Protein–RNA interactions for Protein: Q0KL01

Ubxn2b, UBX domain-containing protein 2B, mousemouse

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Length 331 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubxn2bQ0KL01 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ubxn2bQ0KL01 Krit1-211ENSMUST00000200386 2343 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ubxn2bQ0KL01 Ngly1-207ENSMUST00000224656 2329 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ubxn2bQ0KL01 Hist2h4-201ENSMUST00000171473 1630 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ubxn2bQ0KL01 Gm12337-201ENSMUST00000119634 400 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Ubxn2bQ0KL01 Gm9166-201ENSMUST00000120293 561 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Ubxn2bQ0KL01 Gm12712-201ENSMUST00000120676 801 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Ubxn2bQ0KL01 Gm14286-201ENSMUST00000155674 464 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ubxn2bQ0KL01 Gm23675-201ENSMUST00000157311 125 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Ubxn2bQ0KL01 1810008B01Rik-201ENSMUST00000162325 829 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ubxn2bQ0KL01 Mrpl23-ps1-201ENSMUST00000173086 580 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Ubxn2bQ0KL01 Rpl41-201ENSMUST00000176010 582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ubxn2bQ0KL01 Rpl41-204ENSMUST00000176906 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ubxn2bQ0KL01 Gm19705-203ENSMUST00000181491 678 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ubxn2bQ0KL01 2310034O05Rik-201ENSMUST00000185221 1107 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ubxn2bQ0KL01 AC113282.2-201ENSMUST00000224012 945 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ubxn2bQ0KL01 AC113282.3-201ENSMUST00000224757 942 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ubxn2bQ0KL01 AC165154.1-201ENSMUST00000226661 340 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Ubxn2bQ0KL01 Kcnj11-205ENSMUST00000211674 3142 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ubxn2bQ0KL01 Dubr-204ENSMUST00000186944 2052 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ubxn2bQ0KL01 Grid2-201ENSMUST00000095852 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ubxn2bQ0KL01 Fxyd3-205ENSMUST00000167369 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ubxn2bQ0KL01 Phldb1-212ENSMUST00000138356 5600 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ubxn2bQ0KL01 Brsk1-204ENSMUST00000205666 1398 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ubxn2bQ0KL01 Gm28539-201ENSMUST00000190050 2982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ubxn2bQ0KL01 Shroom3-203ENSMUST00000113055 6765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ubxn2bQ0KL01 Rassf10-201ENSMUST00000182858 3496 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ubxn2bQ0KL01 Traf2-201ENSMUST00000028311 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ubxn2bQ0KL01 Zfp61-208ENSMUST00000165241 1668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ubxn2bQ0KL01 H2-T22-202ENSMUST00000077960 1694 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ubxn2bQ0KL01 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ubxn2bQ0KL01 Plk-ps1-201ENSMUST00000119494 1787 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Ubxn2bQ0KL01 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ubxn2bQ0KL01 Lin37-202ENSMUST00000108164 1312 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ubxn2bQ0KL01 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ubxn2bQ0KL01 Gm7537-201ENSMUST00000221660 1414 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Ubxn2bQ0KL01 Epb41l2-201ENSMUST00000053748 4385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ubxn2bQ0KL01 Bmp4-202ENSMUST00000100676 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ubxn2bQ0KL01 Klhdc7b-201ENSMUST00000166926 1818 ntAPPRIS P2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ubxn2bQ0KL01 P2ry2-206ENSMUST00000208340 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ubxn2bQ0KL01 Usp27x-203ENSMUST00000191497 4273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ubxn2bQ0KL01 Fam160a2-204ENSMUST00000122327 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ubxn2bQ0KL01 Gm35721-201ENSMUST00000220294 2014 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ubxn2bQ0KL01 Gm23255-201ENSMUST00000102244 110 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Ubxn2bQ0KL01 Crygc-202ENSMUST00000114064 612 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ubxn2bQ0KL01 Gm11663-201ENSMUST00000117888 290 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Ubxn2bQ0KL01 Tspan5-202ENSMUST00000119993 2107 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ubxn2bQ0KL01 Gm14198-201ENSMUST00000153208 948 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ubxn2bQ0KL01 Gm12678-201ENSMUST00000154177 692 