Protein–RNA interactions for Protein: P86793

Ccl21c, C-C motif chemokine 21c, mousemouse

Predictions only

Length 133 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccl21cP86793 Qdpr-209ENSMUST00000198258 1172 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ccl21cP86793 Gm19931-201ENSMUST00000198920 368 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Ccl21cP86793 Gm4482-201ENSMUST00000200876 742 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Ccl21cP86793 Gng8-204ENSMUST00000205716 432 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ccl21cP86793 Gm6905-201ENSMUST00000205729 511 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Ccl21cP86793 Gm17827-201ENSMUST00000211825 742 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Ccl21cP86793 Gm4797-201ENSMUST00000219075 1283 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Ccl21cP86793 AC154176.1-201ENSMUST00000225897 220 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Ccl21cP86793 Prrxl1-205ENSMUST00000228878 723 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Ccl21cP86793 Mrpl30-201ENSMUST00000027256 969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ccl21cP86793 Aamdc-202ENSMUST00000072725 776 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ccl21cP86793 Snu13-202ENSMUST00000080622 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ccl21cP86793 Gm5965-201ENSMUST00000009191 588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ccl21cP86793 Prrc2b-201ENSMUST00000036691 8612 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ccl21cP86793 Selenbp1-201ENSMUST00000090839 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ccl21cP86793 Selenbp2-201ENSMUST00000090848 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ccl21cP86793 Mthfsd-210ENSMUST00000139782 1366 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ccl21cP86793 Cnpy2-202ENSMUST00000219037 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ccl21cP86793 Pnoc-201ENSMUST00000059339 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ccl21cP86793 Alx4-202ENSMUST00000111254 7056 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ccl21cP86793 Ccdc121-201ENSMUST00000058825 1819 ntAPPRIS P1 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ccl21cP86793 Sipa1-201ENSMUST00000071857 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ccl21cP86793 Mcm9-206ENSMUST00000220007 3513 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ccl21cP86793 Sh3gl3-206ENSMUST00000179318 1489 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ccl21cP86793 Nup54-201ENSMUST00000038514 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ccl21cP86793 Khdrbs1-201ENSMUST00000066257 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ccl21cP86793 Umad1-204ENSMUST00000159433 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ccl21cP86793 Gm12503-201ENSMUST00000146576 3127 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ccl21cP86793 Otop2-202ENSMUST00000106544 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ccl21cP86793 Wwox-201ENSMUST00000004756 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ccl21cP86793 Map6-203ENSMUST00000122101 3233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ccl21cP86793 Lzts3-201ENSMUST00000045761 4201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ccl21cP86793 Gjd2-201ENSMUST00000090275 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ccl21cP86793 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ccl21cP86793 Serpinb2-201ENSMUST00000009356 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ccl21cP86793 Gm18626-201ENSMUST00000221512 1409 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Ccl21cP86793 Pcdhb18-201ENSMUST00000055949 5041 ntAPPRIS P1 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ccl21cP86793 Haus5-201ENSMUST00000019697 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ccl21cP86793 Psma3-202ENSMUST00000160027 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ccl21cP86793 Pank1-201ENSMUST00000036584 3460 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ccl21cP86793 Ubxn4-201ENSMUST00000027592 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ccl21cP86793 Ttc24-201ENSMUST00000050258 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ccl21cP86793 Slc16a6-202ENSMUST00000070152 4219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ccl21cP86793 Snx14-204ENSMUST00000165315 3109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ccl21cP86793 Snx10-201ENSMUST00000049152 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ccl21cP86793 Sept12-201ENSMUST00000170323 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ccl21cP86793 Clcn3-204ENSMUST00000110301 4099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ccl21cP86793 Gm10544-202ENSMUST00000181887 1923 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ccl21cP86793 Cdc42se1-204ENSMUST00000107201 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ccl21cP86793 Gm15573-201ENSMUST00000119487 540 