Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWW7

Cxxc1, CXXC-type zinc finger protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 660 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cxxc1Q9CWW7 Dnaaf2-201ENSMUST00000021356 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Cxxc1Q9CWW7 Ripor2-201ENSMUST00000038477 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Cxxc1Q9CWW7 Mboat2-201ENSMUST00000078902 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Cxxc1Q9CWW7 Dok7-203ENSMUST00000114270 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Cxxc1Q9CWW7 Tnk2-201ENSMUST00000115120 2794 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Cxxc1Q9CWW7 Pcdha6-202ENSMUST00000193777 5367 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Cxxc1Q9CWW7 Fam46a-201ENSMUST00000034802 5479 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Cxxc1Q9CWW7 Trim80-201ENSMUST00000093914 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Cxxc1Q9CWW7 Gm2115-201ENSMUST00000180387 7055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Cxxc1Q9CWW7 Erg-206ENSMUST00000122199 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Cxxc1Q9CWW7 Polrmt-202ENSMUST00000159016 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Cxxc1Q9CWW7 Gm38197-201ENSMUST00000192320 2122 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Cxxc1Q9CWW7 Dhx30-201ENSMUST00000062368 3806 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Cxxc1Q9CWW7 Sema6c-202ENSMUST00000090823 4029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Cxxc1Q9CWW7 Hcrtr1-202ENSMUST00000119423 2439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Cxxc1Q9CWW7 Camk2d-202ENSMUST00000066466 4075 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Cxxc1Q9CWW7 Tcirg1-211ENSMUST00000145791 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Cxxc1Q9CWW7 Nek6-203ENSMUST00000112902 3147 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Cxxc1Q9CWW7 Ddx31-201ENSMUST00000113853 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Cxxc1Q9CWW7 Gtf2ird1-201ENSMUST00000073161 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Cxxc1Q9CWW7 Rap1a-ps2-201ENSMUST00000118467 559 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Cxxc1Q9CWW7 Gm12286-201ENSMUST00000119246 1002 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Cxxc1Q9CWW7 Retn-201ENSMUST00000012849 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Cxxc1Q9CWW7 Gm10714-201ENSMUST00000131346 874 ntTSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Cxxc1Q9CWW7 4933403O08Rik-201ENSMUST00000132037 999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Cxxc1Q9CWW7 Cox16-206ENSMUST00000168463 431 ntTSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Cxxc1Q9CWW7 Ighv8-4-201ENSMUST00000178949 294 ntAPPRIS P1 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Cxxc1Q9CWW7 Gm16973-201ENSMUST00000180682 1299 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Cxxc1Q9CWW7 Gm27552-201ENSMUST00000183351 62 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Cxxc1Q9CWW7 Gm27844-201ENSMUST00000183613 62 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Cxxc1Q9CWW7 Snhg8-201ENSMUST00000196466 448 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Cxxc1Q9CWW7 Lsm3-205ENSMUST00000206947 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Cxxc1Q9CWW7 Gm44651-201ENSMUST00000207343 372 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Cxxc1Q9CWW7 Olfr283-201ENSMUST00000057386 1102 ntAPPRIS P1 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Cxxc1Q9CWW7 Xrra1-202ENSMUST00000207855 1334 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Cxxc1Q9CWW7 Spatc1l-201ENSMUST00000009259 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Cxxc1Q9CWW7 Xpr1-203ENSMUST00000111775 4094 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Cxxc1Q9CWW7 Jph2-201ENSMUST00000017961 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Cxxc1Q9CWW7 Tekt2-201ENSMUST00000030658 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Cxxc1Q9CWW7 Nmral1-202ENSMUST00000079130 1459 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Cxxc1Q9CWW7 Atp2a3-203ENSMUST00000108485 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Cxxc1Q9CWW7 Atp2a3-204ENSMUST00000108486 4540 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Cxxc1Q9CWW7 Rxrg-202ENSMUST00000111380 1630 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Cxxc1Q9CWW7 Dnase1l1-201ENSMUST00000019232 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Cxxc1Q9CWW7 E230013L22Rik-201ENSMUST00000180408 1856 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Cxxc1Q9CWW7 Gps1-201ENSMUST00000100134 1925 ntTSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Cxxc1Q9CWW7 Slc25a18-201ENSMUST00000112682 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Cxxc1Q9CWW7 Lsm14b-202ENSMUST00000058764 2566 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Cxxc1Q9CWW7 Opa1-206ENSMUST00000160597 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Cxxc1Q9CWW7 Sipa1-201ENSMUST00000071857 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Cxxc1Q9CWW7 Hps3-202ENSMUST00000108321 3385 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Cxxc1Q9CWW7 Gtf3c5-202ENSMUST00000113889 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Cxxc1Q9CWW7 Zc3h7b-201ENSMUST00000109554 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Cxxc1Q9CWW7 Klk7-201ENSMUST00000032955 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Cxxc1Q9CWW7 Hnrnpc-211ENSMUST00000228748 1691 ntAPPRIS P5 BASIC13□□□□□ -0.33
