Protein–RNA interactions for Protein: P49446

Ptpre, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase epsilon, mousemouse

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Length 699 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtpreP49446 Rap1a-ps2-201ENSMUST00000118467 559 ntBASIC14.31□□□□□ -0.12
PtpreP49446 Gm11331-201ENSMUST00000119764 288 ntBASIC14.31□□□□□ -0.12
PtpreP49446 Gm13461-201ENSMUST00000120980 662 ntBASIC14.31□□□□□ -0.12
PtpreP49446 Gm25043-201ENSMUST00000158604 212 ntBASIC14.31□□□□□ -0.12
PtpreP49446 Fam168a-206ENSMUST00000208013 1129 ntTSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
PtpreP49446 AC110091.1-201ENSMUST00000216004 691 ntTSL 3 BASIC14.31□□□□□ -0.12
PtpreP49446 Fut9-202ENSMUST00000108199 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
PtpreP49446 Tbc1d5-205ENSMUST00000224528 4764 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.31□□□□□ -0.12
PtpreP49446 Nup93-201ENSMUST00000079961 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
PtpreP49446 Arhgef5-201ENSMUST00000031750 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
PtpreP49446 Nptn-206ENSMUST00000176557 1898 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
PtpreP49446 Glud1-201ENSMUST00000022322 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
PtpreP49446 D330025C20Rik-201ENSMUST00000191632 3046 ntBASIC14.31□□□□□ -0.12
PtpreP49446 AI593442-203ENSMUST00000213937 5674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.3□□□□□ -0.12
PtpreP49446 Kyat1-204ENSMUST00000113661 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
PtpreP49446 4930429D17Rik-201ENSMUST00000198193 1624 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
PtpreP49446 Kars-203ENSMUST00000164470 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
PtpreP49446 Gm42928-201ENSMUST00000197338 3339 ntBASIC14.3□□□□□ -0.12
PtpreP49446 Tnk2-201ENSMUST00000115120 2794 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
PtpreP49446 Hdgfl2-210ENSMUST00000225843 2238 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.3□□□□□ -0.12
PtpreP49446 4933416C03Rik-201ENSMUST00000099261 2254 ntAPPRIS P1 BASIC14.3□□□□□ -0.12
PtpreP49446 Ctbs-202ENSMUST00000061937 2892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
PtpreP49446 Dclk2-206ENSMUST00000193632 2336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
PtpreP49446 Pcdha1-202ENSMUST00000193839 4925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
PtpreP49446 Usf1-207ENSMUST00000160486 1878 ntTSL 2 BASIC14.3□□□□□ -0.12
PtpreP49446 Matr3-206ENSMUST00000187389 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
PtpreP49446 Cela2a-201ENSMUST00000102481 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
PtpreP49446 Cdc26-202ENSMUST00000107459 654 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.3□□□□□ -0.12
PtpreP49446 Cyb5d1-202ENSMUST00000108660 1034 ntTSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
PtpreP49446 Tpm1-207ENSMUST00000113687 962 ntTSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
PtpreP49446 Rps19-ps11-201ENSMUST00000160308 433 ntBASIC14.3□□□□□ -0.12
PtpreP49446 Gm3625-201ENSMUST00000170816 102 ntAPPRIS P1 BASIC14.3□□□□□ -0.12
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PtpreP49446 Eloc-207ENSMUST00000187910 620 ntTSL 2 BASIC14.3□□□□□ -0.12
PtpreP49446 Gm28411-201ENSMUST00000189864 341 ntTSL 3 BASIC14.3□□□□□ -0.12
PtpreP49446 Net1-206ENSMUST00000222504 447 ntTSL 3 BASIC14.3□□□□□ -0.12
PtpreP49446 AC166095.1-201ENSMUST00000223731 1241 ntBASIC14.3□□□□□ -0.12
PtpreP49446 Inhba-201ENSMUST00000042603 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
PtpreP49446 Olfr524-201ENSMUST00000051943 1058 ntAPPRIS P1 BASIC14.3□□□□□ -0.12
PtpreP49446 Asphd1-201ENSMUST00000052937 730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
PtpreP49446 Olfr368-201ENSMUST00000053990 985 ntAPPRIS P1 BASIC14.3□□□□□ -0.12
PtpreP49446 Prr15l-202ENSMUST00000062172 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
PtpreP49446 Hid1-201ENSMUST00000044152 3236 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
PtpreP49446 Emilin2-201ENSMUST00000024849 3910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
PtpreP49446 Cul5-209ENSMUST00000166367 5942 ntTSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
PtpreP49446 Ltbp4-201ENSMUST00000038618 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
PtpreP49446 Poli-205ENSMUST00000161542 2736 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
PtpreP49446 Tmem131l-202ENSMUST00000191758 5555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
PtpreP49446 Ctbp1-212ENSMUST00000202962 3595 ntTSL 2 BASIC14.3□□□□□ -0.12
