Protein–RNA interactions for Protein: F6SEU4

Syngap1, Ras/Rap GTPase-activating protein SynGAP, mousemouse

Predictions only

Length 1,340 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syngap1F6SEU4 Gm15897-201ENSMUST00000117770 1486 ntBASIC14.39□□□□□ -0.11
Syngap1F6SEU4 Pacrg-201ENSMUST00000041463 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Syngap1F6SEU4 Kifc3-202ENSMUST00000169353 2898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Syngap1F6SEU4 Ahdc1-204ENSMUST00000105916 6602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
Syngap1F6SEU4 Nr1i3-202ENSMUST00000075469 1305 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Syngap1F6SEU4 Gm26777-201ENSMUST00000181852 2573 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Syngap1F6SEU4 Bcl2l1-201ENSMUST00000007803 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Syngap1F6SEU4 Cyfip1-201ENSMUST00000032629 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Syngap1F6SEU4 Pcdh7-202ENSMUST00000094783 3752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Syngap1F6SEU4 Chodl-203ENSMUST00000114216 1550 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Syngap1F6SEU4 Vps35-201ENSMUST00000034131 3474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Syngap1F6SEU4 Aatk-201ENSMUST00000064307 5336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Syngap1F6SEU4 Gm10434-201ENSMUST00000101158 471 ntBASIC14.39□□□□□ -0.11
Syngap1F6SEU4 Elovl1-203ENSMUST00000102673 1248 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Syngap1F6SEU4 Ccdc28b-202ENSMUST00000106035 821 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Syngap1F6SEU4 Gm9062-201ENSMUST00000117712 727 ntBASIC14.39□□□□□ -0.11
Syngap1F6SEU4 Gm16308-201ENSMUST00000162171 940 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Syngap1F6SEU4 Anapc16-203ENSMUST00000182152 847 ntTSL 2 BASIC14.39□□□□□ -0.11
Syngap1F6SEU4 AC152453.1-201ENSMUST00000218802 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Syngap1F6SEU4 1700128F08Rik-201ENSMUST00000034483 1110 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Syngap1F6SEU4 Ell3-202ENSMUST00000116432 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Syngap1F6SEU4 Gm20149-201ENSMUST00000214691 1667 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Syngap1F6SEU4 Polr2a-202ENSMUST00000071213 5799 ntTSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Syngap1F6SEU4 Spin1-201ENSMUST00000095797 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Syngap1F6SEU4 Fut9-202ENSMUST00000108199 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Syngap1F6SEU4 Psmd11-201ENSMUST00000017572 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Syngap1F6SEU4 Islr2-201ENSMUST00000114144 3880 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Syngap1F6SEU4 Scin-202ENSMUST00000078481 2654 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Syngap1F6SEU4 Kirrel-203ENSMUST00000159976 7236 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Syngap1F6SEU4 Syt12-201ENSMUST00000059295 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Syngap1F6SEU4 Rbm47-206ENSMUST00000200775 3180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Syngap1F6SEU4 Ddx23-201ENSMUST00000003450 3187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Syngap1F6SEU4 Ssc5d-201ENSMUST00000057612 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Syngap1F6SEU4 Prg4-207ENSMUST00000162367 1480 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Syngap1F6SEU4 E330023G01Rik-201ENSMUST00000186387 1483 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Syngap1F6SEU4 Mpv17-201ENSMUST00000154241 1724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Syngap1F6SEU4 Clec11a-201ENSMUST00000004587 2978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Syngap1F6SEU4 Gm5106-201ENSMUST00000181058 1334 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Syngap1F6SEU4 Kcnq2-208ENSMUST00000103051 4200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Syngap1F6SEU4 Supt6-201ENSMUST00000002121 6488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Syngap1F6SEU4 Unc5d-204ENSMUST00000210785 3404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Syngap1F6SEU4 Slc25a15-201ENSMUST00000033871 3430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Syngap1F6SEU4 Clec16a-205ENSMUST00000115827 2949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Syngap1F6SEU4 Olfm1-202ENSMUST00000100244 2686 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Syngap1F6SEU4 Fbxw9-201ENSMUST00000095220 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Syngap1F6SEU4 Mutyh-201ENSMUST00000102699 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Syngap1F6SEU4 Strip2-201ENSMUST00000046028 5370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Syngap1F6SEU4 Epb41l2-201ENSMUST00000053748 4385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Syngap1F6SEU4 Slc25a46-201ENSMUST00000060396 4371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Syngap1F6SEU4 Gm37644-201ENSMUST00000192190 2270 ntBASIC14.38□□□□□ -0.11
