Protein–RNA interactions for Protein: P59240

Nphp4, Nephrocystin-4, mousemouse

Predictions only

Length 1,425 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nphp4P59240 Alppl2-202ENSMUST00000188310 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Nphp4P59240 Dnm2-201ENSMUST00000072362 3502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Nphp4P59240 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Nphp4P59240 Fbxl12-202ENSMUST00000086459 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Nphp4P59240 Spred1-201ENSMUST00000028829 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Nphp4P59240 Abhd6-201ENSMUST00000026313 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Nphp4P59240 4632404H12Rik-201ENSMUST00000038450 2791 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Nphp4P59240 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Nphp4P59240 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Nphp4P59240 Pcnx2-204ENSMUST00000131127 3782 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Nphp4P59240 Gm12690-201ENSMUST00000132108 354 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Nphp4P59240 Gm11379-201ENSMUST00000154678 381 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Nphp4P59240 Atp10d-206ENSMUST00000169617 761 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Nphp4P59240 Rpl41-206ENSMUST00000177163 544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Nphp4P59240 Gm2453-202ENSMUST00000195508 568 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Nphp4P59240 AC153974.2-201ENSMUST00000218577 1025 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Nphp4P59240 Abracl-204ENSMUST00000220110 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Nphp4P59240 Olfr1347-205ENSMUST00000220413 964 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Nphp4P59240 Olfr1347-201ENSMUST00000036357 964 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Nphp4P59240 1700028J19Rik-201ENSMUST00000037220 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Nphp4P59240 Olfr117-201ENSMUST00000073636 954 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Nphp4P59240 Olfr130-201ENSMUST00000087129 954 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Nphp4P59240 Slc25a15-201ENSMUST00000033871 3430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Nphp4P59240 Hmg20a-204ENSMUST00000214869 1782 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Nphp4P59240 Npc2-201ENSMUST00000021668 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Nphp4P59240 Vamp8-202ENSMUST00000142613 2076 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Nphp4P59240 Kcnk13-202ENSMUST00000160413 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Nphp4P59240 Stxbp1-201ENSMUST00000050000 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Nphp4P59240 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Nphp4P59240 Arhgef37-201ENSMUST00000171629 3234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Nphp4P59240 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Nphp4P59240 Atg16l1-202ENSMUST00000113186 3004 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Nphp4P59240 Gm21982-201ENSMUST00000146232 3821 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Nphp4P59240 Cyp2j13-203ENSMUST00000107078 1493 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Nphp4P59240 Izumo1-201ENSMUST00000033100 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Nphp4P59240 Osbpl8-201ENSMUST00000095310 3622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Nphp4P59240 Sfxn3-202ENSMUST00000084493 2843 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Nphp4P59240 Hao1-201ENSMUST00000028704 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Nphp4P59240 Zfp954-201ENSMUST00000056246 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Nphp4P59240 Gm37691-201ENSMUST00000192147 2573 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Nphp4P59240 Suv39h1-203ENSMUST00000115638 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Nphp4P59240 Ephb2-201ENSMUST00000059287 4804 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Nphp4P59240 Hsd3b6-202ENSMUST00000170847 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Nphp4P59240 Anapc11-201ENSMUST00000026128 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Nphp4P59240 5730416F02Rik-201ENSMUST00000120648 812 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Nphp4P59240 Platr29-201ENSMUST00000130022 830 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Nphp4P59240 3110056K07Rik-202ENSMUST00000136690 1063 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Nphp4P59240 Gm17040-201ENSMUST00000168672 548 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Nphp4P59240 Abhd14a-203ENSMUST00000171925 1122 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Nphp4P59240 AU022133-201ENSMUST00000200601 873 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Nphp4P59240 Gm3786-201ENSMUST00000202659 378 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Nphp4P59240 Igfals-201ENSMUST00000050714 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Nphp4P59240 Olfr605-201ENSMUST00000080660 1011 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Nphp4P59240 Cox5a-201ENSMUST00000000090 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Nphp4P59240 Rhobtb1-205ENSMUST00000164034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Nphp4P59240 Cldn15-201ENSMUST00000001790 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Nphp4P59240 Inpp4a-209ENSMUST00000140264 3676 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Nphp4P59240 Mocos-201ENSMUST00000068006 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Nphp4P59240 Galnt2-201ENSMUST00000034458 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Nphp4P59240 Pnp2-201ENSMUST00000095925 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Nphp4P59240 Gigyf1-201ENSMUST00000031727 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Nphp4P59240 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Nphp4P59240 Crem-233ENSMUST00000154135 2530 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Nphp4P59240 Wfdc8-201ENSMUST00000094351 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Nphp4P59240 Lrrc8d-201ENSMUST00000060531 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Nphp4P59240 Gm43721-201ENSMUST00000199677 2313 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Nphp4P59240 Gm11568-201ENSMUST00000107434 1145 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Nphp4P59240 Dynlrb1-202ENSMUST00000109682 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Nphp4P59240 Rpl28-ps3-201ENSMUST00000116058 393 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Nphp4P59240 Zfp36l1-ps-201ENSMUST00000118349 899 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Nphp4P59240 Tmem40-205ENSMUST00000166254 811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Nphp4P59240 Ighv8-4-201ENSMUST00000178949 294 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Nphp4P59240 1700125G22Rik-201ENSMUST00000181124 861 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Nphp4P59240 Rps13-ps2-201ENSMUST00000182017 453 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Nphp4P59240 H2-Bl-202ENSMUST00000183560 316 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Nphp4P59240 AC107638.1-201ENSMUST00000213690 1061 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Nphp4P59240 Gm18730-201ENSMUST00000218038 343 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Nphp4P59240 Ankrd2-201ENSMUST00000026172 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Nphp4P59240 Phyhd1-212ENSMUST00000154647 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Nphp4P59240 Styxl1-208ENSMUST00000178515 1651 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Nphp4P59240 Il1rn-204ENSMUST00000114487 2474 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Nphp4P59240 0610040F04Rik-201ENSMUST00000137478 1734 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Nphp4P59240 Car14-201ENSMUST00000036181 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Nphp4P59240 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Nphp4P59240 Tigd2-201ENSMUST00000062626 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Nphp4P59240 Olfr1420-201ENSMUST00000072784 1444 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Nphp4P59240 Fgd4-211ENSMUST00000162671 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Nphp4P59240 1700030J22Rik-202ENSMUST00000213068 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Nphp4P59240 Ccdc126-202ENSMUST00000114491 2372 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Nphp4P59240 Rasd2-202ENSMUST00000139848 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Nphp4P59240 Syt13-201ENSMUST00000028648 3761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Nphp4P59240 Grin1-204ENSMUST00000114310 4276 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Nphp4P59240 Nudt5-205ENSMUST00000179748 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Nphp4P59240 Nup88-201ENSMUST00000035283 2450 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Nphp4P59240 Hectd2-201ENSMUST00000047247 4731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Nphp4P59240 Endod1-201ENSMUST00000167549 4470 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Nphp4P59240 Pex3-201ENSMUST00000019945 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Nphp4P59240 Ccdc183-201ENSMUST00000028309 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Nphp4P59240 Rhot1-202ENSMUST00000055056 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Nphp4P59240 Clca2-203ENSMUST00000198993 2774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.2 ms