Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBL6

CPNE7, Copine-7, humanhuman

Predictions only

Length 633 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CPNE7Q9UBL6 BTN3A1-204ENST00000425234 1882 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CPNE7Q9UBL6 OVCH1-AS1-204ENST00000641955 5529 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
CPNE7Q9UBL6 TAP2-202ENST00000374899 2497 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CPNE7Q9UBL6 PKLR-202ENST00000392414 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CPNE7Q9UBL6 SYDE1-204ENST00000600440 3058 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CPNE7Q9UBL6 RRM2-202ENST00000360566 3673 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CPNE7Q9UBL6 BSG-204ENST00000545507 1795 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CPNE7Q9UBL6 BRSK2-204ENST00000526678 2091 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CPNE7Q9UBL6 GNAL-202ENST00000334049 6535 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CPNE7Q9UBL6 C15orf62-201ENST00000344320 2370 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CPNE7Q9UBL6 NFATC4-222ENST00000555590 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CPNE7Q9UBL6 CYTH2-204ENST00000452733 4780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CPNE7Q9UBL6 KIFC2-201ENST00000301332 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CPNE7Q9UBL6 PLPPR2-201ENST00000251473 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CPNE7Q9UBL6 UBQLN1-201ENST00000257468 2299 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CPNE7Q9UBL6 LINC00487-201ENST00000382045 2131 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CPNE7Q9UBL6 WDR45-202ENST00000356463 1688 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CPNE7Q9UBL6 ING4-202ENST00000396807 1393 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CPNE7Q9UBL6 MYB-242ENST00000618728 3545 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CPNE7Q9UBL6 CENPN-202ENST00000305850 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CPNE7Q9UBL6 TANK-202ENST00000392749 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CPNE7Q9UBL6 NGFR-201ENST00000172229 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CPNE7Q9UBL6 NR2C1-201ENST00000330677 2014 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CPNE7Q9UBL6 PLCB1-203ENST00000378641 7323 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CPNE7Q9UBL6 ZNF786-201ENST00000316286 3144 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CPNE7Q9UBL6 CHST10-201ENST00000264249 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CPNE7Q9UBL6 PAPLN-202ENST00000340738 5834 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CPNE7Q9UBL6 SS18L2-201ENST00000011691 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CPNE7Q9UBL6 EEF1B2-201ENST00000236957 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CPNE7Q9UBL6 OR5C1-201ENST00000373680 963 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CPNE7Q9UBL6 AKIP1-204ENST00000396648 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CPNE7Q9UBL6 KRT17P7-201ENST00000451704 1104 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
CPNE7Q9UBL6 AC122138.1-201ENST00000508799 646 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CPNE7Q9UBL6 SLED1-202ENST00000512051 380 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
CPNE7Q9UBL6 LINC00824-206ENST00000523173 920 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CPNE7Q9UBL6 TMEM218-210ENST00000529609 734 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CPNE7Q9UBL6 HIST1H2BO-201ENST00000616182 381 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CPNE7Q9UBL6 LRRC47-201ENST00000378251 4310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CPNE7Q9UBL6 NEO1-207ENST00000560262 4315 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CPNE7Q9UBL6 PCDHA1-201ENST00000378133 2726 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
CPNE7Q9UBL6 ANKS6-202ENST00000375019 2586 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CPNE7Q9UBL6 NPC1L1-203ENST00000423141 2554 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CPNE7Q9UBL6 PMS1-212ENST00000432292 3234 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CPNE7Q9UBL6 MOXD1-202ENST00000367963 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CPNE7Q9UBL6 EIF4G3-212ENST00000602326 6196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CPNE7Q9UBL6 HIST1H2AC-203ENST00000602637 1462 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CPNE7Q9UBL6 SLC8B1-210ENST00000550047 2493 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CPNE7Q9UBL6 ACSM2A-203ENST00000417235 1835 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CPNE7Q9UBL6 OGFOD2-202ENST00000397389 2308 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CPNE7Q9UBL6 BRD3-201ENST00000303407 