Protein–RNA interactions for Protein: Q64347

Clcn1, Chloride channel protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 994 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clcn1Q64347 Pfkl-201ENSMUST00000020522 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Clcn1Q64347 Akap17b-201ENSMUST00000051906 6003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Clcn1Q64347 Cox19-201ENSMUST00000049630 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Clcn1Q64347 Bcas3-201ENSMUST00000074875 2814 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Clcn1Q64347 Kcnh2-201ENSMUST00000036092 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Clcn1Q64347 Dph3-202ENSMUST00000067955 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Clcn1Q64347 4933416C03Rik-201ENSMUST00000099261 2254 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Clcn1Q64347 Tmem163-205ENSMUST00000185560 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Clcn1Q64347 Chfr-201ENSMUST00000014812 3146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Clcn1Q64347 Hoxd3-202ENSMUST00000111982 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Clcn1Q64347 Ate1-202ENSMUST00000035458 4685 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Clcn1Q64347 BC030867-201ENSMUST00000100392 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Clcn1Q64347 Erbb2-201ENSMUST00000058295 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Clcn1Q64347 Pfkfb3-212ENSMUST00000170196 2163 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Clcn1Q64347 Adh6a-202ENSMUST00000106247 1341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Clcn1Q64347 Pla2g2f-201ENSMUST00000030526 2465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Clcn1Q64347 Gnas-204ENSMUST00000087877 3947 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Clcn1Q64347 Serpinb13-201ENSMUST00000027564 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Clcn1Q64347 Actn4-201ENSMUST00000068045 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Clcn1Q64347 Gm11696-203ENSMUST00000188296 1793 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Clcn1Q64347 Shroom3-203ENSMUST00000113055 6765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Clcn1Q64347 4933434M16Rik-202ENSMUST00000153429 1940 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Clcn1Q64347 Hist1h4b-201ENSMUST00000102965 397 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Clcn1Q64347 Cdc26-202ENSMUST00000107459 654 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Clcn1Q64347 Apoc1-202ENSMUST00000108451 532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Clcn1Q64347 Pom121l12-201ENSMUST00000117584 1039 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Clcn1Q64347 Gm12566-201ENSMUST00000121479 359 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Clcn1Q64347 Gm15547-201ENSMUST00000122152 333 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Clcn1Q64347 Naa60-207ENSMUST00000150655 1166 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Clcn1Q64347 Fbxw4-203ENSMUST00000160003 387 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Clcn1Q64347 4833427G06Rik-201ENSMUST00000170947 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Clcn1Q64347 Gm27046-201ENSMUST00000182160 463 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Clcn1Q64347 4930447K03Rik-201ENSMUST00000222745 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Clcn1Q64347 Asb9-201ENSMUST00000033756 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Clcn1Q64347 Pxt1-201ENSMUST00000051526 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Clcn1Q64347 Tbx4-201ENSMUST00000000096 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Clcn1Q64347 Glis2-201ENSMUST00000014447 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Clcn1Q64347 Set-202ENSMUST00000102866 2824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Clcn1Q64347 Pde4a-203ENSMUST00000115458 2962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Clcn1Q64347 Rps6ka4-202ENSMUST00000170516 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Clcn1Q64347 Rps6ka4-201ENSMUST00000025903 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Clcn1Q64347 Gm7002-201ENSMUST00000221386 2165 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Clcn1Q64347 Btaf1-201ENSMUST00000099494 7204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Clcn1Q64347 Col5a3-201ENSMUST00000004201 6119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Clcn1Q64347 Rab17-201ENSMUST00000027529 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Clcn1Q64347 Pja1-202ENSMUST00000113790 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Clcn1Q64347 Itsn1-202ENSMUST00000064797 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Clcn1Q64347 Naa30-201ENSMUST00000037362 4464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Clcn1Q64347 Fam222b-201ENSMUST00000073705 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Clcn1Q64347 