Protein–RNA interactions for Protein: Q91VW3

Sh3bgrl3, SH3 domain-binding glutamic acid-rich-like protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 93 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3bgrl3Q91VW3 Gm5641-202ENSMUST00000198699 1080 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
Sh3bgrl3Q91VW3 Tmem129-204ENSMUST00000200849 657 ntTSL 3 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Sh3bgrl3Q91VW3 1700025J12Rik-201ENSMUST00000205586 630 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Sh3bgrl3Q91VW3 5830408C22Rik-201ENSMUST00000210072 1115 ntTSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Sh3bgrl3Q91VW3 CT573086.1-201ENSMUST00000227202 1074 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
Sh3bgrl3Q91VW3 Tbcd-201ENSMUST00000103013 3906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Sh3bgrl3Q91VW3 Adm-201ENSMUST00000033054 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Sh3bgrl3Q91VW3 Apol6-206ENSMUST00000149569 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Sh3bgrl3Q91VW3 Gm43174-201ENSMUST00000195914 2445 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
Sh3bgrl3Q91VW3 Ppara-203ENSMUST00000109423 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Sh3bgrl3Q91VW3 Hspa2-202ENSMUST00000219555 2526 ntAPPRIS P1 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Sh3bgrl3Q91VW3 Nt5c2-202ENSMUST00000168536 3769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Sh3bgrl3Q91VW3 Tcf25-201ENSMUST00000057934 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Sh3bgrl3Q91VW3 Pja1-204ENSMUST00000113797 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Sh3bgrl3Q91VW3 Brf2-201ENSMUST00000033877 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Sh3bgrl3Q91VW3 Gcdh-201ENSMUST00000003907 2167 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Sh3bgrl3Q91VW3 Ly75-202ENSMUST00000112533 6901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Sh3bgrl3Q91VW3 Lysmd1-201ENSMUST00000066386 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Sh3bgrl3Q91VW3 Atg7-210ENSMUST00000182793 2459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Sh3bgrl3Q91VW3 AC164426.2-201ENSMUST00000225993 2492 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
Sh3bgrl3Q91VW3 Stox2-209ENSMUST00000211882 9696 ntTSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Sh3bgrl3Q91VW3 Cnot7-211ENSMUST00000149992 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Sh3bgrl3Q91VW3 Arhgef2-206ENSMUST00000175779 3065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Sh3bgrl3Q91VW3 Vsx2-201ENSMUST00000021665 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Sh3bgrl3Q91VW3 Arhgap30-201ENSMUST00000056449 4494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Sh3bgrl3Q91VW3 Dip2a-202ENSMUST00000105417 6383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Sh3bgrl3Q91VW3 Pfkfb3-204ENSMUST00000114844 2107 ntTSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Sh3bgrl3Q91VW3 Specc1-213ENSMUST00000202179 6676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Sh3bgrl3Q91VW3 Rps6ka6-210ENSMUST00000137712 2410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Sh3bgrl3Q91VW3 Luc7l2-207ENSMUST00000161227 2405 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Sh3bgrl3Q91VW3 Plekha2-204ENSMUST00000128715 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Sh3bgrl3Q91VW3 Rph3al-204ENSMUST00000121287 2199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Sh3bgrl3Q91VW3 Slc23a4-201ENSMUST00000044387 2175 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Sh3bgrl3Q91VW3 Slc30a3-206ENSMUST00000202740 1989 ntTSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Sh3bgrl3Q91VW3 Syncrip-209ENSMUST00000174361 1767 ntTSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Sh3bgrl3Q91VW3 Gm16534-201ENSMUST00000149300 1492 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Sh3bgrl3Q91VW3 Crx-203ENSMUST00000172758 1469 ntTSL 3 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Sh3bgrl3Q91VW3 Lat2-205ENSMUST00000200998 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Sh3bgrl3Q91VW3 Atf7ip2-203ENSMUST00000117220 1230 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Sh3bgrl3Q91VW3 Ptgr2-205ENSMUST00000135001 1286 ntTSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Sh3bgrl3Q91VW3 Prss45-202ENSMUST00000146794 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Sh3bgrl3Q91VW3 AC155937.1-202ENSMUST00000156229 621 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Sh3bgrl3Q91VW3 Fbxw4-209ENSMUST00000162433 789 ntTSL 3 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Sh3bgrl3Q91VW3 Synj2bp-205ENSMUST00000169158 691 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Sh3bgrl3Q91VW3 Gm44124-201ENSMUST00000204159 472 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
Sh3bgrl3Q91VW3 Gm35082-201ENSMUST00000207308 338 ntTSL 3 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Sh3bgrl3Q91VW3 Gm16476-201ENSMUST00000221544 139 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
