Protein–RNA interactions for Protein: L7N243

Gm20939, Predicted gene, 20939, mousemouse

Predictions only

Length 523 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20939L7N243 Cep164-201ENSMUST00000117194 5541 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Gm20939L7N243 Calcoco1-201ENSMUST00000023818 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Gm20939L7N243 Acbd5-208ENSMUST00000226571 3802 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Gm20939L7N243 Shank2-203ENSMUST00000105902 8988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Gm20939L7N243 Pex5-204ENSMUST00000112531 3075 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Gm20939L7N243 Cops7b-202ENSMUST00000121534 5383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Gm20939L7N243 Prkcd-204ENSMUST00000112206 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Gm20939L7N243 Gpd2-201ENSMUST00000028167 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Gm20939L7N243 Arhgap25-202ENSMUST00000101197 2493 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Gm20939L7N243 Sltm-206ENSMUST00000216816 3755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Gm20939L7N243 A430005L14Rik-202ENSMUST00000105645 977 ntTSL 3 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Gm20939L7N243 Unkl-205ENSMUST00000161679 1053 ntTSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Gm20939L7N243 Gm17232-201ENSMUST00000164515 453 ntTSL 2 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Gm20939L7N243 Gm5819-201ENSMUST00000171469 465 ntAPPRIS P1 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Gm20939L7N243 Aif1-206ENSMUST00000173324 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Gm20939L7N243 Gm20457-201ENSMUST00000173374 682 ntTSL 3 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Gm20939L7N243 Gm27331-201ENSMUST00000183705 60 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
Gm20939L7N243 Gm6652-201ENSMUST00000186414 1070 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
Gm20939L7N243 Gm5896-201ENSMUST00000189662 1024 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
Gm20939L7N243 Gm37753-201ENSMUST00000192178 439 ntTSL 2 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Gm20939L7N243 Gm31651-201ENSMUST00000198864 560 ntTSL 3 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Gm20939L7N243 Gm43597-201ENSMUST00000201650 1057 ntTSL 3 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Gm20939L7N243 Gm42906-201ENSMUST00000202365 408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Gm20939L7N243 Gm45059-201ENSMUST00000205558 1077 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
Gm20939L7N243 Gm45484-201ENSMUST00000210310 1141 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
Gm20939L7N243 Gng8-201ENSMUST00000078182 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Gm20939L7N243 Dync1li1-201ENSMUST00000047404 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Gm20939L7N243 2900069G24Rik-201ENSMUST00000192780 1311 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
Gm20939L7N243 Rpl9-204ENSMUST00000127874 2690 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Gm20939L7N243 Fam171a1-201ENSMUST00000062934 4129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Gm20939L7N243 Dlgap4-201ENSMUST00000000094 1411 ntTSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Gm20939L7N243 Dnaja2-201ENSMUST00000034138 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Gm20939L7N243 Aqp8-201ENSMUST00000033023 1487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Gm20939L7N243 Gm21964-203ENSMUST00000219454 1513 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Gm20939L7N243 Dppa4-202ENSMUST00000096045 1534 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Gm20939L7N243 Wnt9a-202ENSMUST00000108783 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Gm20939L7N243 Gm38157-201ENSMUST00000194178 1698 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
Gm20939L7N243 Cacna1b-203ENSMUST00000100348 7182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Gm20939L7N243 Avpr2-201ENSMUST00000033765 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Gm20939L7N243 Recql-201ENSMUST00000032370 2112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Gm20939L7N243 Trpm1-219ENSMUST00000206314 2323 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Gm20939L7N243 Olfr763-201ENSMUST00000077460 2523 ntAPPRIS P1 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Gm20939L7N243 Dgkg-201ENSMUST00000023578 2725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Gm20939L7N243 C230034O21Rik-201ENSMUST00000153659 2836 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Gm20939L7N243 Tgm1-202ENSMUST00000168729 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Gm20939L7N243 Bace1-201ENSMUST00000034591 6058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Gm20939L7N243 Zbtb7b-201ENSMUST00000029677 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Gm20939L7N243 Urgcp-203ENSMUST00000118076 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Gm20939L7N243 Agrn-201ENSMUST00000071248 4831 ntTSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Gm20939L7N243 