Protein–RNA interactions for Protein: M0QWN7

Usp35, Ubiquitin-specific peptidase 35, mousemouse

Predictions only

Length 1,009 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp35M0QWN7 Rit2-202ENSMUST00000139924 1674 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Usp35M0QWN7 Mog-201ENSMUST00000102665 1704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Usp35M0QWN7 C030005K06Rik-201ENSMUST00000129164 2076 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Usp35M0QWN7 Ankmy2-201ENSMUST00000041640 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Usp35M0QWN7 Gbf1-201ENSMUST00000026254 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
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Usp35M0QWN7 AC087890.1-201ENSMUST00000219321 1823 ntTSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Usp35M0QWN7 Psap-203ENSMUST00000165878 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
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Usp35M0QWN7 Zmiz1os1-201ENSMUST00000156682 3469 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Usp35M0QWN7 Vmn2r-ps25-201ENSMUST00000202322 2321 ntBASIC13.8□□□□□ -0.2
Usp35M0QWN7 Rnf10-202ENSMUST00000112096 3112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Usp35M0QWN7 Dnpep-203ENSMUST00000185419 2833 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Usp35M0QWN7 Rcor2-202ENSMUST00000113369 2013 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
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Usp35M0QWN7 Rpl38-204ENSMUST00000106602 371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
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Usp35M0QWN7 2010106C02Rik-201ENSMUST00000191222 660 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
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Usp35M0QWN7 Ubxn10-201ENSMUST00000105809 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Usp35M0QWN7 Foxred2-202ENSMUST00000117725 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
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Usp35M0QWN7 Bdnf-205ENSMUST00000111045 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Usp35M0QWN7 Pcnx3-202ENSMUST00000113615 7264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
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Usp35M0QWN7 Mfsd14b-201ENSMUST00000054730 3251 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Usp35M0QWN7 Nup88-203ENSMUST00000108531 2453 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Usp35M0QWN7 Ddx39b-202ENSMUST00000172549 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Usp35M0QWN7 Chmp3-201ENSMUST00000059462 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Usp35M0QWN7 Lgals12-202ENSMUST00000099729 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Usp35M0QWN7 Ptprk-203ENSMUST00000218359 4669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Usp35M0QWN7 Npepps-219ENSMUST00000172108 2924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Usp35M0QWN7 Grhl2-201ENSMUST00000022895 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Usp35M0QWN7 Cd33-201ENSMUST00000004728 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Usp35M0QWN7 Ifnar2-201ENSMUST00000023693 3047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Usp35M0QWN7 Kmt5b-205ENSMUST00000113972 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Usp35M0QWN7 Kmt5b-207ENSMUST00000113974 4150 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
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