Sh3bgrl3Q91VW3 Lce1b-201ENSMUST00000029531 647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Sh3bgrl3Q91VW3 Rxfp4-201ENSMUST00000063119 1245 ntAPPRIS P1 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Sh3bgrl3Q91VW3 Rec114-201ENSMUST00000098674 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Sh3bgrl3Q91VW3 Pyroxd2-201ENSMUST00000076505 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Sh3bgrl3Q91VW3 Lnx1-201ENSMUST00000039744 2727 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Sh3bgrl3Q91VW3 Epha5-206ENSMUST00000113406 4606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Sh3bgrl3Q91VW3 Arhgef3-204ENSMUST00000225949 3198 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
Sh3bgrl3Q91VW3 Ces2f-201ENSMUST00000076384 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Sh3bgrl3Q91VW3 Wdr89-201ENSMUST00000062370 2979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Sh3bgrl3Q91VW3 Fbxl22-201ENSMUST00000056890 3935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Sh3bgrl3Q91VW3 Rgs7bp-201ENSMUST00000063551 7077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Sh3bgrl3Q91VW3 Tal1-203ENSMUST00000161601 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Sh3bgrl3Q91VW3 Duox2-201ENSMUST00000053734 5744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Sh3bgrl3Q91VW3 Samd4-201ENSMUST00000022386 4564 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Sh3bgrl3Q91VW3 Fmo2-202ENSMUST00000111510 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Sh3bgrl3Q91VW3 Rgs3-205ENSMUST00000107424 4084 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Sh3bgrl3Q91VW3 Wdr45-223ENSMUST00000207675 1335 ntTSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Sh3bgrl3Q91VW3 Olfr61-202ENSMUST00000210241 1348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Sh3bgrl3Q91VW3 Tmem199-201ENSMUST00000052566 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Sh3bgrl3Q91VW3 Slc44a1-204ENSMUST00000107647 2176 ntTSL 2 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Sh3bgrl3Q91VW3 Extl3-203ENSMUST00000225633 6013 ntAPPRIS P1 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Sh3bgrl3Q91VW3 Phrf1-202ENSMUST00000122143 4864 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Sh3bgrl3Q91VW3 Rara-201ENSMUST00000068133 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Sh3bgrl3Q91VW3 Arhgap4-203ENSMUST00000114405 6299 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Sh3bgrl3Q91VW3 Fgf12-201ENSMUST00000100024 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Sh3bgrl3Q91VW3 BC051537-201ENSMUST00000183290 1668 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Sh3bgrl3Q91VW3 Dcaf1-202ENSMUST00000159645 4945 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Sh3bgrl3Q91VW3 Cry2-201ENSMUST00000090559 3976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Sh3bgrl3Q91VW3 AC149222.1-201ENSMUST00000154987 5188 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Sh3bgrl3Q91VW3 Kctd18-210ENSMUST00000164963 2114 ntTSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Sh3bgrl3Q91VW3 Ttbk2-202ENSMUST00000057135 11066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Sh3bgrl3Q91VW3 Tram1l1-201ENSMUST00000058994 3889 ntAPPRIS P1 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Sh3bgrl3Q91VW3 Sspn-201ENSMUST00000032383 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Sh3bgrl3Q91VW3 Gm26584-201ENSMUST00000180551 3216 ntTSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Sh3bgrl3Q91VW3 Rpl22-208ENSMUST00000188151 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Sh3bgrl3Q91VW3 L3mbtl2-208ENSMUST00000174229 2578 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Sh3bgrl3Q91VW3 Spata7-203ENSMUST00000101146 1913 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Sh3bgrl3Q91VW3 Sirt5-211ENSMUST00000223194 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Sh3bgrl3Q91VW3 Tnnc2-201ENSMUST00000103095 700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Sh3bgrl3Q91VW3 Rab1a-202ENSMUST00000109601 1200 ntTSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Sh3bgrl3Q91VW3 Med28-202ENSMUST00000118833 734 ntTSL 2 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Sh3bgrl3Q91VW3 1700086L19Rik-202ENSMUST00000185822 1028 ntTSL 3 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Sh3bgrl3Q91VW3 Gm18766-201ENSMUST00000189811 808 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Sh3bgrl3Q91VW3 1810059H22Rik-208ENSMUST00000204941 642 ntTSL 2 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Sh3bgrl3Q91VW3 Gm18636-201ENSMUST00000218846 1066 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Sh3bgrl3Q91VW3 Gzma-201ENSMUST00000023897 878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Sh3bgrl3Q91VW3 Rpp21-201ENSMUST00000025319 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Sh3bgrl3Q91VW3 Klk1-201ENSMUST00000075162 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Sh3bgrl3Q91VW3 Ndufb6-201ENSMUST00000095128 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Sh3bgrl3Q91VW3 Sh3tc1-201ENSMUST00000070203 4549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Sh3bgrl3Q91VW3 Agtrap-201ENSMUST00000030865 3996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Sh3bgrl3Q91VW3 Aebp2-206ENSMUST00000161335 2524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Sh3bgrl3Q91VW3 Mast4-207ENSMUST00000167058 10636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
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