L1td1-204ENSMUST00000173659 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Clcn1Q64347 Hnrnph2-202ENSMUST00000059297 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Clcn1Q64347 Mettl1-201ENSMUST00000006915 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Clcn1Q64347 Rsph3b-201ENSMUST00000024572 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Clcn1Q64347 H2-Ob-204ENSMUST00000173764 1319 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Clcn1Q64347 AC079680.2-201ENSMUST00000219181 1306 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Clcn1Q64347 Zfyve28-201ENSMUST00000094868 3983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Clcn1Q64347 Hps3-202ENSMUST00000108321 3385 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Clcn1Q64347 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Clcn1Q64347 Map2k7-206ENSMUST00000110998 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Clcn1Q64347 Ube2a-201ENSMUST00000016452 1732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Clcn1Q64347 CU062626.3-201ENSMUST00000225522 1411 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Clcn1Q64347 Pga5-201ENSMUST00000025647 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Clcn1Q64347 Sectm1b-201ENSMUST00000039309 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Clcn1Q64347 6030468B19Rik-201ENSMUST00000106331 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Clcn1Q64347 Gm7857-201ENSMUST00000117957 358 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Clcn1Q64347 Gm16099-202ENSMUST00000151873 660 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Clcn1Q64347 Nme9-202ENSMUST00000163199 1196 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Clcn1Q64347 Gm25732-201ENSMUST00000175168 60 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Clcn1Q64347 Pfn1-201ENSMUST00000018437 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Clcn1Q64347 4930479H17Rik-201ENSMUST00000208824 292 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Clcn1Q64347 AC166095.1-201ENSMUST00000223731 1241 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Clcn1Q64347 Rpl24-201ENSMUST00000023269 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Clcn1Q64347 Tmem210-201ENSMUST00000028340 516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Clcn1Q64347 Psma7-201ENSMUST00000029082 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Clcn1Q64347 Serpinb2-202ENSMUST00000064916 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Clcn1Q64347 Nr2f2-201ENSMUST00000032768 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Clcn1Q64347 Bri3bp-201ENSMUST00000049040 6473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Clcn1Q64347 Rcan2-202ENSMUST00000044895 3363 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Clcn1Q64347 6430550D23Rik-201ENSMUST00000086145 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Clcn1Q64347 Fam13b-201ENSMUST00000040506 3343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Clcn1Q64347 Gm14752-201ENSMUST00000120719 2075 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Clcn1Q64347 Proser3-206ENSMUST00000215288 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Clcn1Q64347 Caprin2-202ENSMUST00000111569 3697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Clcn1Q64347 Cyp2d26-201ENSMUST00000006094 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Clcn1Q64347 Adamts7-201ENSMUST00000113059 5379 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Clcn1Q64347 Gm43134-201ENSMUST00000199434 1886 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Clcn1Q64347 Plxnb1-201ENSMUST00000072093 8649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Clcn1Q64347 Prr15l-201ENSMUST00000054311 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Clcn1Q64347 Ctdspl2-204ENSMUST00000110578 3386 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Clcn1Q64347 Tmem201-202ENSMUST00000103208 3620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Clcn1Q64347 Myc-205ENSMUST00000161976 2338 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Clcn1Q64347 Myc-201ENSMUST00000022971 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Clcn1Q64347 Skap1-202ENSMUST00000100519 1100 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Clcn1Q64347 Blvrb-202ENSMUST00000108357 782 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Clcn1Q64347 Rap1a-ps2-201ENSMUST00000118467 559 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Clcn1Q64347 Gm8908-201ENSMUST00000121633 1024 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Clcn1Q64347 Gm11851-201ENSMUST00000132219 692 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Clcn1Q64347 Gng2-205ENSMUST00000161247 419 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Clcn1Q64347 Gnpda2-207ENSMUST00000173927 1011 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Clcn1Q64347 Gm28287-201ENSMUST00000186612 546 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.6 ms