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ubxn2bQ0KL01 Gm20536-201ENSMUST00000172588 406 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ubxn2bQ0KL01 Gm20537-202ENSMUST00000173131 889 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ubxn2bQ0KL01 Gm20420-201ENSMUST00000173178 639 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ubxn2bQ0KL01 Apoe-210ENSMUST00000174710 514 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ubxn2bQ0KL01 Mir3060-201ENSMUST00000175339 83 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Ubxn2bQ0KL01 Gm37707-201ENSMUST00000195309 325 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ubxn2bQ0KL01 Gm45799-208ENSMUST00000211054 490 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ubxn2bQ0KL01 AC118476.3-201ENSMUST00000216419 1219 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ubxn2bQ0KL01 AC134860.1-201ENSMUST00000224867 660 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Ubxn2bQ0KL01 Tprg-201ENSMUST00000056087 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ubxn2bQ0KL01 Otop2-202ENSMUST00000106544 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ubxn2bQ0KL01 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ubxn2bQ0KL01 Gm6903-201ENSMUST00000160509 1366 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Ubxn2bQ0KL01 Gm13142-201ENSMUST00000117213 1453 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Ubxn2bQ0KL01 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ubxn2bQ0KL01 Cdadc1-204ENSMUST00000171683 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ubxn2bQ0KL01 Stk33-204ENSMUST00000121748 2295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ubxn2bQ0KL01 Me2-201ENSMUST00000025439 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ubxn2bQ0KL01 Lipo3-201ENSMUST00000025694 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ubxn2bQ0KL01 Ccdc137-201ENSMUST00000058370 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ubxn2bQ0KL01 Ap5z1-202ENSMUST00000196055 2965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ubxn2bQ0KL01 Gm44443-201ENSMUST00000204396 5633 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Ubxn2bQ0KL01 Ndufaf1-203ENSMUST00000110802 1308 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ubxn2bQ0KL01 Kif1c-203ENSMUST00000102554 6684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ubxn2bQ0KL01 Pptc7-202ENSMUST00000119015 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ubxn2bQ0KL01 Gm26651-201ENSMUST00000181851 2325 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ubxn2bQ0KL01 Krt2-201ENSMUST00000023712 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ubxn2bQ0KL01 Spock2-201ENSMUST00000121820 5238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ubxn2bQ0KL01 Ylpm1-207ENSMUST00000168977 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ubxn2bQ0KL01 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ubxn2bQ0KL01 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ubxn2bQ0KL01 Lnx1-205ENSMUST00000117525 2259 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ubxn2bQ0KL01 Add2-208ENSMUST00000203786 2289 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ubxn2bQ0KL01 Tcf4-226ENSMUST00000201094 2172 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ubxn2bQ0KL01 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ubxn2bQ0KL01 Nr1h3-203ENSMUST00000111355 1672 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ubxn2bQ0KL01 Car6-201ENSMUST00000030817 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ubxn2bQ0KL01 Tmed9-203ENSMUST00000224741 1450 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Ubxn2bQ0KL01 Cpsf4l-202ENSMUST00000100248 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ubxn2bQ0KL01 EU599041-202ENSMUST00000205291 1386 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ubxn2bQ0KL01 Gm22920-201ENSMUST00000102175 109 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Ubxn2bQ0KL01 Rpl7a-201ENSMUST00000102898 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ubxn2bQ0KL01 Art5-202ENSMUST00000106934 843 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ubxn2bQ0KL01 Cbx7-202ENSMUST00000109615 710 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ubxn2bQ0KL01 Gm13351-201ENSMUST00000118087 414 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Ubxn2bQ0KL01 2900011O08Rik-202ENSMUST00000118412 954 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ubxn2bQ0KL01 Gm5555-201ENSMUST00000120352 1111 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Ubxn2bQ0KL01 Gm13791-201ENSMUST00000123263 608 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ubxn2bQ0KL01 Immp2l-202ENSMUST00000132121 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ubxn2bQ0KL01 Zfp667-204ENSMUST00000153840 596 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ubxn2bQ0KL01 4933421O10Rik-201ENSMUST00000155691 3847 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 166.2 ms