Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPX0

IGSF9B, Protein turtle homolog B, humanhuman

Predictions only

Length 1,349 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IGSF9BQ9UPX0 UAP1L1-202ENST00000409858 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
IGSF9BQ9UPX0 FBXL16-202ENST00000397621 3547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
IGSF9BQ9UPX0 DGKZ-202ENST00000343674 3816 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
IGSF9BQ9UPX0 DEK-201ENST00000244776 1441 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
IGSF9BQ9UPX0 INHBB-201ENST00000295228 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
IGSF9BQ9UPX0 FOXR1-201ENST00000317011 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
IGSF9BQ9UPX0 RWDD4-201ENST00000326397 2641 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
IGSF9BQ9UPX0 H1F0-201ENST00000340857 2344 ntAPPRIS P1 BASIC17.67■□□□□ 0.42
IGSF9BQ9UPX0 MINDY1-202ENST00000361738 1961 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
IGSF9BQ9UPX0 TMEM26-AS1-201ENST00000389640 863 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
IGSF9BQ9UPX0 TANK-202ENST00000392749 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
IGSF9BQ9UPX0 RBM33-205ENST00000392759 1580 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
IGSF9BQ9UPX0 GEM-202ENST00000396194 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
IGSF9BQ9UPX0 AC098850.1-201ENST00000419919 790 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
IGSF9BQ9UPX0 TMEM247-204ENST00000434431 680 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
IGSF9BQ9UPX0 AL109811.2-201ENST00000447600 487 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
IGSF9BQ9UPX0 GIMAP3P-201ENST00000495150 836 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
IGSF9BQ9UPX0 LINC02447-202ENST00000501888 2146 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
IGSF9BQ9UPX0 RCHY1-210ENST00000513257 759 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
IGSF9BQ9UPX0 TMEM218-210ENST00000529609 734 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
IGSF9BQ9UPX0 DCUN1D5-209ENST00000531543 1030 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
IGSF9BQ9UPX0 SYBU-231ENST00000533065 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
IGSF9BQ9UPX0 CSF1R-209ENST00000543093 921 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
IGSF9BQ9UPX0 LINC02356-202ENST00000552663 314 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
IGSF9BQ9UPX0 GCHFR-204ENST00000559445 626 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
IGSF9BQ9UPX0 LITAF-218ENST00000576036 603 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.67■□□□□ 0.42
IGSF9BQ9UPX0 TMEM205-208ENST00000587948 688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
IGSF9BQ9UPX0 TRAPPC6A-204ENST00000588062 695 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
IGSF9BQ9UPX0 TMEM205-211ENST00000589555 788 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
IGSF9BQ9UPX0 CANT1-211ENST00000591773 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
IGSF9BQ9UPX0 AC024909.3-201ENST00000611513 2257 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
IGSF9BQ9UPX0 SPIN2A-203ENST00000614076 966 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
IGSF9BQ9UPX0 OR2T27-203ENST00000641652 1285 ntAPPRIS P1 BASIC17.67■□□□□ 0.42
IGSF9BQ9UPX0 CACNA1A-201ENST00000360228 8627 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
IGSF9BQ9UPX0 SYT15-202ENST00000374323 6428 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
IGSF9BQ9UPX0 PRX-202ENST00000324001 4855 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
IGSF9BQ9UPX0 VARS-215ENST00000375663 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
IGSF9BQ9UPX0 TMC7-201ENST00000304381 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
IGSF9BQ9UPX0 CTPS2-201ENST00000359276 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
IGSF9BQ9UPX0 MAPK8IP2-202ENST00000329492 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
IGSF9BQ9UPX0 CDK11B-208ENST00000629289 2490 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
IGSF9BQ9UPX0 SLC5A6-203ENST00000408041 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
IGSF9BQ9UPX0 SLA2-202ENST00000360672 2171 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
IGSF9BQ9UPX0 GFM1-208ENST00000478576 2147 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
IGSF9BQ9UPX0 CELF4-202ENST00000361795 1853 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
IGSF9BQ9UPX0 AC009802.1-201ENST00000637973 1609 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
IGSF9BQ9UPX0 GMPPB-201ENST00000308375 3217 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
IGSF9BQ9UPX0 MAP4K3-201ENST00000263881 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
IGSF9BQ9UPX0 CD34-202ENST00000356522 2874 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
