Protein–RNA interactions for Protein: Q08091

Cnn1, Calponin-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 297 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnn1Q08091 Cdc7-203ENSMUST00000117196 2864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Cnn1Q08091 Cdkl2-204ENSMUST00000113143 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Cnn1Q08091 Bmp3-201ENSMUST00000031278 6548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Cnn1Q08091 S1pr1-201ENSMUST00000055676 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Cnn1Q08091 Ccnk-201ENSMUST00000101055 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Cnn1Q08091 Glipr2-202ENSMUST00000107855 1816 ntTSL 2 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Cnn1Q08091 Wdr59-202ENSMUST00000038193 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Cnn1Q08091 Pcdhgb2-202ENSMUST00000195112 4661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Cnn1Q08091 Glod4-201ENSMUST00000017430 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Cnn1Q08091 Prg4-207ENSMUST00000162367 1480 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Cnn1Q08091 Trpv1-201ENSMUST00000006106 2340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Cnn1Q08091 Klf11-201ENSMUST00000020982 4086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Cnn1Q08091 Cnot3-201ENSMUST00000038913 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Cnn1Q08091 Rhox9-202ENSMUST00000170643 2422 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Cnn1Q08091 Ephx2-201ENSMUST00000070515 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Cnn1Q08091 Klhl26-201ENSMUST00000066597 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Cnn1Q08091 Atp5f1-201ENSMUST00000118209 1604 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Cnn1Q08091 Dmrtc1c1-201ENSMUST00000118218 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Cnn1Q08091 Dmrtc1c2-203ENSMUST00000120314 1611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Cnn1Q08091 Armcx2-203ENSMUST00000119010 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Cnn1Q08091 Slc39a8-205ENSMUST00000167390 3533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Cnn1Q08091 Cerk-203ENSMUST00000156546 2162 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Cnn1Q08091 Pcdh8-204ENSMUST00000195355 3704 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Cnn1Q08091 Sqle-201ENSMUST00000022977 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Cnn1Q08091 Fbxw17-201ENSMUST00000046974 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Cnn1Q08091 Lrrc30-201ENSMUST00000097290 1759 ntAPPRIS P1 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Cnn1Q08091 Dlk1-202ENSMUST00000109841 879 ntTSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Cnn1Q08091 Ift20-203ENSMUST00000128788 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Cnn1Q08091 Gm27892-201ENSMUST00000185017 106 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Cnn1Q08091 Gm29481-201ENSMUST00000189080 1049 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Cnn1Q08091 Il31-203ENSMUST00000198901 984 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Cnn1Q08091 Gm8463-201ENSMUST00000208573 613 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Cnn1Q08091 Hcfc1r1-201ENSMUST00000024697 946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Cnn1Q08091 Ceacam10-201ENSMUST00000038069 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Cnn1Q08091 Fam173a-201ENSMUST00000072735 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Cnn1Q08091 Col14a1-201ENSMUST00000023053 6457 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Cnn1Q08091 Mlx-202ENSMUST00000107302 1826 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Cnn1Q08091 Gm15684-201ENSMUST00000160605 1814 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Cnn1Q08091 Gm15163-201ENSMUST00000120749 1302 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Cnn1Q08091 Gm26880-201ENSMUST00000181610 1318 ntTSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Cnn1Q08091 Rasgef1b-209ENSMUST00000168092 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Cnn1Q08091 Rasgef1b-201ENSMUST00000031276 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Cnn1Q08091 Capn8-202ENSMUST00000168514 2483 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Cnn1Q08091 Ubqln1-202ENSMUST00000076454 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Cnn1Q08091 Vill-203ENSMUST00000126251 1411 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Cnn1Q08091 Mrpl44-201ENSMUST00000027464 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Cnn1Q08091 Arhgap33-201ENSMUST00000044338 4280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Cnn1Q08091 Selenot-201ENSMUST00000107924 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Cnn1Q08091 Adam33-202ENSMUST00000110232 3165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Cnn1Q08091 Gm26635-201ENSMUST00000181077 