Protein–RNA interactions for Protein: E9Q4T4

Ccdc71l, Coiled-coil domain-containing 71-like, mousemouse

Predictions only

Length 218 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc71lE9Q4T4 Plekha1-202ENSMUST00000075181 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Ccdc71lE9Q4T4 Peg3-201ENSMUST00000051209 8694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Ccdc71lE9Q4T4 Rnf223-201ENSMUST00000209248 2908 ntAPPRIS P1 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Ccdc71lE9Q4T4 Adora1-203ENSMUST00000169927 4581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Ccdc71lE9Q4T4 Pbrm1-206ENSMUST00000112094 5154 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Ccdc71lE9Q4T4 Foxo6os-201ENSMUST00000152384 2291 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Ccdc71lE9Q4T4 Atrip-201ENSMUST00000045011 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Ccdc71lE9Q4T4 Gm29895-201ENSMUST00000209933 5652 ntTSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Ccdc71lE9Q4T4 Rtl5-204ENSMUST00000188731 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Ccdc71lE9Q4T4 Ddx19b-202ENSMUST00000065784 3104 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Ccdc71lE9Q4T4 Ttc23l-201ENSMUST00000022857 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Ccdc71lE9Q4T4 Car6-202ENSMUST00000105683 1460 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Ccdc71lE9Q4T4 AC154767.3-201ENSMUST00000225150 1342 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Ccdc71lE9Q4T4 Fcgbp-203ENSMUST00000138392 7926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Ccdc71lE9Q4T4 Fcgbp-201ENSMUST00000076648 7928 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Ccdc71lE9Q4T4 Xpnpep1-209ENSMUST00000183108 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Ccdc71lE9Q4T4 Timeless-201ENSMUST00000055539 4457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Ccdc71lE9Q4T4 Gm9742-201ENSMUST00000165220 1553 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Ccdc71lE9Q4T4 Ripor3-201ENSMUST00000099073 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Ccdc71lE9Q4T4 Hsd17b14-201ENSMUST00000107752 1400 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Ccdc71lE9Q4T4 Gm10176-201ENSMUST00000159707 2264 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Ccdc71lE9Q4T4 Gm36356-201ENSMUST00000209224 2277 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Ccdc71lE9Q4T4 Zeb1-201ENSMUST00000025081 5805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Ccdc71lE9Q4T4 Gm4204-201ENSMUST00000110798 1231 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Ccdc71lE9Q4T4 Ninj2-202ENSMUST00000112711 853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Ccdc71lE9Q4T4 Gm13453-201ENSMUST00000118708 357 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Ccdc71lE9Q4T4 Gm12485-201ENSMUST00000119641 291 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Ccdc71lE9Q4T4 Gm13716-201ENSMUST00000126401 808 ntTSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Ccdc71lE9Q4T4 Hpca-207ENSMUST00000139450 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Ccdc71lE9Q4T4 Gm10605-201ENSMUST00000182342 665 ntTSL 3 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Ccdc71lE9Q4T4 1190007I07Rik-204ENSMUST00000183416 637 ntTSL 2 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Ccdc71lE9Q4T4 Gm17837-201ENSMUST00000186435 985 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Ccdc71lE9Q4T4 Gm7390-201ENSMUST00000212452 1216 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Ccdc71lE9Q4T4 Gm6888-201ENSMUST00000221983 706 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Ccdc71lE9Q4T4 Mettl26-201ENSMUST00000026827 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Ccdc71lE9Q4T4 Batf3-201ENSMUST00000027943 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Ccdc71lE9Q4T4 Gm8396-201ENSMUST00000057361 823 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Ccdc71lE9Q4T4 Cnot3-201ENSMUST00000038913 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Ccdc71lE9Q4T4 Gm8108-202ENSMUST00000170207 1961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Ccdc71lE9Q4T4 Gm10406-202ENSMUST00000170738 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Ccdc71lE9Q4T4 Leng8-203ENSMUST00000121270 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Ccdc71lE9Q4T4 2410002F23Rik-204ENSMUST00000107948 2908 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Ccdc71lE9Q4T4 Fbxw7-201ENSMUST00000029727 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Ccdc71lE9Q4T4 Ate1-204ENSMUST00000178534 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Ccdc71lE9Q4T4 Crkl-201ENSMUST00000006293 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Ccdc71lE9Q4T4 Adam33-202ENSMUST00000110232 3165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Ccdc71lE9Q4T4 Rab3a-202ENSMUST00000110090 1375 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Ccdc71lE9Q4T4 Fosb-207ENSMUST00000208505 3523 ntTSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Ccdc71lE9Q4T4 B230369F24Rik-201ENSMUST00000141846 2560 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Ccdc71lE9Q4T4 