IGSF9BQ9UPX0 EEF1B2-201ENST00000236957 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
IGSF9BQ9UPX0 SDHB-201ENST00000375499 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
IGSF9BQ9UPX0 RAB34-206ENST00000415040 1293 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
IGSF9BQ9UPX0 TOMM22P5-201ENST00000416399 439 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
IGSF9BQ9UPX0 AC073130.2-202ENST00000444244 842 ntTSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
IGSF9BQ9UPX0 RN7SL752P-201ENST00000463779 287 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
IGSF9BQ9UPX0 KRBOX4-207ENST00000487081 1247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
IGSF9BQ9UPX0 ATG10-207ENST00000513443 978 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
IGSF9BQ9UPX0 C11orf98-202ENST00000525675 405 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
IGSF9BQ9UPX0 CLNS1A-210ENST00000528364 953 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
IGSF9BQ9UPX0 AC123567.1-201ENST00000548294 1261 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
IGSF9BQ9UPX0 SLC25A39-207ENST00000586016 1156 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
IGSF9BQ9UPX0 ANKK1-201ENST00000303941 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
IGSF9BQ9UPX0 PI4KAP1-201ENST00000610959 2425 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
IGSF9BQ9UPX0 ZNF425-201ENST00000378061 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
IGSF9BQ9UPX0 AL445931.1-201ENST00000412181 2112 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
IGSF9BQ9UPX0 KMT5A-202ENST00000402868 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
IGSF9BQ9UPX0 PKP4-AS1-203ENST00000629904 1951 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
IGSF9BQ9UPX0 KCNA5-201ENST00000252321 2800 ntAPPRIS P1 BASIC17.65■□□□□ 0.42
IGSF9BQ9UPX0 C16orf89-201ENST00000315997 1872 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
IGSF9BQ9UPX0 ZP3-204ENST00000416245 1846 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
IGSF9BQ9UPX0 DMRTC2-201ENST00000269945 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
IGSF9BQ9UPX0 POLR3H-202ENST00000355209 4416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
IGSF9BQ9UPX0 MXI1-202ENST00000332674 3470 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
IGSF9BQ9UPX0 CCT7-216ENST00000540468 1674 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
IGSF9BQ9UPX0 RRM2B-201ENST00000251810 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
IGSF9BQ9UPX0 RAI2-206ENST00000545871 2421 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.65■□□□□ 0.42
IGSF9BQ9UPX0 FGF4-201ENST00000168712 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
IGSF9BQ9UPX0 ADGRA1-AS1-201ENST00000366099 3236 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
IGSF9BQ9UPX0 KCTD20-202ENST00000373731 5619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
IGSF9BQ9UPX0 CAPZB-204ENST00000375144 1568 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
IGSF9BQ9UPX0 SGSH-203ENST00000570923 1546 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
IGSF9BQ9UPX0 TLE2-203ENST00000443826 2238 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
IGSF9BQ9UPX0 HIST1H2AC-203ENST00000602637 1462 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
IGSF9BQ9UPX0 GRB7-205ENST00000445327 2197 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
IGSF9BQ9UPX0 ITGA8-201ENST00000378076 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
IGSF9BQ9UPX0 SLITRK4-201ENST00000338017 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
IGSF9BQ9UPX0 AL512384.1-201ENST00000406683 331 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
IGSF9BQ9UPX0 AL161785.3-201ENST00000435157 395 ntTSL 3 BASIC17.65■□□□□ 0.42
IGSF9BQ9UPX0 ELK1P1-201ENST00000485699 580 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
IGSF9BQ9UPX0 AL132711.1-201ENST00000557546 722 ntTSL 3 BASIC17.65■□□□□ 0.42
IGSF9BQ9UPX0 OIP5-AS1-209ENST00000561226 775 ntTSL 3 BASIC17.65■□□□□ 0.42
IGSF9BQ9UPX0 AC008770.3-202ENST00000591944 567 ntTSL 4 BASIC17.65■□□□□ 0.42
IGSF9BQ9UPX0 AL008721.1-201ENST00000609964 604 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
IGSF9BQ9UPX0 LGR6-205ENST00000439764 2487 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
IGSF9BQ9UPX0 FLII-221ENST00000578558 2377 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
IGSF9BQ9UPX0 CLUH-201ENST00000435359 5224 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
IGSF9BQ9UPX0 RNF34-202ENST00000392464 1722 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
IGSF9BQ9UPX0 DHX33-201ENST00000225296 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
IGSF9BQ9UPX0 CACFD1-202ENST00000316948 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
IGSF9BQ9UPX0 YTHDF1-202ENST00000370339 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.6 ms