Protein–RNA interactions for Protein: O14802

POLR3A, DNA-directed RNA polymerase III subunit RPC1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,390 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR3AO14802 AC012568.1-201ENST00000558463 472 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
POLR3AO14802 MIR3615-201ENST00000581999 87 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
POLR3AO14802 AC093326.2-201ENST00000640770 729 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
POLR3AO14802 FBXO18-201ENST00000362091 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
POLR3AO14802 DENND1A-203ENST00000373624 5010 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
POLR3AO14802 GDF2-201ENST00000581492 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
POLR3AO14802 PKP4-AS1-203ENST00000629904 1951 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.03
POLR3AO14802 KRT76-201ENST00000332411 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
POLR3AO14802 INPP5J-207ENST00000405300 2515 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
POLR3AO14802 SUSD2-201ENST00000358321 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
POLR3AO14802 PPP4R3A-208ENST00000555462 3236 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
POLR3AO14802 C12orf65-201ENST00000253233 2073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
POLR3AO14802 UBE3B-212ENST00000540230 1541 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
POLR3AO14802 KIFC2-201ENST00000301332 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
POLR3AO14802 BCL2-203ENST00000589955 5011 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
POLR3AO14802 USP32-201ENST00000300896 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
POLR3AO14802 MPP3-201ENST00000398389 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
POLR3AO14802 SERPINF2-203ENST00000450523 1462 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
POLR3AO14802 KIAA1324L-207ENST00000444627 3527 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
POLR3AO14802 PLEKHG5-201ENST00000340850 4715 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
POLR3AO14802 PLEKHG5-211ENST00000535355 4725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
POLR3AO14802 TXNDC11-202ENST00000356957 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
POLR3AO14802 CES3-203ENST00000543856 3178 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
POLR3AO14802 ZIC1-201ENST00000282928 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
POLR3AO14802 GLIS1-202ENST00000628545 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
POLR3AO14802 SUN1-204ENST00000403868 978 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
POLR3AO14802 C2orf27AP3-201ENST00000434123 579 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
POLR3AO14802 AL355994.3-201ENST00000437156 466 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
POLR3AO14802 PGAP2-209ENST00000464261 830 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
POLR3AO14802 CENPM-208ENST00000472374 541 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
POLR3AO14802 BANK1-207ENST00000508653 2115 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
POLR3AO14802 PLEKHB1-206ENST00000535129 1049 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
POLR3AO14802 GABARAPL1-217ENST00000545887 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
POLR3AO14802 DBNDD1-206ENST00000568838 993 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
POLR3AO14802 EGLN2-209ENST00000594140 991 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
POLR3AO14802 AC243960.2-201ENST00000600996 747 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
POLR3AO14802 AL354718.3-201ENST00000616414 581 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
POLR3AO14802 CR382287.1-201ENST00000623954 586 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
POLR3AO14802 KRT35-201ENST00000246639 1778 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
POLR3AO14802 EML2-203ENST00000536630 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
POLR3AO14802 CHI3L2-212ENST00000524472 1435 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
POLR3AO14802 HTR7P1-202ENST00000624664 4411 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
POLR3AO14802 MTA1-207ENST00000435036 2888 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
POLR3AO14802 HOXD3-201ENST00000249440 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
POLR3AO14802 CENPT-208ENST00000562787 2345 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
POLR3AO14802 SYBU-231ENST00000533065 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
POLR3AO14802 NSUN5-203ENST00000428206 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
POLR3AO14802 NRXN2-202ENST00000301894 3535 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
POLR3AO14802 TCAF2-203ENST00000425618 2448 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
POLR3AO14802 SUPT20HL2-201ENST00000486479 2409 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
POLR3AO14802 ATXN7-210ENST00000487717 3683 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
POLR3AO14802 FNBP1-203ENST00000443566 5227 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
POLR3AO14802 ALDH1A3-201ENST00000329841 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
POLR3AO14802 C1orf123-201ENST00000294360 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
POLR3AO14802 RAC2-202ENST00000401529 569 ntTSL 4 BASIC21.44■■□□□ 1.02
POLR3AO14802 GOLGA2P4-201ENST00000441462 777 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
POLR3AO14802 CRISPLD2-210ENST00000569090 808 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
POLR3AO14802 TBC1D26-206ENST00000579428 1583 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
POLR3AO14802 AC129510.1-201ENST00000579979 555 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
POLR3AO14802 YIF1B-216ENST00000592694 1181 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
POLR3AO14802 STXBP2-221ENST00000602355 716 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
POLR3AO14802 PPP1R18-206ENST00000615892 1448 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
POLR3AO14802 ZNF398-203ENST00000483892 2121 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
POLR3AO14802 C15orf62-201ENST00000344320 2370 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
POLR3AO14802 CPXM1-201ENST00000380605 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
POLR3AO14802 QSOX2-201ENST00000358701 4530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
POLR3AO14802 SGCZ-201ENST00000382080 2234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
POLR3AO14802 FAM57B-202ENST00000380495 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
POLR3AO14802 KLHDC3-203ENST00000332245 1494 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
POLR3AO14802 ZFAND6-207ENST00000558494 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
POLR3AO14802 FAM153B-220ENST00000515817 1966 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
POLR3AO14802 NR2F1-201ENST00000327111 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
POLR3AO14802 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
POLR3AO14802 PARP9-204ENST00000471785 3040 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
POLR3AO14802 HEBP1-201ENST00000014930 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
POLR3AO14802 GNG5-201ENST00000370641 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
POLR3AO14802 ZNF564-202ENST00000416136 255 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
POLR3AO14802 AC091891.1-201ENST00000560688 688 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
POLR3AO14802 AC012322.1-201ENST00000561657 861 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
POLR3AO14802 MIR22HG-212ENST00000577164 931 ntTSL 4 BASIC21.43■■□□□ 1.02
POLR3AO14802 AP005019.2-201ENST00000615104 511 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
POLR3AO14802 RAP1GDS1-203ENST00000380158 2085 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
POLR3AO14802 PIP4K2C-207ENST00000550465 1532 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
POLR3AO14802 FAM192A-201ENST00000309137 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
POLR3AO14802 AL136309.2-201ENST00000427049 2277 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
POLR3AO14802 PLTP-205ENST00000477313 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
POLR3AO14802 STOX1-204ENST00000399169 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
POLR3AO14802 PIK3IP1-203ENST00000441972 2374 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
POLR3AO14802 EXD3-201ENST00000340951 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
POLR3AO14802 TGIF1-201ENST00000330513 1980 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
POLR3AO14802 SEPT5-204ENST00000406395 1974 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
POLR3AO14802 AC107871.1-202ENST00000562767 3389 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
POLR3AO14802 MLLT6-210ENST00000620609 2714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
POLR3AO14802 ECSIT-209ENST00000591104 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
POLR3AO14802 AZIN1-201ENST00000337198 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
POLR3AO14802 PGBD5-202ENST00000525115 1569 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
POLR3AO14802 FBXO21-201ENST00000330622 2906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
POLR3AO14802 TUBGCP2-202ENST00000368562 2685 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
POLR3AO14802 MUTYH-211ENST00000456914 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
POLR3AO14802 ELP6-201ENST00000296149 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.9 ms