Rps8-201ENSMUST00000102696 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Gm20939L7N243 Esrp1-203ENSMUST00000108311 3864 ntTSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Gm20939L7N243 Phlda2-201ENSMUST00000010904 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Gm20939L7N243 Timm10-202ENSMUST00000111631 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Gm20939L7N243 Wisp1-202ENSMUST00000118823 708 ntTSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Gm20939L7N243 Mast1-202ENSMUST00000119820 2078 ntTSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Gm20939L7N243 Gm15046-201ENSMUST00000130153 408 ntTSL 3 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Gm20939L7N243 Mecp2-204ENSMUST00000140399 1168 ntTSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Gm20939L7N243 2810430I11Rik-201ENSMUST00000154246 3416 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Gm20939L7N243 Gm16136-203ENSMUST00000162520 1121 ntTSL 2 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Gm20939L7N243 Atxn10-201ENSMUST00000163242 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Gm20939L7N243 Ssr4-208ENSMUST00000166518 800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Gm20939L7N243 Gm9630-201ENSMUST00000178304 885 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
Gm20939L7N243 Sirpa-214ENSMUST00000179001 3812 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Gm20939L7N243 Mhrt-201ENSMUST00000181782 828 ntTSL 2 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Gm20939L7N243 Rpl22-208ENSMUST00000188151 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Gm20939L7N243 4933415J04Rik-201ENSMUST00000195895 1301 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
Gm20939L7N243 Rbpj-207ENSMUST00000201883 4961 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Gm20939L7N243 Gm44124-201ENSMUST00000204159 472 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
Gm20939L7N243 Gm29705-201ENSMUST00000212598 474 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
Gm20939L7N243 Ifi47-204ENSMUST00000213728 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Gm20939L7N243 Gm32926-201ENSMUST00000214043 681 ntTSL 3 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Gm20939L7N243 Rab11fip1-201ENSMUST00000033878 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Gm20939L7N243 1700029I15Rik-201ENSMUST00000054316 364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Gm20939L7N243 Tcea1-201ENSMUST00000081551 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Gm20939L7N243 Nisch-213ENSMUST00000168206 4990 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Gm20939L7N243 Urgcp-204ENSMUST00000120306 3972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Gm20939L7N243 Bysl-201ENSMUST00000024783 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Gm20939L7N243 Actn1-201ENSMUST00000021554 3734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Gm20939L7N243 Ripor3-201ENSMUST00000099073 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Gm20939L7N243 Ppp1r9b-202ENSMUST00000107748 3095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Gm20939L7N243 Zfp219-202ENSMUST00000166169 3017 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Gm20939L7N243 Capn3-203ENSMUST00000090028 2640 ntTSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Gm20939L7N243 Ccdc85a-204ENSMUST00000109502 5220 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Gm20939L7N243 Synpo-209ENSMUST00000143275 5040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Gm20939L7N243 Adamts16-201ENSMUST00000080145 4981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Gm20939L7N243 Coasy-202ENSMUST00000107308 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Gm20939L7N243 Ackr4-202ENSMUST00000076147 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Gm20939L7N243 Rlbp1-202ENSMUST00000179243 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Gm20939L7N243 Myo18a-221ENSMUST00000167856 6132 ntTSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Gm20939L7N243 Tktl2-201ENSMUST00000002025 2021 ntAPPRIS P1 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Gm20939L7N243 Nfyc-203ENSMUST00000118902 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Gm20939L7N243 Gm37269-201ENSMUST00000193906 1891 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
Gm20939L7N243 Gdf9-201ENSMUST00000018382 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Gm20939L7N243 Gm36266-201ENSMUST00000196660 1749 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Gm20939L7N243 Gm6992-201ENSMUST00000217973 1607 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
Gm20939L7N243 Serpinb13-201ENSMUST00000027564 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Gm20939L7N243 Slc29a1-209ENSMUST00000166119 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Gm20939L7N243 Gm44775-201ENSMUST00000207266 1456 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
Gm20939L7N243 Spag9-202ENSMUST00000041956 7340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Gm20939L7N243 Cldn9-201ENSMUST00000085989 1435 ntAPPRIS P1 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.5 ms