Protein–RNA interactions for Protein: P83917

Cbx1, Chromobox protein homolog 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 185 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cbx1P83917 Tspan18-202ENSMUST00000111265 3751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Cbx1P83917 Gm19792-201ENSMUST00000222522 2021 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Cbx1P83917 Scn5a-201ENSMUST00000065196 8287 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Cbx1P83917 Glod4-201ENSMUST00000017430 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Cbx1P83917 Trpv3-201ENSMUST00000049676 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Cbx1P83917 Triml2-203ENSMUST00000209872 1395 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Cbx1P83917 Psmb10-201ENSMUST00000034369 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Cbx1P83917 D130043K22Rik-201ENSMUST00000006893 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Cbx1P83917 Avpr2-201ENSMUST00000033765 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Cbx1P83917 Gpatch2l-204ENSMUST00000221368 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Cbx1P83917 Speg-202ENSMUST00000113587 1254 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Cbx1P83917 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Cbx1P83917 9430038I01Rik-202ENSMUST00000117404 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Cbx1P83917 Gm1401-201ENSMUST00000122048 772 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Cbx1P83917 Hoxa7-203ENSMUST00000140316 643 ntTSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Cbx1P83917 1190007I07Rik-202ENSMUST00000176200 586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Cbx1P83917 Sap25-206ENSMUST00000177466 1005 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Cbx1P83917 Rps13-ps1-201ENSMUST00000183478 538 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Cbx1P83917 Gm19931-201ENSMUST00000198920 368 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Cbx1P83917 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Cbx1P83917 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Cbx1P83917 AC169036.1-201ENSMUST00000227994 296 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Cbx1P83917 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Cbx1P83917 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Cbx1P83917 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Cbx1P83917 Esr1-201ENSMUST00000067086 4344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Cbx1P83917 Plekhg4-201ENSMUST00000014927 4167 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Cbx1P83917 Apc2-201ENSMUST00000020349 9074 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Cbx1P83917 Sell-201ENSMUST00000027871 2199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Cbx1P83917 Gm26684-202ENSMUST00000228229 8257 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Cbx1P83917 Srsf6-203ENSMUST00000130411 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Cbx1P83917 Zfp41-204ENSMUST00000161785 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Cbx1P83917 Ccdc97-201ENSMUST00000002683 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Cbx1P83917 Rnf220-201ENSMUST00000030439 3029 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Cbx1P83917 Cdrt4os1-201ENSMUST00000130177 2090 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Cbx1P83917 Col18a1-203ENSMUST00000105409 4791 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Cbx1P83917 Cdk10-212ENSMUST00000213005 1580 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Cbx1P83917 Pdik1l-201ENSMUST00000061234 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Cbx1P83917 Pex19-201ENSMUST00000075895 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Cbx1P83917 Dnmt3c-201ENSMUST00000119996 2223 ntAPPRIS P1 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Cbx1P83917 Megf11-201ENSMUST00000068967 6680 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Cbx1P83917 Bckdk-201ENSMUST00000071056 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Cbx1P83917 Natd1-201ENSMUST00000019075 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Cbx1P83917 Zfp30-202ENSMUST00000122387 3342 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Cbx1P83917 Slc45a3-201ENSMUST00000027695 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Cbx1P83917 Gm43172-201ENSMUST00000202139 2137 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Cbx1P83917 Sdr9c7-201ENSMUST00000047134 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Cbx1P83917 Gaa-203ENSMUST00000106259 3633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Cbx1P83917 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Cbx1P83917 Gm37422-201ENSMUST00000193794 4718 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Cbx1P83917 Stom-201ENSMUST00000028241 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Cbx1P83917 Pigm-201ENSMUST00000052455 7554 ntAPPRIS P1 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Cbx1P83917 Rftn2-202ENSMUST00000114428 2012 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Cbx1P83917 Atad2-201ENSMUST00000038194 5684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Cbx1P83917 1190007I07Rik-205ENSMUST00000185168 469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Cbx1P83917 Gm29520-201ENSMUST00000191209 1067 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Cbx1P83917 Gm2272-201ENSMUST00000194903 582 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Cbx1P83917 Gm13830-205ENSMUST00000201195 1155 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Cbx1P83917 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Cbx1P83917 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Cbx1P83917 AC154757.1-201ENSMUST00000228289 336 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Cbx1P83917 Chmp2a-201ENSMUST00000005711 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Cbx1P83917 Kirrel3-209ENSMUST00000190549 3074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Cbx1P83917 Gm6756-201ENSMUST00000180647 1620 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Cbx1P83917 Sfrp4-203ENSMUST00000222464 4049 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Cbx1P83917 Itgb2-201ENSMUST00000000299 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Cbx1P83917 Tube1-201ENSMUST00000019991 2929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Cbx1P83917 Recql4-201ENSMUST00000036852 3922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Cbx1P83917 Gm42913-201ENSMUST00000197936 1853 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Cbx1P83917 Ntng2-202ENSMUST00000071201 1881 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Cbx1P83917 Chmp5-201ENSMUST00000030128 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Cbx1P83917 Rsph10b-203ENSMUST00000166847 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Cbx1P83917 Dram1-201ENSMUST00000020249 2807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Cbx1P83917 Map4-206ENSMUST00000169851 3446 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Cbx1P83917 Ddx54-201ENSMUST00000031598 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Cbx1P83917 Srrt-201ENSMUST00000040873 3024 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Cbx1P83917 Dctn1-205ENSMUST00000113919 4292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Cbx1P83917 Acvrl1-201ENSMUST00000000542 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Cbx1P83917 Rnf170-201ENSMUST00000014022 3929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Cbx1P83917 Gtf3c1-201ENSMUST00000055506 6961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Cbx1P83917 Furin-201ENSMUST00000107362 4166 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Cbx1P83917 Pcdhga3-201ENSMUST00000073447 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Cbx1P83917 Ces2d-ps-201ENSMUST00000043209 1656 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Cbx1P83917 Fgl2-201ENSMUST00000035799 3788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Cbx1P83917 Abat-201ENSMUST00000065987 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Cbx1P83917 Ugt1a10-201ENSMUST00000113142 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Cbx1P83917 Cyyr1-201ENSMUST00000114174 5464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Cbx1P83917 Slc35g3-201ENSMUST00000102586 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Cbx1P83917 Brms1-201ENSMUST00000116567 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Cbx1P83917 Gm3928-201ENSMUST00000121141 1307 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Cbx1P83917 Gm5366-201ENSMUST00000215494 1338 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Cbx1P83917 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Cbx1P83917 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Cbx1P83917 Ccdc71-201ENSMUST00000061209 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Cbx1P83917 Dnajb4-204ENSMUST00000144950 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Cbx1P83917 Apbb2-216ENSMUST00000162366 6540 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Cbx1P83917 Bbof1-201ENSMUST00000081828 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Cbx1P83917 Man2b2-201ENSMUST00000031002 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Cbx1P83917 Ica1-204ENSMUST00000115520 1876 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Cbx1P83917 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
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