Protein–RNA interactions for Protein: P81067

Irx3, Iroquois-class homeodomain protein IRX-3, mousemouse

Predictions only

Length 507 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irx3P81067 Zfp772-201ENSMUST00000074455 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Irx3P81067 Gm21038-201ENSMUST00000222205 1383 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Irx3P81067 Yae1d1-204ENSMUST00000222796 1382 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Irx3P81067 Rpsa-201ENSMUST00000035105 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Irx3P81067 Vezf1-201ENSMUST00000018521 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Irx3P81067 Rp2-202ENSMUST00000115387 4498 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Irx3P81067 Sgo2a-201ENSMUST00000027202 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Irx3P81067 Cd99l2-204ENSMUST00000114587 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Irx3P81067 Mkl2-203ENSMUST00000115809 667 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Irx3P81067 4933427G23Rik-202ENSMUST00000126393 544 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Irx3P81067 Tldc2-202ENSMUST00000166140 639 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Irx3P81067 Gm20652-201ENSMUST00000177314 383 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Irx3P81067 1700037C18Rik-205ENSMUST00000177323 915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Irx3P81067 Gm8565-201ENSMUST00000183259 1014 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Irx3P81067 Gm29152-201ENSMUST00000189284 325 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Irx3P81067 Gm44608-201ENSMUST00000206827 855 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Irx3P81067 Gm40466-201ENSMUST00000212174 422 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Irx3P81067 AC139350.3-201ENSMUST00000226151 420 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Irx3P81067 Rdh5-201ENSMUST00000026406 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Irx3P81067 Ak4-201ENSMUST00000102780 4186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Irx3P81067 Gm10419-202ENSMUST00000196693 2530 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Irx3P81067 Eme1-201ENSMUST00000039949 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Irx3P81067 Saraf-201ENSMUST00000033933 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Irx3P81067 Pcdh8-204ENSMUST00000195355 3704 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Irx3P81067 Gm13050-201ENSMUST00000122149 1345 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Irx3P81067 Fer-202ENSMUST00000038080 2365 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Irx3P81067 Gm36356-201ENSMUST00000209224 2277 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Irx3P81067 AC114543.1-201ENSMUST00000226451 1558 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Irx3P81067 Cuedc2-201ENSMUST00000051234 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Irx3P81067 Sorcs1-206ENSMUST00000209783 3489 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Irx3P81067 Knop1-203ENSMUST00000106549 1467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Irx3P81067 Sema6d-206ENSMUST00000103239 6225 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Irx3P81067 Zscan22-203ENSMUST00000119989 2087 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Irx3P81067 Neu2-203ENSMUST00000164128 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Irx3P81067 Pbxip1-201ENSMUST00000038942 4479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Irx3P81067 Pdcd6ip-201ENSMUST00000035086 5951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Irx3P81067 Gm12485-201ENSMUST00000119641 291 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Irx3P81067 Fcrl1-204ENSMUST00000191666 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Irx3P81067 Fxr1-204ENSMUST00000197694 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Irx3P81067 Gm42442-201ENSMUST00000197951 1133 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Irx3P81067 Gm43403-202ENSMUST00000198830 370 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Irx3P81067 Chd3os-203ENSMUST00000218008 1026 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Irx3P81067 Gm36634-201ENSMUST00000218356 1259 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Irx3P81067 Net1-207ENSMUST00000223258 597 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Irx3P81067 Ackr4-202ENSMUST00000076147 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Irx3P81067 Ldha-214ENSMUST00000210815 1535 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Irx3P81067 Sh3bp4-201ENSMUST00000066279 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Irx3P81067 Adamts14-202ENSMUST00000120336 3645 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Irx3P81067 Slc25a46-201ENSMUST00000060396 4371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Irx3P81067 Sh3bp5l-202ENSMUST00000116376 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Irx3P81067 Apol7a-201ENSMUST00000010745 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Irx3P81067 Pdlim7-201ENSMUST00000046246 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Irx3P81067 Gab3-201ENSMUST00000037374 2153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Irx3P81067 Naaa-201ENSMUST00000113102 2414 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Irx3P81067 Ccdc81-201ENSMUST00000041195 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Irx3P81067 Adamts7-207ENSMUST00000147250 4833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Irx3P81067 Ndrg2-201ENSMUST00000004673 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Irx3P81067 Zfp142-203ENSMUST00000113737 7473 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Irx3P81067 Gabbr1-203ENSMUST00000172792 4036 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Irx3P81067 Rbms2-201ENSMUST00000092033 1481 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Irx3P81067 Zscan10-202ENSMUST00000115509 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Irx3P81067 Nek4-201ENSMUST00000050171 2793 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Irx3P81067 Klf11-201ENSMUST00000020982 4086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Irx3P81067 Cacna1g-202ENSMUST00000100561 8125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Irx3P81067 Slc38a11-201ENSMUST00000112420 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Irx3P81067 Aire-207ENSMUST00000140636 1615 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Irx3P81067 Sumf2-204ENSMUST00000171300 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Irx3P81067 Gm26878-201ENSMUST00000181778 1644 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Irx3P81067 Kdm4d-201ENSMUST00000058796 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Irx3P81067 Bcl11a-201ENSMUST00000000881 3061 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Irx3P81067 Crybg1-202ENSMUST00000200401 7525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Irx3P81067 Fam71f1-204ENSMUST00000166462 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Irx3P81067 Gm18222-201ENSMUST00000202416 1387 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Irx3P81067 Gm37015-201ENSMUST00000192763 1521 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Irx3P81067 Hexim2-201ENSMUST00000062530 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Irx3P81067 2810047C21Rik1-202ENSMUST00000210322 1179 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Irx3P81067 Gm6983-201ENSMUST00000214912 628 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Irx3P81067 Oit1-201ENSMUST00000022269 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Irx3P81067 AC154171.1-201ENSMUST00000224610 643 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Irx3P81067 AC102291.3-201ENSMUST00000226566 405 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Irx3P81067 Cracr2a-201ENSMUST00000071563 1094 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Irx3P81067 C2cd4c-201ENSMUST00000059699 6729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Irx3P81067 Tor1aip2-207ENSMUST00000128941 2925 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Irx3P81067 Snx13-201ENSMUST00000048519 6231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Irx3P81067 Aifm3-201ENSMUST00000023448 2688 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Irx3P81067 Atxn10-201ENSMUST00000163242 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Irx3P81067 Matr3-206ENSMUST00000187389 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Irx3P81067 Pcdhb1-201ENSMUST00000052366 2588 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Irx3P81067 Tnn-202ENSMUST00000131919 3987 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Irx3P81067 Mgll-207ENSMUST00000163271 3991 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Irx3P81067 Adcyap1r1-208ENSMUST00000172084 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Irx3P81067 Tnrc6c-201ENSMUST00000026658 8724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Irx3P81067 Ildr1-203ENSMUST00000119464 2878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Irx3P81067 Ifnar2-201ENSMUST00000023693 3047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Irx3P81067 Mvk-202ENSMUST00000112239 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Irx3P81067 Arhgap25-202ENSMUST00000101197 2493 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Irx3P81067 Kcnj12-203ENSMUST00000108717 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Irx3P81067 Ank2-203ENSMUST00000182008 2474 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Irx3P81067 Adgrl1-204ENSMUST00000131717 5152 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Irx3P81067 Ltbp2-203ENSMUST00000163189 6470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.2 ms