Protein–RNA interactions for Protein: Q9D9C6

Ccdc182, Coiled-coil domain-containing protein 182, mousemouse

Predictions only

Length 152 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc182Q9D9C6 Lingo4-201ENSMUST00000050975 3645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ccdc182Q9D9C6 Plod3-201ENSMUST00000004968 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ccdc182Q9D9C6 Polm-202ENSMUST00000109837 2697 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ccdc182Q9D9C6 Psmd9-201ENSMUST00000100729 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ccdc182Q9D9C6 Umod-206ENSMUST00000209095 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ccdc182Q9D9C6 Irf1-203ENSMUST00000108922 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ccdc182Q9D9C6 Cldn15-201ENSMUST00000001790 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ccdc182Q9D9C6 Zfp683-201ENSMUST00000105884 1471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ccdc182Q9D9C6 Ldb3-207ENSMUST00000227819 1499 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Ccdc182Q9D9C6 Hoxd8-203ENSMUST00000151380 557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ccdc182Q9D9C6 Gm12446-202ENSMUST00000152069 713 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ccdc182Q9D9C6 Gm13568-201ENSMUST00000156099 446 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ccdc182Q9D9C6 2410002F23Rik-214ENSMUST00000186606 748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ccdc182Q9D9C6 Gm31326-201ENSMUST00000191856 1048 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Ccdc182Q9D9C6 Gm42839-201ENSMUST00000198978 525 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ccdc182Q9D9C6 Srd5a2-201ENSMUST00000043458 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ccdc182Q9D9C6 Pdlim7-202ENSMUST00000069929 899 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ccdc182Q9D9C6 Vps29-208ENSMUST00000155671 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ccdc182Q9D9C6 Camta1-201ENSMUST00000049790 8423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ccdc182Q9D9C6 Lnx1-209ENSMUST00000153543 2208 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ccdc182Q9D9C6 Lta4h-201ENSMUST00000016033 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ccdc182Q9D9C6 Prmt2-201ENSMUST00000020452 2016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ccdc182Q9D9C6 Tns2-201ENSMUST00000046144 4718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ccdc182Q9D9C6 Fscn2-201ENSMUST00000026445 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ccdc182Q9D9C6 Gm38037-201ENSMUST00000192600 1624 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Ccdc182Q9D9C6 Kcnt1-211ENSMUST00000171268 3771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ccdc182Q9D9C6 Kif1a-202ENSMUST00000112958 5931 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ccdc182Q9D9C6 4732471J01Rik-203ENSMUST00000206300 1887 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ccdc182Q9D9C6 Ppp3r1-201ENSMUST00000102880 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ccdc182Q9D9C6 0610006L08Rik-201ENSMUST00000205326 1589 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ccdc182Q9D9C6 Gm14866-201ENSMUST00000149206 2118 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ccdc182Q9D9C6 Asph-207ENSMUST00000108333 2652 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ccdc182Q9D9C6 Pml-211ENSMUST00000153820 2652 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ccdc182Q9D9C6 B3gntl1-201ENSMUST00000062654 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ccdc182Q9D9C6 Pappa-201ENSMUST00000084501 11027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ccdc182Q9D9C6 Vamp1-203ENSMUST00000100942 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ccdc182Q9D9C6 Il21r-201ENSMUST00000033000 2499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ccdc182Q9D9C6 Prc1-206ENSMUST00000173824 2912 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ccdc182Q9D9C6 Src-201ENSMUST00000029175 3906 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ccdc182Q9D9C6 Trav3d-3-201ENSMUST00000103599 276 ntAPPRIS P1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ccdc182Q9D9C6 Trav3n-3-201ENSMUST00000103625 276 ntAPPRIS P1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ccdc182Q9D9C6 Kir3dl1-201ENSMUST00000113104 1031 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ccdc182Q9D9C6 Gm15770-201ENSMUST00000117498 584 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Ccdc182Q9D9C6 Ptgr2-205ENSMUST00000135001 1286 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ccdc182Q9D9C6 Tac2-202ENSMUST00000179960 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ccdc182Q9D9C6 Trav3-3-202ENSMUST00000183835 276 ntAPPRIS P1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ccdc182Q9D9C6 Mir7221-201ENSMUST00000184009 72 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Ccdc182Q9D9C6 Gm29542-201ENSMUST00000186876 704 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ccdc182Q9D9C6 Armc12-201ENSMUST00000025060 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ccdc182Q9D9C6 