 Thpo-201ENSMUST00000076422 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Mvb12bQ6KAU4 Mocos-201ENSMUST00000068006 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Mvb12bQ6KAU4 Traf1-202ENSMUST00000113064 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Mvb12bQ6KAU4 Fam118b-202ENSMUST00000063782 1662 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Mvb12bQ6KAU4 Timp3-201ENSMUST00000020234 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Mvb12bQ6KAU4 Vsir-203ENSMUST00000105460 4843 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Mvb12bQ6KAU4 Vsir-201ENSMUST00000020301 4846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Mvb12bQ6KAU4 Igf1-204ENSMUST00000121161 1344 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Mvb12bQ6KAU4 Gm44401-201ENSMUST00000204462 2375 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Mvb12bQ6KAU4 Phkg1-201ENSMUST00000026617 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Mvb12bQ6KAU4 Scg3-201ENSMUST00000034699 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Mvb12bQ6KAU4 Kpna7-203ENSMUST00000116454 1500 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Mvb12bQ6KAU4 B230369F24Rik-201ENSMUST00000141846 2560 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Mvb12bQ6KAU4 Rpsa-201ENSMUST00000035105 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Mvb12bQ6KAU4 Phf24-201ENSMUST00000069184 6392 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Mvb12bQ6KAU4 Ssh3-202ENSMUST00000113852 2735 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Mvb12bQ6KAU4 Slc18b1-206ENSMUST00000179321 2843 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Mvb12bQ6KAU4 Tdg-208ENSMUST00000151390 3502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Mvb12bQ6KAU4 Ins2-204ENSMUST00000105932 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Mvb12bQ6KAU4 Prox1os-201ENSMUST00000110279 828 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Mvb12bQ6KAU4 Gm6370-201ENSMUST00000110611 1142 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Mvb12bQ6KAU4 Lcn6-203ENSMUST00000114199 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Mvb12bQ6KAU4 Gm14109-201ENSMUST00000118814 309 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Mvb12bQ6KAU4 Crls1-204ENSMUST00000124836 1267 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Mvb12bQ6KAU4 Gm24990-201ENSMUST00000157406 323 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Mvb12bQ6KAU4 Gm20498-202ENSMUST00000164386 1043 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Mvb12bQ6KAU4 Gm6309-201ENSMUST00000174320 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Mvb12bQ6KAU4 Gm16505-201ENSMUST00000179981 232 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Mvb12bQ6KAU4 Gm2260-201ENSMUST00000184965 657 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Mvb12bQ6KAU4 Gm45184-201ENSMUST00000206354 955 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Mvb12bQ6KAU4 Ins2-201ENSMUST00000000220 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Mvb12bQ6KAU4 Gm8712-201ENSMUST00000221090 701 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Mvb12bQ6KAU4 Gm19605-202ENSMUST00000221514 1084 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Mvb12bQ6KAU4 AC161537.1-201ENSMUST00000226199 1015 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Mvb12bQ6KAU4 Il25-201ENSMUST00000037863 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Mvb12bQ6KAU4 Cryga-201ENSMUST00000061497 625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Mvb12bQ6KAU4 Ccdc70-202ENSMUST00000070649 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Mvb12bQ6KAU4 Gm4864-201ENSMUST00000219894 1461 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Mvb12bQ6KAU4 Adcyap1r1-206ENSMUST00000167234 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Mvb12bQ6KAU4 Arhgef39-201ENSMUST00000054538 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Mvb12bQ6KAU4 Cd33-201ENSMUST00000004728 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Mvb12bQ6KAU4 Cbx6-202ENSMUST00000109625 3056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Mvb12bQ6KAU4 Wnk1-203ENSMUST00000088644 11330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Mvb12bQ6KAU4 Suv39h1-201ENSMUST00000115636 2707 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Mvb12bQ6KAU4 Orc3-201ENSMUST00000048706 2300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Mvb12bQ6KAU4 Cflar-204ENSMUST00000114309 2010 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Mvb12bQ6KAU4 B230344G16Rik-201ENSMUST00000180782 2024 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Mvb12bQ6KAU4 Hnrnpf-210ENSMUST00000180341 1922 ntAPPRIS P1 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Mvb12bQ6KAU4 Rab17-201ENSMUST00000027529 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Mvb12bQ6KAU4 Hmga1-203ENSMUST00000117600 1635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Mvb12bQ6KAU4 Insrr-202ENSMUST00000107582 4694 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Mvb12bQ6KAU4 Rubcn-204ENSMUST00000119810 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Mvb12bQ6KAU4 Dnajc6-202ENSMUST00000094953 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Mvb12bQ6KAU4 Adam15-204ENSMUST00000107448 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Mvb12bQ6KAU4 Krt26-201ENSMUST00000100482 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Mvb12bQ6KAU4 1300017J02Rik-201ENSMUST00000035163 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Mvb12bQ6KAU4 Ccdc27-201ENSMUST00000047207 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Mvb12bQ6KAU4 Cyp4f17-201ENSMUST00000165999 1693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Mvb12bQ6KAU4 Sim2-201ENSMUST00000072182 3670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.3 ms