Protein–RNA interactions for Protein: Q99NA2

Atoh8, Protein atonal homolog 8, mousemouse

Predictions only

Length 322 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atoh8Q99NA2 Col4a1-201ENSMUST00000033898 6615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Atoh8Q99NA2 Tpr-203ENSMUST00000124973 7430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Atoh8Q99NA2 Mtm1-201ENSMUST00000025391 3286 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Atoh8Q99NA2 Hcrtr1-203ENSMUST00000120154 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Atoh8Q99NA2 Sv2c-203ENSMUST00000182289 2197 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Atoh8Q99NA2 Gucd1-201ENSMUST00000039796 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Atoh8Q99NA2 AC079680.2-201ENSMUST00000219181 1306 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Atoh8Q99NA2 Col7a1-201ENSMUST00000026740 9198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Atoh8Q99NA2 Pigq-209ENSMUST00000140304 1835 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Atoh8Q99NA2 Socs7-201ENSMUST00000045540 7015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Atoh8Q99NA2 Tsku-205ENSMUST00000167405 2597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Atoh8Q99NA2 Irak3-201ENSMUST00000020448 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Atoh8Q99NA2 Pold3-201ENSMUST00000032969 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Atoh8Q99NA2 Nmb-202ENSMUST00000119428 678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Atoh8Q99NA2 Gm11290-203ENSMUST00000147811 314 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Atoh8Q99NA2 Tmem116-209ENSMUST00000156080 1184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Atoh8Q99NA2 Rps19-ps11-201ENSMUST00000160308 433 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Atoh8Q99NA2 Erdr1-201ENSMUST00000177591 774 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Atoh8Q99NA2 1700040D17Rik-201ENSMUST00000181305 998 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Atoh8Q99NA2 Gm3508-201ENSMUST00000186012 792 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Atoh8Q99NA2 5330425B07Rik-201ENSMUST00000196714 1027 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Atoh8Q99NA2 Gm43830-201ENSMUST00000198760 1067 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Atoh8Q99NA2 Gm43584-201ENSMUST00000199762 605 ntTSL 3 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Atoh8Q99NA2 AC166095.1-201ENSMUST00000223731 1241 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Atoh8Q99NA2 1700029I15Rik-201ENSMUST00000054316 364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Atoh8Q99NA2 Dpp6-201ENSMUST00000071500 3826 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Atoh8Q99NA2 Olfr887-201ENSMUST00000074681 930 ntAPPRIS P1 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Atoh8Q99NA2 Cep170b-201ENSMUST00000092279 3817 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Atoh8Q99NA2 Cd81-201ENSMUST00000037941 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Atoh8Q99NA2 Osbpl11-201ENSMUST00000039733 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Atoh8Q99NA2 Igsf9b-202ENSMUST00000133213 4239 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Atoh8Q99NA2 Itga8-201ENSMUST00000028106 5812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Atoh8Q99NA2 Vars-201ENSMUST00000087315 4137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Atoh8Q99NA2 Alox12e-201ENSMUST00000019051 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Atoh8Q99NA2 0610009O20Rik-201ENSMUST00000025314 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Atoh8Q99NA2 Myl6-202ENSMUST00000217733 1668 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Atoh8Q99NA2 Cadps2-209ENSMUST00000142913 4533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.3
Atoh8Q99NA2 Stpg3-201ENSMUST00000043774 1430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Atoh8Q99NA2 Gm43273-201ENSMUST00000199649 2594 ntBASIC13.21□□□□□ -0.3
Atoh8Q99NA2 Sphk2-203ENSMUST00000210060 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Atoh8Q99NA2 Smg5-201ENSMUST00000001451 4448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Atoh8Q99NA2 Ptprk-201ENSMUST00000166468 6177 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Atoh8Q99NA2 Creb3l3-201ENSMUST00000117422 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Atoh8Q99NA2 Rnf214-205ENSMUST00000160699 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Atoh8Q99NA2 Astl-202ENSMUST00000089673 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Atoh8Q99NA2 Ntm-203ENSMUST00000115237 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Atoh8Q99NA2 Rnf4-204ENSMUST00000182047 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Atoh8Q99NA2 Krt31-201ENSMUST00000007318 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Atoh8Q99NA2 Usp18-201ENSMUST00000032198 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Atoh8Q99NA2 Sfswap-201ENSMUST00000053737 