Prdx2-203ENSMUST00000109734 1612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Ccdc71lE9Q4T4 Vsx1-201ENSMUST00000046095 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Ccdc71lE9Q4T4 Knop1-203ENSMUST00000106549 1467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Ccdc71lE9Q4T4 Rbm47-209ENSMUST00000201544 5211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Ccdc71lE9Q4T4 Dbn1-201ENSMUST00000021950 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Ccdc71lE9Q4T4 Arid2-201ENSMUST00000096250 8507 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Ccdc71lE9Q4T4 Pcdh8-204ENSMUST00000195355 3704 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Ccdc71lE9Q4T4 Prss8-202ENSMUST00000206124 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Ccdc71lE9Q4T4 AC151895.1-201ENSMUST00000219025 1742 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Ccdc71lE9Q4T4 Nfia-202ENSMUST00000075448 9526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Ccdc71lE9Q4T4 Kcnma1-212ENSMUST00000188285 4440 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Ccdc71lE9Q4T4 Eogt-201ENSMUST00000054344 4424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Ccdc71lE9Q4T4 Nsun7-204ENSMUST00000202994 3632 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Ccdc71lE9Q4T4 Setdb2-205ENSMUST00000161459 2995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Ccdc71lE9Q4T4 Rab39-201ENSMUST00000068449 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Ccdc71lE9Q4T4 Nin-201ENSMUST00000021468 6708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Ccdc71lE9Q4T4 Trappc2l-201ENSMUST00000015157 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Ccdc71lE9Q4T4 Timd2-201ENSMUST00000055102 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Ccdc71lE9Q4T4 C4a-207ENSMUST00000160679 5371 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Ccdc71lE9Q4T4 Vps36-201ENSMUST00000033866 3574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Ccdc71lE9Q4T4 Cacna1c-224ENSMUST00000219018 7516 ntTSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Ccdc71lE9Q4T4 Clnkos-201ENSMUST00000114080 439 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Ccdc71lE9Q4T4 Igfbp4-204ENSMUST00000140772 742 ntTSL 2 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Ccdc71lE9Q4T4 Gm26308-201ENSMUST00000157768 69 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Ccdc71lE9Q4T4 Gm22175-201ENSMUST00000175007 78 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Ccdc71lE9Q4T4 Panct2-202ENSMUST00000188631 625 ntTSL 3 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Ccdc71lE9Q4T4 Agrp-202ENSMUST00000194091 734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Ccdc71lE9Q4T4 Fam71e1-204ENSMUST00000205422 366 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Ccdc71lE9Q4T4 2810047C21Rik1-202ENSMUST00000210322 1179 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Ccdc71lE9Q4T4 Ccdc172-201ENSMUST00000069419 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Ccdc71lE9Q4T4 Ftl1-201ENSMUST00000094434 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Ccdc71lE9Q4T4 Slc25a5-ps-202ENSMUST00000223716 1786 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Ccdc71lE9Q4T4 Mpi-201ENSMUST00000034856 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Ccdc71lE9Q4T4 Abra-201ENSMUST00000054742 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Ccdc71lE9Q4T4 Adamts10-201ENSMUST00000087623 4043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Ccdc71lE9Q4T4 Pdcd6-203ENSMUST00000222759 1376 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Ccdc71lE9Q4T4 4632427E13Rik-202ENSMUST00000147198 6559 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Ccdc71lE9Q4T4 Tle3-202ENSMUST00000159050 2304 ntTSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Ccdc71lE9Q4T4 Gm43102-201ENSMUST00000201004 2324 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Ccdc71lE9Q4T4 Gm5989-201ENSMUST00000096092 2077 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Ccdc71lE9Q4T4 Ncapd2-201ENSMUST00000043848 4629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Ccdc71lE9Q4T4 Rnf182-201ENSMUST00000059986 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Ccdc71lE9Q4T4 Nrf1-210ENSMUST00000115211 3295 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Ccdc71lE9Q4T4 Trpv4-202ENSMUST00000112217 2436 ntTSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Ccdc71lE9Q4T4 Bcas3-202ENSMUST00000092821 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Ccdc71lE9Q4T4 Scn9a-201ENSMUST00000100063 9813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Ccdc71lE9Q4T4 Scn9a-202ENSMUST00000100064 9840 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Ccdc71lE9Q4T4 Gm8334-201ENSMUST00000112755 1662 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Ccdc71lE9Q4T4 Myh13-203ENSMUST00000180845 5991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Ccdc71lE9Q4T4 Gorasp1-201ENSMUST00000035099 3906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Ccdc71lE9Q4T4 Dgcr14-201ENSMUST00000003621 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.9 ms