Protein–RNA interactions for Protein: G3X952

Zkscan2, MCG20985, isoform CRA_a, mousemouse

Predictions only

Length 960 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zkscan2G3X952 Arhgap22-202ENSMUST00000111956 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Zkscan2G3X952 Bop1-201ENSMUST00000023217 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Zkscan2G3X952 Kcp-203ENSMUST00000101614 4885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Zkscan2G3X952 Usp53-202ENSMUST00000197314 3586 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Zkscan2G3X952 Gm6992-201ENSMUST00000217973 1607 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Zkscan2G3X952 Dnaja2-201ENSMUST00000034138 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Zkscan2G3X952 Gm8131-201ENSMUST00000213783 1570 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Zkscan2G3X952 4930550L24Rik-201ENSMUST00000062542 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Zkscan2G3X952 Nkd2-201ENSMUST00000022051 4016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Zkscan2G3X952 Gm44942-201ENSMUST00000096093 2072 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Zkscan2G3X952 Ttc34-201ENSMUST00000050220 3200 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Zkscan2G3X952 Actn1-201ENSMUST00000021554 3734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Zkscan2G3X952 Zp1-201ENSMUST00000025641 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Zkscan2G3X952 Tmem25-201ENSMUST00000002100 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Zkscan2G3X952 Fgfr3-211ENSMUST00000171509 4020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Zkscan2G3X952 Gm35339-201ENSMUST00000208833 5090 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Zkscan2G3X952 H2-DMb2-201ENSMUST00000041982 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Zkscan2G3X952 Tmprss12-201ENSMUST00000096200 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Zkscan2G3X952 Gm43463-201ENSMUST00000195967 1803 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Zkscan2G3X952 Snrnp27-202ENSMUST00000113683 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Zkscan2G3X952 Ptp4a3-202ENSMUST00000163582 3808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Zkscan2G3X952 Prss51-202ENSMUST00000165710 953 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Zkscan2G3X952 Sirpa-214ENSMUST00000179001 3812 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Zkscan2G3X952 2810039B14Rik-206ENSMUST00000185040 1113 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Zkscan2G3X952 Gm20219-201ENSMUST00000209718 1269 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Zkscan2G3X952 Lsm7-208ENSMUST00000220225 1129 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Zkscan2G3X952 Ccdc113-201ENSMUST00000041569 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Zkscan2G3X952 Tnnt3-201ENSMUST00000074187 1007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Zkscan2G3X952 Cflar-202ENSMUST00000097722 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Zkscan2G3X952 Usp16-201ENSMUST00000026710 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Zkscan2G3X952 Gm36266-201ENSMUST00000196660 1749 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Zkscan2G3X952 Ptp4a1-201ENSMUST00000027232 4145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Zkscan2G3X952 Fnbp1-203ENSMUST00000100207 1680 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Zkscan2G3X952 Pja1-204ENSMUST00000113797 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Zkscan2G3X952 Il2rg-201ENSMUST00000033664 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Zkscan2G3X952 Gsn-205ENSMUST00000201185 2607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Zkscan2G3X952 Gm26878-201ENSMUST00000181778 1644 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Zkscan2G3X952 Pex11b-207ENSMUST00000165842 1562 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Zkscan2G3X952 Snph-202ENSMUST00000094456 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Zkscan2G3X952 Otud4-203ENSMUST00000173286 7213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Zkscan2G3X952 Aqr-201ENSMUST00000043160 4888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Zkscan2G3X952 Ppm1b-204ENSMUST00000112307 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Zkscan2G3X952 Hspa9-201ENSMUST00000025217 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Zkscan2G3X952 Ccng2-202ENSMUST00000121127 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Zkscan2G3X952 Gm7114-201ENSMUST00000190159 1789 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Zkscan2G3X952 Klhl8-203ENSMUST00000112815 2898 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Zkscan2G3X952 Glis2-201ENSMUST00000014447 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Zkscan2G3X952 Acap1-201ENSMUST00000001631 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Zkscan2G3X952 Slc39a8-201ENSMUST00000029810 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Zkscan2G3X952 