Protein–RNA interactions for Protein: O35599

Opn1mw, Medium-wave-sensitive opsin 1, mousemouse

Predictions only

Length 359 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Opn1mwO35599 Gm44100-201ENSMUST00000204329 436 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
Opn1mwO35599 Aprt-203ENSMUST00000211823 590 ntTSL 3 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Opn1mwO35599 Rassf5-205ENSMUST00000212202 958 ntTSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Opn1mwO35599 1700023F06Rik-201ENSMUST00000021323 1199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Opn1mwO35599 AC153974.2-201ENSMUST00000218577 1025 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
Opn1mwO35599 Bnip3l-ps-202ENSMUST00000220709 1132 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
Opn1mwO35599 Il25-201ENSMUST00000037863 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Opn1mwO35599 Klk1b27-201ENSMUST00000079859 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Opn1mwO35599 Edil3-203ENSMUST00000118731 2721 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Opn1mwO35599 Ngef-201ENSMUST00000027477 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Opn1mwO35599 Cpne4-201ENSMUST00000057742 3959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Opn1mwO35599 Cacna1g-206ENSMUST00000107788 8050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Opn1mwO35599 Cacna1g-211ENSMUST00000107793 8071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Opn1mwO35599 Slc22a2-201ENSMUST00000046959 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Opn1mwO35599 Gm2115-201ENSMUST00000180387 7055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Opn1mwO35599 Steap2-203ENSMUST00000115425 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Opn1mwO35599 Fyn-206ENSMUST00000136659 1910 ntTSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Opn1mwO35599 Brsk1-202ENSMUST00000120836 2867 ntTSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Opn1mwO35599 Ate1-201ENSMUST00000033139 4735 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Opn1mwO35599 Enc1-201ENSMUST00000041623 4737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Opn1mwO35599 Otud4-203ENSMUST00000173286 7213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Opn1mwO35599 Strip2-201ENSMUST00000046028 5370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Opn1mwO35599 Gm42769-201ENSMUST00000198576 1659 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
Opn1mwO35599 Bbof1-201ENSMUST00000081828 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Opn1mwO35599 Gsdma2-201ENSMUST00000017355 1314 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Opn1mwO35599 Wdr45-223ENSMUST00000207675 1335 ntTSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Opn1mwO35599 AC110816.2-201ENSMUST00000220360 1323 ntTSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Opn1mwO35599 Gm12626-201ENSMUST00000117339 1983 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
Opn1mwO35599 Gm12623-201ENSMUST00000119849 1983 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
Opn1mwO35599 Prok2-203ENSMUST00000101120 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Opn1mwO35599 Kansl2-ps-201ENSMUST00000181818 1461 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
Opn1mwO35599 Gm5884-201ENSMUST00000036712 1479 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
Opn1mwO35599 4732463B04Rik-201ENSMUST00000180751 2932 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Opn1mwO35599 Osm-201ENSMUST00000075221 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Opn1mwO35599 Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 2739 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Opn1mwO35599 Men1-202ENSMUST00000078137 2738 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Opn1mwO35599 Ak1-202ENSMUST00000113277 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Opn1mwO35599 Gltp-202ENSMUST00000112212 799 ntTSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Opn1mwO35599 Gm12714-201ENSMUST00000143391 669 ntTSL 3 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Opn1mwO35599 Gm24749-201ENSMUST00000157838 343 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
Opn1mwO35599 Gm5070-201ENSMUST00000177599 862 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
Opn1mwO35599 S100a3-204ENSMUST00000200290 509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Opn1mwO35599 Gm43701-201ENSMUST00000202047 391 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Opn1mwO35599 Gm44136-201ENSMUST00000203819 1106 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