Tac2-201ENSMUST00000026466 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ccdc182Q9D9C6 Car5a-201ENSMUST00000057653 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ccdc182Q9D9C6 Mirt1-203ENSMUST00000181539 2259 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ccdc182Q9D9C6 Rps6kb1-202ENSMUST00000058286 3250 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ccdc182Q9D9C6 Cyth3-202ENSMUST00000116456 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ccdc182Q9D9C6 Rasgrp4-214ENSMUST00000205027 2717 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ccdc182Q9D9C6 E2f3-201ENSMUST00000102948 5097 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ccdc182Q9D9C6 Urm1-201ENSMUST00000091142 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ccdc182Q9D9C6 Copb2-201ENSMUST00000035033 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ccdc182Q9D9C6 Hkdc1-201ENSMUST00000020277 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ccdc182Q9D9C6 Gipc3-201ENSMUST00000045102 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ccdc182Q9D9C6 Hpcal4-202ENSMUST00000106246 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ccdc182Q9D9C6 Dmrtc1c1-201ENSMUST00000118218 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ccdc182Q9D9C6 Dmrtc1c2-203ENSMUST00000120314 1611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ccdc182Q9D9C6 Fbf1-202ENSMUST00000106435 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ccdc182Q9D9C6 Gm8108-202ENSMUST00000170207 1961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ccdc182Q9D9C6 AC161252.3-201ENSMUST00000225465 1549 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Ccdc182Q9D9C6 Srp54a-202ENSMUST00000220578 4498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ccdc182Q9D9C6 Zfp853-203ENSMUST00000212715 3133 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ccdc182Q9D9C6 Gm14455-201ENSMUST00000138288 2146 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ccdc182Q9D9C6 Fzd4-201ENSMUST00000058755 6720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ccdc182Q9D9C6 Itgb4-204ENSMUST00000106460 5919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ccdc182Q9D9C6 Folr1-204ENSMUST00000106985 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ccdc182Q9D9C6 Tmem200a-203ENSMUST00000218232 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ccdc182Q9D9C6 Ppp1r9b-202ENSMUST00000107748 3095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ccdc182Q9D9C6 1700001L05Rik-201ENSMUST00000100370 2270 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ccdc182Q9D9C6 Spock3-203ENSMUST00000118003 2860 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ccdc182Q9D9C6 Tcf4-205ENSMUST00000114980 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ccdc182Q9D9C6 AC157950.1-201ENSMUST00000217561 2168 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Ccdc182Q9D9C6 Ptbp1-216ENSMUST00000172282 3110 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ccdc182Q9D9C6 Prss8-202ENSMUST00000206124 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ccdc182Q9D9C6 Agrn-201ENSMUST00000071248 4831 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ccdc182Q9D9C6 Cyp8b1-201ENSMUST00000062474 1950 ntAPPRIS P1 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ccdc182Q9D9C6 Pik3r1-202ENSMUST00000055518 7113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ccdc182Q9D9C6 Ush1c-209ENSMUST00000222454 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ccdc182Q9D9C6 Pde6c-201ENSMUST00000025956 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ccdc182Q9D9C6 Fbxw7-201ENSMUST00000029727 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ccdc182Q9D9C6 Lcmt2-202ENSMUST00000110674 3056 ntAPPRIS P1 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ccdc182Q9D9C6 Lig1-201ENSMUST00000098814 3091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ccdc182Q9D9C6 Wbp1l-201ENSMUST00000099376 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ccdc182Q9D9C6 Tmc8-204ENSMUST00000119455 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ccdc182Q9D9C6 Runx1-201ENSMUST00000023673 5861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ccdc182Q9D9C6 Grm4-202ENSMUST00000118489 2976 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ccdc182Q9D9C6 Mvk-203ENSMUST00000124260 1051 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ccdc182Q9D9C6 B230217C12Rik-204ENSMUST00000170806 1118 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ccdc182Q9D9C6 Cpsf4l-205ENSMUST00000173655 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ccdc182Q9D9C6 Gm17344-202ENSMUST00000173980 621 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ccdc182Q9D9C6 1700025N23Rik-201ENSMUST00000186189 915 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ccdc182Q9D9C6 Gm5279-201ENSMUST00000199575 745 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Ccdc182Q9D9C6 Tbc1d17-209ENSMUST00000207293 692 ntTSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ccdc182Q9D9C6 Coq7-205ENSMUST00000209146 799 ntTSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 69.8 ms