5652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CPNE7Q9UBL6 RUSC1-201ENST00000292254 2163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CPNE7Q9UBL6 AK4-207ENST00000545314 6887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CPNE7Q9UBL6 TCF25-202ENST00000263347 2377 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CPNE7Q9UBL6 ZNF84-208ENST00000539354 3237 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CPNE7Q9UBL6 PCIF1-201ENST00000372409 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CPNE7Q9UBL6 FHL1-207ENST00000394155 2706 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CPNE7Q9UBL6 CBARP-204ENST00000590083 4261 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CPNE7Q9UBL6 SCP2-204ENST00000407246 2239 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CPNE7Q9UBL6 PSMD2-201ENST00000310118 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CPNE7Q9UBL6 PLPPR5-202ENST00000370188 4139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CPNE7Q9UBL6 SNAP47-AS1-201ENST00000413347 1708 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CPNE7Q9UBL6 CCDC90B-203ENST00000525503 1919 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CPNE7Q9UBL6 SLC1A6-208ENST00000598504 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CPNE7Q9UBL6 AL607033.1-201ENST00000623900 1599 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
CPNE7Q9UBL6 WASHC2C-204ENST00000374362 4623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CPNE7Q9UBL6 AC104809.1-201ENST00000425110 2345 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CPNE7Q9UBL6 CTD-2194D22.4-201ENST00000514569 1635 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CPNE7Q9UBL6 TMC7-201ENST00000304381 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CPNE7Q9UBL6 MRPL53-201ENST00000258105 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CPNE7Q9UBL6 SLC9A7-201ENST00000328306 3838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CPNE7Q9UBL6 ZDHHC12-201ENST00000372663 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CPNE7Q9UBL6 AP001056.1-201ENST00000411956 821 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CPNE7Q9UBL6 AC098850.1-201ENST00000419919 790 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
CPNE7Q9UBL6 TMEM247-204ENST00000434431 680 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CPNE7Q9UBL6 KRT18P64-201ENST00000434946 1219 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
CPNE7Q9UBL6 Z98749.2-207ENST00000443658 679 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CPNE7Q9UBL6 RN7SL752P-201ENST00000463779 287 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
CPNE7Q9UBL6 RN7SL399P-201ENST00000471648 279 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
CPNE7Q9UBL6 ELK1P1-201ENST00000485699 580 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
CPNE7Q9UBL6 AC104596.2-201ENST00000512793 793 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
CPNE7Q9UBL6 C8orf88-201ENST00000517562 894 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CPNE7Q9UBL6 IL32-215ENST00000529550 772 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CPNE7Q9UBL6 AC036164.1-201ENST00000570544 333 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
CPNE7Q9UBL6 AC007216.4-201ENST00000574364 562 ntTSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CPNE7Q9UBL6 NOP53-AS1-201ENST00000602048 540 ntTSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CPNE7Q9UBL6 AL391069.4-201ENST00000609583 481 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
CPNE7Q9UBL6 AL158212.4-201ENST00000624062 1286 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
CPNE7Q9UBL6 PRF1-203ENST00000638674 1080 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CPNE7Q9UBL6 CPEB2-203ENST00000382395 5524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CPNE7Q9UBL6 ARHGAP22-201ENST00000249601 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CPNE7Q9UBL6 CCNA2-201ENST00000274026 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CPNE7Q9UBL6 ARL14EP-201ENST00000282032 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CPNE7Q9UBL6 PPFIA3-201ENST00000334186 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CPNE7Q9UBL6 ZMYM3-202ENST00000373978 1511 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CPNE7Q9UBL6 PLCB1-201ENST00000338037 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CPNE7Q9UBL6 DDOST-202ENST00000415136 2126 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CPNE7Q9UBL6 PCBP4-205ENST00000461554 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CPNE7Q9UBL6 LAD1-201ENST00000367313 2336 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CPNE7Q9UBL6 TRIM11-201ENST00000284551 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CPNE7Q9UBL6 KLK15-201ENST00000326856 1389 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.1 ms