Cxxc1Q9CWW7 Sgo2a-201ENSMUST00000027202 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Cxxc1Q9CWW7 Gm14371-201ENSMUST00000138925 1518 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Cxxc1Q9CWW7 Alkbh3os1-201ENSMUST00000028621 1549 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Cxxc1Q9CWW7 Ssc5d-201ENSMUST00000057612 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Cxxc1Q9CWW7 Gm15326-202ENSMUST00000128198 1422 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Cxxc1Q9CWW7 4933421I07Rik-201ENSMUST00000032648 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Cxxc1Q9CWW7 Stpg3-201ENSMUST00000043774 1430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Cxxc1Q9CWW7 Ccdc167-202ENSMUST00000128751 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Cxxc1Q9CWW7 Gm11568-201ENSMUST00000107434 1145 ntAPPRIS P1 BASIC13□□□□□ -0.33
Cxxc1Q9CWW7 Fgf18-202ENSMUST00000109363 991 ntTSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
Cxxc1Q9CWW7 Meig1-202ENSMUST00000115081 421 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Cxxc1Q9CWW7 Krtap20-2-201ENSMUST00000169954 528 ntAPPRIS P1 BASIC13□□□□□ -0.33
Cxxc1Q9CWW7 Rims3-204ENSMUST00000171363 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Cxxc1Q9CWW7 Gm5904-201ENSMUST00000210286 865 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Cxxc1Q9CWW7 Pf4-201ENSMUST00000031320 588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Cxxc1Q9CWW7 Asb9-201ENSMUST00000033756 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Cxxc1Q9CWW7 Tmem247-201ENSMUST00000042172 752 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Cxxc1Q9CWW7 Olfr293-201ENSMUST00000081474 1011 ntAPPRIS P1 BASIC13□□□□□ -0.33
Cxxc1Q9CWW7 Lce1e-201ENSMUST00000090867 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Cxxc1Q9CWW7 Kcnh7-202ENSMUST00000112452 2849 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Cxxc1Q9CWW7 Crhr2-201ENSMUST00000003568 2695 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Cxxc1Q9CWW7 Siglecg-201ENSMUST00000005592 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Cxxc1Q9CWW7 Ace3-201ENSMUST00000190995 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Cxxc1Q9CWW7 Kyat1-205ENSMUST00000113662 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Cxxc1Q9CWW7 Psd2-206ENSMUST00000177432 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Cxxc1Q9CWW7 Prrc2a-206ENSMUST00000174805 6741 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Cxxc1Q9CWW7 Abi1-201ENSMUST00000078977 3027 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Cxxc1Q9CWW7 Gli2-201ENSMUST00000062483 6637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Cxxc1Q9CWW7 Gm28539-201ENSMUST00000190050 2982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Cxxc1Q9CWW7 Xkr5-202ENSMUST00000095438 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Cxxc1Q9CWW7 Gm42769-201ENSMUST00000198576 1659 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Cxxc1Q9CWW7 Nmt2-202ENSMUST00000091504 1676 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Cxxc1Q9CWW7 Tmem220-201ENSMUST00000061786 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Cxxc1Q9CWW7 Slc6a19os-201ENSMUST00000022049 1532 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Cxxc1Q9CWW7 Rgs9bp-201ENSMUST00000069912 6590 ntAPPRIS P1 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Cxxc1Q9CWW7 Fam20a-201ENSMUST00000020938 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Cxxc1Q9CWW7 Mcf2l-207ENSMUST00000110876 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Cxxc1Q9CWW7 Myh7-201ENSMUST00000102803 6135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Cxxc1Q9CWW7 Phka1-206ENSMUST00000122022 6115 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Cxxc1Q9CWW7 Phka1-202ENSMUST00000052012 6115 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Cxxc1Q9CWW7 Kcnt1-204ENSMUST00000114176 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Cxxc1Q9CWW7 Sarm1-201ENSMUST00000061174 4083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Cxxc1Q9CWW7 Notch1-201ENSMUST00000028288 9488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Cxxc1Q9CWW7 Nrp2-204ENSMUST00000102822 6708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Cxxc1Q9CWW7 Atg16l1-202ENSMUST00000113186 3004 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
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