3313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Atoh8Q99NA2 AI839979-202ENSMUST00000201790 1539 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Atoh8Q99NA2 Abtb2-201ENSMUST00000076212 4558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Atoh8Q99NA2 Gm42878-202ENSMUST00000200170 4783 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Atoh8Q99NA2 Usp19-201ENSMUST00000006854 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Atoh8Q99NA2 Klhl12-201ENSMUST00000027725 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Atoh8Q99NA2 Tpm1-207ENSMUST00000113687 962 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Atoh8Q99NA2 Rtbdn-203ENSMUST00000121880 1223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Atoh8Q99NA2 D630024D03Rik-201ENSMUST00000126265 720 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Atoh8Q99NA2 Gm9550-201ENSMUST00000161130 862 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Atoh8Q99NA2 4833427G06Rik-201ENSMUST00000170947 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Atoh8Q99NA2 1700030M09Rik-202ENSMUST00000181679 964 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Atoh8Q99NA2 Pmvk-203ENSMUST00000184515 1156 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Atoh8Q99NA2 Gm7467-201ENSMUST00000185173 652 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
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Atoh8Q99NA2 Gm44651-201ENSMUST00000207343 372 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Atoh8Q99NA2 Gm45118-201ENSMUST00000208928 825 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Atoh8Q99NA2 Gm31793-201ENSMUST00000218557 415 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Atoh8Q99NA2 Crcp-201ENSMUST00000026608 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Atoh8Q99NA2 BB123696-201ENSMUST00000222580 2056 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Atoh8Q99NA2 Gm5939-201ENSMUST00000119613 2874 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Atoh8Q99NA2 Rcor2-202ENSMUST00000113369 2013 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Atoh8Q99NA2 E230029C05Rik-202ENSMUST00000207458 2445 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Atoh8Q99NA2 Mslnl-201ENSMUST00000047098 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Atoh8Q99NA2 Gm9754-201ENSMUST00000031305 3004 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Atoh8Q99NA2 Nrf1-211ENSMUST00000115212 3584 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Atoh8Q99NA2 Erlin1-206ENSMUST00000170801 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Atoh8Q99NA2 5330426L24Rik-201ENSMUST00000200008 2175 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Atoh8Q99NA2 Bscl2-210ENSMUST00000171649 1962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Atoh8Q99NA2 Wwc2-201ENSMUST00000057561 8678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Atoh8Q99NA2 Arid4b-203ENSMUST00000110534 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Atoh8Q99NA2 Prrt3-201ENSMUST00000101059 3304 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Atoh8Q99NA2 Tgm1-203ENSMUST00000178034 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Atoh8Q99NA2 Foxred2-201ENSMUST00000016696 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Atoh8Q99NA2 Pak4-201ENSMUST00000032823 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Atoh8Q99NA2 Insr-201ENSMUST00000091291 9355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Atoh8Q99NA2 Nfic-202ENSMUST00000078185 3163 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Atoh8Q99NA2 Ace-202ENSMUST00000001964 2418 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Atoh8Q99NA2 Synj1-203ENSMUST00000121759 7090 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Atoh8Q99NA2 Adat1-203ENSMUST00000139820 2762 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Atoh8Q99NA2 Zfp202-201ENSMUST00000026693 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Atoh8Q99NA2 Lmf2-201ENSMUST00000023283 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Atoh8Q99NA2 Mtss1-201ENSMUST00000080371 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Atoh8Q99NA2 Dynlrb1-202ENSMUST00000109682 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Atoh8Q99NA2 Gm16481-201ENSMUST00000119074 1227 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Atoh8Q99NA2 1110002L01Rik-203ENSMUST00000179637 586 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Atoh8Q99NA2 Gm38092-201ENSMUST00000195600 653 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Atoh8Q99NA2 Gm43416-201ENSMUST00000201916 1015 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Atoh8Q99NA2 Rassf4-202ENSMUST00000203029 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Atoh8Q99NA2 Saa2-202ENSMUST00000210272 511 ntTSL 3 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Atoh8Q99NA2 AC166051.1-201ENSMUST00000214313 210 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
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