Opn1mwO35599 Gm31793-201ENSMUST00000218557 415 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Opn1mwO35599 1110017D15Rik-201ENSMUST00000030152 1114 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Opn1mwO35599 Abhd14a-201ENSMUST00000048685 1256 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Opn1mwO35599 Jph3-201ENSMUST00000026357 3637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Opn1mwO35599 Tulp2-201ENSMUST00000024233 1749 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Opn1mwO35599 Nfatc2-204ENSMUST00000109184 6828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Opn1mwO35599 Slc37a1-201ENSMUST00000165149 3354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Opn1mwO35599 Diaph3-202ENSMUST00000168889 4582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Opn1mwO35599 Diaph3-201ENSMUST00000022599 4582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Opn1mwO35599 AC154725.1-201ENSMUST00000224826 1961 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
Opn1mwO35599 Lime1-201ENSMUST00000048077 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Opn1mwO35599 Ptgir-201ENSMUST00000086101 2725 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Opn1mwO35599 Cnih4-203ENSMUST00000111059 3127 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Opn1mwO35599 Cxcl16-201ENSMUST00000019064 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Opn1mwO35599 Cdsn-201ENSMUST00000044804 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Opn1mwO35599 Zfp108-201ENSMUST00000072713 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Opn1mwO35599 Myadm-203ENSMUST00000203328 1899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Opn1mwO35599 Ddx42-201ENSMUST00000021046 4011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Opn1mwO35599 Tmem220-201ENSMUST00000061786 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Opn1mwO35599 Nup62-203ENSMUST00000207103 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Opn1mwO35599 Ighv5-4-201ENSMUST00000103444 425 ntAPPRIS P1 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Opn1mwO35599 R3hdml-201ENSMUST00000109416 1094 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Opn1mwO35599 Gsto2-202ENSMUST00000120645 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Opn1mwO35599 Gm15891-201ENSMUST00000127307 611 ntTSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Opn1mwO35599 Dnajb6-202ENSMUST00000012734 1024 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Opn1mwO35599 9430021M05Rik-201ENSMUST00000145985 1201 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Opn1mwO35599 Gm6963-201ENSMUST00000147879 379 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
Opn1mwO35599 Gm24845-201ENSMUST00000158034 109 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
Opn1mwO35599 Gm17227-202ENSMUST00000170286 1016 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Opn1mwO35599 Malat1-204ENSMUST00000173523 656 ntTSL 3 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Opn1mwO35599 Apoe-208ENSMUST00000174191 472 ntTSL 2 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Opn1mwO35599 Gm8546-201ENSMUST00000178288 1264 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
Opn1mwO35599 Gm28172-201ENSMUST00000189880 506 ntTSL 3 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Opn1mwO35599 Ighv5-7-201ENSMUST00000192302 244 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
Opn1mwO35599 Gm7003-201ENSMUST00000195089 312 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
Opn1mwO35599 Gm43584-201ENSMUST00000199762 605 ntTSL 3 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Opn1mwO35599 Gm3898-202ENSMUST00000216905 328 ntTSL 2 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Opn1mwO35599 Rps12-203ENSMUST00000218107 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Opn1mwO35599 Abracl-204ENSMUST00000220110 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Opn1mwO35599 Eml6-201ENSMUST00000058902 8083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Opn1mwO35599 6030458C11Rik-202ENSMUST00000227299 3206 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
Opn1mwO35599 Ahdc1-204ENSMUST00000105916 6602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Opn1mwO35599 Rnls-202ENSMUST00000163093 1378 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Opn1mwO35599 Slc3a2-207ENSMUST00000206598 1393 ntTSL 2 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Opn1mwO35599 Hcrtr1-203ENSMUST00000120154 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Opn1mwO35599 Socs3-201ENSMUST00000054002 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Opn1mwO35599 Zfp583-201ENSMUST00000062765 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Opn1mwO35599 Rcor2-202ENSMUST00000113369 2013 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Opn1mwO35599 Zfp146-201ENSMUST00000062181 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Opn1mwO35599 Ak4-201ENSMUST00000102780 4186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Opn1mwO35599 Rbm11-203ENSMUST00000114253 2699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Opn1mwO35599 Gm17518-201ENSMUST00000181232 1346 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Opn1mwO35599 Foxj2-202ENSMUST00000177927 4620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Opn1mwO35599 Tppp-201ENSMUST00000022057 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Opn1mwO35599 Vamp8-202ENSMUST00000142613 2076 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Opn1mwO35599 6030466F02Rik-201ENSMUST00000212339 1434 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 210.2 ms