3199 ntTSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Cnn1Q08091 Capn3-201ENSMUST00000028748 2606 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Cnn1Q08091 Irf1-203ENSMUST00000108922 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Cnn1Q08091 Chodl-202ENSMUST00000069148 2051 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Cnn1Q08091 Mroh5-202ENSMUST00000110021 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Cnn1Q08091 Acy1-201ENSMUST00000024031 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Cnn1Q08091 S100pbp-205ENSMUST00000117350 2241 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Cnn1Q08091 Acadsb-201ENSMUST00000015829 6081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Cnn1Q08091 Lrp2bp-202ENSMUST00000110380 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Cnn1Q08091 Tor1aip2-207ENSMUST00000128941 2925 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Cnn1Q08091 Dao-203ENSMUST00000161610 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Cnn1Q08091 Bcat1-202ENSMUST00000048252 1642 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Cnn1Q08091 Gpr26-201ENSMUST00000045840 11571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Cnn1Q08091 Nxf1-201ENSMUST00000010241 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Cnn1Q08091 Itfg2-201ENSMUST00000001559 2320 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Cnn1Q08091 Glis3-202ENSMUST00000112612 3016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Cnn1Q08091 Abat-203ENSMUST00000115839 2414 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Cnn1Q08091 Cd33-202ENSMUST00000039861 1791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Cnn1Q08091 4933434E20Rik-206ENSMUST00000160640 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Cnn1Q08091 Tmem215-201ENSMUST00000049655 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Cnn1Q08091 Tor3a-201ENSMUST00000079625 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Cnn1Q08091 Adamts3-204ENSMUST00000198151 1833 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Cnn1Q08091 Zfp541-202ENSMUST00000209369 4879 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Cnn1Q08091 Hlf-201ENSMUST00000004051 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Cnn1Q08091 Fggy-202ENSMUST00000079223 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Cnn1Q08091 Fnip2-203ENSMUST00000133154 7299 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Cnn1Q08091 Gm8108-202ENSMUST00000170207 1961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Cnn1Q08091 Dmbt1-201ENSMUST00000084509 6243 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Cnn1Q08091 Zbtb44-201ENSMUST00000115222 8861 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Cnn1Q08091 Anapc15-204ENSMUST00000106973 650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Cnn1Q08091 Egfl7-208ENSMUST00000149789 683 ntTSL 3 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Cnn1Q08091 Gm6244-201ENSMUST00000178732 841 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Cnn1Q08091 Gsg1l2-202ENSMUST00000181566 1158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Cnn1Q08091 Myl10-204ENSMUST00000197186 607 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Cnn1Q08091 AC153144.2-201ENSMUST00000221766 451 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Cnn1Q08091 Itm2b-204ENSMUST00000228637 783 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Cnn1Q08091 Rdh5-201ENSMUST00000026406 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Cnn1Q08091 Hdhd3-201ENSMUST00000037820 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Cnn1Q08091 Ptprk-202ENSMUST00000218276 4754 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Cnn1Q08091 Scg3-202ENSMUST00000213324 2152 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Cnn1Q08091 Scn5a-201ENSMUST00000065196 8287 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Cnn1Q08091 Catsper3-202ENSMUST00000109898 1311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Cnn1Q08091 Smad4-202ENSMUST00000114939 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Cnn1Q08091 9530077C05Rik-201ENSMUST00000058868 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Cnn1Q08091 Dpysl5-201ENSMUST00000088081 5022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Cnn1Q08091 Rgs6-204ENSMUST00000185674 1362 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Cnn1Q08091 Gm9755-201ENSMUST00000032981 1356 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Cnn1Q08091 Wdyhv1-201ENSMUST00000067563 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Cnn1Q08091 Gnai3-201ENSMUST00000000001 3262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Cnn1Q08091 Mos-201ENSMUST00000105158 1449 ntAPPRIS P1 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Cnn1Q08091 Phrf1-201ENSMUST00000106027 5248 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
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