Protein–RNA interactions for Protein: P37913

Lig1, DNA ligase 1, mousemouse

Predictions only

Length 916 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lig1P37913 Mtch2-211ENSMUST00000150232 2377 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Lig1P37913 Gm45706-201ENSMUST00000213063 2136 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Lig1P37913 Rcbtb2-202ENSMUST00000110952 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Lig1P37913 Gm5466-201ENSMUST00000119395 1890 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Lig1P37913 Nbeal2-206ENSMUST00000133191 8782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Lig1P37913 Srsf1-205ENSMUST00000139129 5362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Lig1P37913 Mob1a-202ENSMUST00000055261 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Lig1P37913 0610010F05Rik-208ENSMUST00000180260 4128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Lig1P37913 Cd33-201ENSMUST00000004728 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Lig1P37913 4930429D17Rik-201ENSMUST00000198193 1624 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Lig1P37913 Nup93-201ENSMUST00000079961 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Lig1P37913 Mroh1-202ENSMUST00000096385 5268 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Lig1P37913 Gm25214-201ENSMUST00000104573 129 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Lig1P37913 Ccdc28b-202ENSMUST00000106035 821 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Lig1P37913 Gm14130-201ENSMUST00000118417 987 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Lig1P37913 Tmem205-202ENSMUST00000178988 862 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Lig1P37913 1700034G24Rik-202ENSMUST00000183186 1081 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Lig1P37913 Dmrt1i-203ENSMUST00000197311 718 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Lig1P37913 Gm45339-201ENSMUST00000210823 877 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Lig1P37913 Gm45925-201ENSMUST00000218882 744 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Lig1P37913 Prss39-201ENSMUST00000027299 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Lig1P37913 Tnnt3-201ENSMUST00000074187 1007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Lig1P37913 Gm10131-201ENSMUST00000080152 736 ntAPPRIS P1 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Lig1P37913 Fchsd1-201ENSMUST00000043437 4270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Lig1P37913 Bscl2-203ENSMUST00000159634 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Lig1P37913 Zfp429-201ENSMUST00000109732 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Lig1P37913 Leng8-203ENSMUST00000121270 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Lig1P37913 Rbl2-208ENSMUST00000209518 4792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Lig1P37913 Spred3-201ENSMUST00000048923 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Lig1P37913 Ifnar2-201ENSMUST00000023693 3047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Lig1P37913 Gm30725-201ENSMUST00000195170 1419 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Lig1P37913 Chfr-201ENSMUST00000014812 3146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Lig1P37913 Ccdc92b-201ENSMUST00000100866 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Lig1P37913 Gak-201ENSMUST00000046603 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Lig1P37913 Enpp5-203ENSMUST00000154166 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Lig1P37913 Cbarp-214ENSMUST00000169546 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Lig1P37913 Nek3-202ENSMUST00000110730 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Lig1P37913 Cbl-206ENSMUST00000206147 3452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Lig1P37913 Gspt1-205ENSMUST00000167571 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Lig1P37913 Gm11595-201ENSMUST00000107440 1200 ntAPPRIS P1 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Lig1P37913 Rps19-ps11-201ENSMUST00000160308 433 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Lig1P37913 Nme9-202ENSMUST00000163199 1196 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Lig1P37913 Gm26636-201ENSMUST00000181696 1115 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Lig1P37913 Bloc1s2-ps-201ENSMUST00000183232 432 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Lig1P37913 Gm3096-201ENSMUST00000185770 364 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Lig1P37913 Gm6652-201ENSMUST00000186414 1070 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Lig1P37913 Rps4l-202ENSMUST00000204242 789 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Lig1P37913 Gm32468-201ENSMUST00000214199 1040 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Lig1P37913 Ppcdc-207ENSMUST00000214339 738 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Lig1P37913 Hsd3b7-201ENSMUST00000046863 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Lig1P37913 Sirt2-201ENSMUST00000072965 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Lig1P37913 Gnas-204ENSMUST00000087877 3947 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Lig1P37913 Cd300lf-202ENSMUST00000106561 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Lig1P37913 Rab39-201ENSMUST00000068449 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Lig1P37913 Gga3-202ENSMUST00000106508 3582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Lig1P37913 5031415H12Rik-201ENSMUST00000181546 2481 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Lig1P37913 Ormdl1-201ENSMUST00000027266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Lig1P37913 Slc25a42-201ENSMUST00000063788 3081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Lig1P37913 Eif4ebp2-202ENSMUST00000167087 1422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Lig1P37913 Pcca-201ENSMUST00000038374 2592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Lig1P37913 Zfp541-202ENSMUST00000209369 4879 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Lig1P37913 Trim34a-202ENSMUST00000106848 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Lig1P37913 Nectin4-202ENSMUST00000094325 3245 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Lig1P37913 Ppp2r2b-203ENSMUST00000120632 2081 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Lig1P37913 Ap4b1-203ENSMUST00000106823 2741 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Lig1P37913 Dusp26-203ENSMUST00000161713 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Lig1P37913 Hps3-202ENSMUST00000108321 3385 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Lig1P37913 0610037L13Rik-207ENSMUST00000125107 1551 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Lig1P37913 Gm42688-201ENSMUST00000101253 3628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Lig1P37913 Chml-201ENSMUST00000104984 6905 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Lig1P37913 Chml-202ENSMUST00000209720 6905 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Lig1P37913 Zfp36l1-201ENSMUST00000021552 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Lig1P37913 Slc25a46-201ENSMUST00000060396 4371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Lig1P37913 Plcb2-202ENSMUST00000102524 5145 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Lig1P37913 Proser1-201ENSMUST00000058577 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Lig1P37913 Ucp3-201ENSMUST00000032958 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Lig1P37913 Rab15-201ENSMUST00000021459 3158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Lig1P37913 Abra-201ENSMUST00000054742 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Lig1P37913 Ssr1-203ENSMUST00000225246 1825 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Lig1P37913 Chrdl1-203ENSMUST00000112878 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Lig1P37913 Net1-201ENSMUST00000091853 2680 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Lig1P37913 Igsf9b-202ENSMUST00000133213 4239 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Lig1P37913 Gm10561-201ENSMUST00000181563 1943 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Lig1P37913 Slc4a5-201ENSMUST00000039212 5123 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Lig1P37913 Shisa3-201ENSMUST00000087241 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Lig1P37913 Gm14109-201ENSMUST00000118814 309 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Lig1P37913 Gm11851-201ENSMUST00000132219 692 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Lig1P37913 Cmtm1-201ENSMUST00000159039 1130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Lig1P37913 4833427G06Rik-201ENSMUST00000170947 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Lig1P37913 Gm27046-201ENSMUST00000182160 463 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Lig1P37913 Gm8885-201ENSMUST00000189382 598 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Lig1P37913 1700031P21Rik-203ENSMUST00000191400 466 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Lig1P37913 AA914427-201ENSMUST00000193194 1166 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Lig1P37913 AC164573.1-201ENSMUST00000218616 963 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Lig1P37913 CT009486.1-201ENSMUST00000222047 661 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Lig1P37913 Nit2-201ENSMUST00000023432 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Lig1P37913 Gm7002-201ENSMUST00000221386 2165 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Lig1P37913 Ccdc8-201ENSMUST00000094805 4809 ntAPPRIS P1 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Lig1P37913 Adh6a-202ENSMUST00000106247 1341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Lig1P37913 Tsta3-201ENSMUST00000023231 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.9 ms