Syngap1F6SEU4 Hdgfl2-212ENSMUST00000226053 2270 ntAPPRIS P2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Syngap1F6SEU4 Cenpo-201ENSMUST00000020981 2037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Syngap1F6SEU4 Lag3-201ENSMUST00000032217 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Syngap1F6SEU4 Hdac7-202ENSMUST00000088402 4223 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Syngap1F6SEU4 Kdm2b-204ENSMUST00000118027 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Syngap1F6SEU4 Strada-202ENSMUST00000103072 1517 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Syngap1F6SEU4 Steap2-203ENSMUST00000115425 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Syngap1F6SEU4 Ube3b-201ENSMUST00000074002 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Syngap1F6SEU4 Fam129a-203ENSMUST00000111875 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Syngap1F6SEU4 Gm23699-201ENSMUST00000158835 135 ntBASIC14.38□□□□□ -0.11
Syngap1F6SEU4 Zfp637-210ENSMUST00000164472 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Syngap1F6SEU4 Apoe-208ENSMUST00000174191 472 ntTSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Syngap1F6SEU4 1700119H24Rik-201ENSMUST00000187558 588 ntTSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Syngap1F6SEU4 Mb-201ENSMUST00000019037 966 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Syngap1F6SEU4 Defb36-201ENSMUST00000058086 468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Syngap1F6SEU4 Mlf1-201ENSMUST00000061322 1113 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Syngap1F6SEU4 Gm25517-201ENSMUST00000083865 134 ntBASIC14.38□□□□□ -0.11
Syngap1F6SEU4 Rpusd2-201ENSMUST00000028796 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Syngap1F6SEU4 6330537M06Rik-201ENSMUST00000212384 1642 ntBASIC14.38□□□□□ -0.11
Syngap1F6SEU4 Cenpl-202ENSMUST00000111618 1996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Syngap1F6SEU4 Chrnd-202ENSMUST00000186373 2949 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Syngap1F6SEU4 Pdxk-ps-201ENSMUST00000159650 2342 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Syngap1F6SEU4 Edem3-203ENSMUST00000188145 3262 ntTSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Syngap1F6SEU4 Plekhb1-203ENSMUST00000107044 1806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Syngap1F6SEU4 B230209E15Rik-201ENSMUST00000209115 1597 ntTSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Syngap1F6SEU4 AC139350.1-201ENSMUST00000227064 1594 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
Syngap1F6SEU4 Ddx24-202ENSMUST00000110001 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Syngap1F6SEU4 Dpysl4-202ENSMUST00000121184 2727 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Syngap1F6SEU4 Hadhb-203ENSMUST00000114786 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Syngap1F6SEU4 Dclk1-215ENSMUST00000200352 1662 ntTSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Syngap1F6SEU4 Tufm-201ENSMUST00000098048 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Syngap1F6SEU4 Fnbp4-201ENSMUST00000013759 4691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Syngap1F6SEU4 Siglecg-201ENSMUST00000005592 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Syngap1F6SEU4 Glod4-201ENSMUST00000017430 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Syngap1F6SEU4 Spib-201ENSMUST00000035323 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Syngap1F6SEU4 Colgalt1-201ENSMUST00000047903 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Syngap1F6SEU4 Celf1-214ENSMUST00000177642 7806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Syngap1F6SEU4 Tmem51os1-204ENSMUST00000153023 3440 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Syngap1F6SEU4 Minos1-203ENSMUST00000143971 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Syngap1F6SEU4 Srebf2-201ENSMUST00000023100 4989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Syngap1F6SEU4 Gm26525-201ENSMUST00000180666 3616 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Syngap1F6SEU4 Gm26867-201ENSMUST00000180963 3615 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Syngap1F6SEU4 Rec8-201ENSMUST00000002395 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Syngap1F6SEU4 Hspa4-201ENSMUST00000020630 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Syngap1F6SEU4 Col26a1-201ENSMUST00000057497 2724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Syngap1F6SEU4 Fgf18-202ENSMUST00000109363 991 ntTSL 3 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Syngap1F6SEU4 Ssc4d-202ENSMUST00000111150 459 ntTSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Syngap1F6SEU4 Gm4760-201ENSMUST00000119663 1030 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
Syngap1F6SEU4 Rbm3-ps-201ENSMUST00000121422 465 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
Syngap1F6SEU4 Gm12539-201ENSMUST00000121549 1098 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.2 ms