PtpreP49446 Pip5k1c-201ENSMUST00000045469 4323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
PtpreP49446 1700065D16Rik-205ENSMUST00000190890 2903 ntBASIC14.3□□□□□ -0.12
PtpreP49446 Gm43908-201ENSMUST00000205074 1472 ntBASIC14.3□□□□□ -0.12
PtpreP49446 Tmprss11d-202ENSMUST00000122377 2256 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
PtpreP49446 Atp13a2-203ENSMUST00000127833 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
PtpreP49446 Gm13857-203ENSMUST00000150561 2337 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
PtpreP49446 Mief1-201ENSMUST00000023048 5081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
PtpreP49446 Slc25a15-201ENSMUST00000033871 3430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
PtpreP49446 Chp1-201ENSMUST00000014221 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
PtpreP49446 Mcm9-206ENSMUST00000220007 3513 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
PtpreP49446 Zfp367-201ENSMUST00000059817 3532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
PtpreP49446 Cplx4-201ENSMUST00000025397 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
PtpreP49446 Usp18-201ENSMUST00000032198 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
PtpreP49446 Pde9a-203ENSMUST00000127929 1891 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
PtpreP49446 Frmpd4-204ENSMUST00000112149 8456 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
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PtpreP49446 Ablim1-202ENSMUST00000099294 6232 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
PtpreP49446 Arhgef4-201ENSMUST00000047664 3287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
PtpreP49446 Litaf-201ENSMUST00000023143 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
PtpreP49446 Speg-205ENSMUST00000113590 3393 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
PtpreP49446 Pou4f3-201ENSMUST00000025374 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
PtpreP49446 Prkcq-201ENSMUST00000028118 3583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
PtpreP49446 Syt12-201ENSMUST00000059295 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
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PtpreP49446 Il6ra-202ENSMUST00000197679 8639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
PtpreP49446 Clic6-201ENSMUST00000023670 3758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
PtpreP49446 Bnip3l-ps-201ENSMUST00000101577 657 ntBASIC14.29□□□□□ -0.12
PtpreP49446 Gm11596-201ENSMUST00000105058 1079 ntAPPRIS P1 BASIC14.29□□□□□ -0.12
PtpreP49446 Tpm1-210ENSMUST00000113693 1054 ntTSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
PtpreP49446 Pla2g10-202ENSMUST00000115807 964 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
PtpreP49446 2810403D21Rik-207ENSMUST00000152089 852 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
PtpreP49446 Gm454-201ENSMUST00000160126 751 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
PtpreP49446 Gm9061-201ENSMUST00000182707 1006 ntBASIC14.29□□□□□ -0.12
PtpreP49446 Mir124-2hg-207ENSMUST00000189868 535 ntTSL 2 BASIC14.29□□□□□ -0.12
PtpreP49446 AC124742.1-201ENSMUST00000219909 547 ntTSL 3 BASIC14.29□□□□□ -0.12
PtpreP49446 Bnip3l-ps-202ENSMUST00000220709 1132 ntBASIC14.29□□□□□ -0.12
PtpreP49446 Kcnk7-201ENSMUST00000052448 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
PtpreP49446 Tnni3-201ENSMUST00000098859 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
PtpreP49446 Pcca-201ENSMUST00000038374 2592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
PtpreP49446 Gm3287-205ENSMUST00000228893 1332 ntBASIC14.29□□□□□ -0.12
PtpreP49446 Il12rb1-205ENSMUST00000212657 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
PtpreP49446 C130071C03Rik-203ENSMUST00000182788 1368 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
PtpreP49446 Hk2-204ENSMUST00000170833 2792 ntTSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
PtpreP49446 Det1-202ENSMUST00000107431 1439 ntTSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
PtpreP49446 Gigyf2-201ENSMUST00000027475 5724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
PtpreP49446 Zbtb5-201ENSMUST00000055028 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
PtpreP49446 Nhs-202ENSMUST00000087085 8805 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
PtpreP49446 Mtmr2-208ENSMUST00000155679 3088 ntTSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
PtpreP49446 Wdr25-206ENSMUST00000221510 1600 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
PtpreP49446 Prrt3-202ENSMUST00000204134 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
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