Ppp2r2b-203ENSMUST00000120632 2081 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Zkscan2G3X952 Fam198a-202ENSMUST00000213773 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Zkscan2G3X952 Myo18a-221ENSMUST00000167856 6132 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Zkscan2G3X952 Pnpo-202ENSMUST00000107629 681 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Zkscan2G3X952 Ice2-203ENSMUST00000117610 800 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Zkscan2G3X952 Pisd-ps1-201ENSMUST00000119128 1115 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Zkscan2G3X952 Cox6c-203ENSMUST00000153512 738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Zkscan2G3X952 Gm28139-201ENSMUST00000189480 643 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Zkscan2G3X952 Reep1-202ENSMUST00000212631 953 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Zkscan2G3X952 Spc24-204ENSMUST00000216057 627 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Zkscan2G3X952 Slc35d2-202ENSMUST00000220792 917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Zkscan2G3X952 Ier3-201ENSMUST00000003635 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Zkscan2G3X952 Fgf2-201ENSMUST00000038885 462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Zkscan2G3X952 Vcl-201ENSMUST00000022369 5267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Zkscan2G3X952 Gm13075-202ENSMUST00000149247 1621 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Zkscan2G3X952 Hexim2-201ENSMUST00000062530 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Zkscan2G3X952 Slc25a25-205ENSMUST00000113310 3278 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Zkscan2G3X952 Rbpj-207ENSMUST00000201883 4961 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Zkscan2G3X952 Tmem206-201ENSMUST00000027940 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Zkscan2G3X952 H2-T22-201ENSMUST00000058801 1534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Zkscan2G3X952 5730409E04Rik-202ENSMUST00000164362 2855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Zkscan2G3X952 Gtf2ird1-209ENSMUST00000171794 3524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Zkscan2G3X952 Lin28a-201ENSMUST00000051674 3505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Zkscan2G3X952 Stox2-201ENSMUST00000079195 10467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Zkscan2G3X952 Gm15897-201ENSMUST00000117770 1486 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
Zkscan2G3X952 Trmt1-203ENSMUST00000109767 2138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Zkscan2G3X952 Atxn10-201ENSMUST00000163242 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Zkscan2G3X952 Aamp-202ENSMUST00000178235 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Zkscan2G3X952 Arhgef2-229ENSMUST00000177303 3000 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Zkscan2G3X952 Mrps30-201ENSMUST00000022245 3319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Zkscan2G3X952 Pex2-204ENSMUST00000165309 2038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Zkscan2G3X952 Alg14-201ENSMUST00000039442 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Zkscan2G3X952 Flt4-201ENSMUST00000020617 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Zkscan2G3X952 Adam32-201ENSMUST00000119720 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Zkscan2G3X952 Chst4-201ENSMUST00000109222 1942 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Zkscan2G3X952 Saxo1-201ENSMUST00000030216 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Zkscan2G3X952 Cd200r1-201ENSMUST00000057488 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Zkscan2G3X952 Chst15-201ENSMUST00000077472 5041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Zkscan2G3X952 Folr1-205ENSMUST00000106986 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Zkscan2G3X952 Phlda2-201ENSMUST00000010904 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Zkscan2G3X952 Id1-202ENSMUST00000109824 1160 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Zkscan2G3X952 Gm12390-201ENSMUST00000117897 397 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Zkscan2G3X952 Mpc1-202ENSMUST00000124023 555 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Zkscan2G3X952 Ndufaf2-201ENSMUST00000163558 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Zkscan2G3X952 1700015O11Rik-201ENSMUST00000180964 678 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Zkscan2G3X952 1700037F24Rik-201ENSMUST00000181254 973 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Zkscan2G3X952 Gm27682-201ENSMUST00000183930 110 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Zkscan2G3X952 Chfr-212ENSMUST00000200038 606 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Zkscan2G3X952 Cfc1-201ENSMUST00000027298 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Zkscan2G3X952 Cyb5d1-201ENSMUST00000051620 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Zkscan2G3X952 Plekhd1-201ENSMUST00000140770 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.8 ms