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Ccl21cP86793 Gm12196-201ENSMUST00000120954 262 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Ccl21cP86793 Gm13073-201ENSMUST00000134059 486 ntTSL 3 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ccl21cP86793 Sh2d6-203ENSMUST00000159877 1210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ccl21cP86793 Sh2d6-206ENSMUST00000162561 1251 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ccl21cP86793 Rsph14-206ENSMUST00000166088 1203 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ccl21cP86793 H2-Q3-201ENSMUST00000172583 608 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Ccl21cP86793 Isl1-202ENSMUST00000176044 1198 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ccl21cP86793 Rsph14-207ENSMUST00000179546 1190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ccl21cP86793 Mir7221-201ENSMUST00000184009 72 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Ccl21cP86793 Gm42682-201ENSMUST00000198349 1265 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Ccl21cP86793 4933408A14Rik-201ENSMUST00000199037 729 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ccl21cP86793 Gm34728-201ENSMUST00000201510 414 ntTSL 3 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ccl21cP86793 Gm44593-201ENSMUST00000208372 1249 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ccl21cP86793 Gm31479-201ENSMUST00000209936 522 ntTSL 3 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ccl21cP86793 Gm3028-201ENSMUST00000213805 1119 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Ccl21cP86793 Pym1-203ENSMUST00000218218 1143 ntTSL 3 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ccl21cP86793 Gm270-201ENSMUST00000223010 976 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Ccl21cP86793 AC163667.3-201ENSMUST00000225774 222 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Ccl21cP86793 Nmur1-201ENSMUST00000027440 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ccl21cP86793 Tm2d3-201ENSMUST00000032726 908 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ccl21cP86793 Omt2b-201ENSMUST00000043734 735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ccl21cP86793 Gm11555-201ENSMUST00000073126 492 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ccl21cP86793 Kcnd3-201ENSMUST00000079169 2102 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ccl21cP86793 Rsph14-201ENSMUST00000009214 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ccl21cP86793 Afg3l2-201ENSMUST00000025408 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ccl21cP86793 Abcc6-201ENSMUST00000002850 4974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ccl21cP86793 Gm10785-201ENSMUST00000156242 1583 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ccl21cP86793 Spcs2-201ENSMUST00000036274 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ccl21cP86793 H2-Ob-202ENSMUST00000167280 1878 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ccl21cP86793 Klhl12-202ENSMUST00000112232 3220 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ccl21cP86793 Plekha4-201ENSMUST00000051810 2660 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ccl21cP86793 Pgr-204ENSMUST00000189181 6889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ccl21cP86793 Mmp2-201ENSMUST00000034187 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ccl21cP86793 Igf2os-203ENSMUST00000141681 4778 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Ccl21cP86793 Hhatl-202ENSMUST00000163981 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Ccl21cP86793 Thegl-201ENSMUST00000031161 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Ccl21cP86793 Slc25a25-204ENSMUST00000113308 2643 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Ccl21cP86793 Nfasc-208ENSMUST00000188307 3049 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Ccl21cP86793 Nipa2-204ENSMUST00000119201 3925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Ccl21cP86793 Fzd6-202ENSMUST00000179165 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Ccl21cP86793 Mau2-202ENSMUST00000168013 5323 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Ccl21cP86793 Chst10-205ENSMUST00000193441 4999 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Ccl21cP86793 Fbxo21-206ENSMUST00000202447 3959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Ccl21cP86793 Nsun7-203ENSMUST00000201100 2775 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Ccl21cP86793 Gm45133-201ENSMUST00000207548 2773 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Ccl21cP86793 Cdkn1b-201ENSMUST00000003115 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Ccl21cP86793 Tuft1-203ENSMUST00000196655 2156 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Ccl21cP86793 Epb41-207ENSMUST00000105975 5235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Ccl21cP86793 Gm9129-201ENSMUST00000218173 1689 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Ccl21cP86793 Yaf2-201ENSMUST00000080299 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.6 ms