Protein–RNA interactions for Protein: Q80VM8

Pnma8a, Paraneoplastic antigen-like protein 8A, mousemouse

Predictions only

Length 430 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pnma8aQ80VM8 Slc22a15-201ENSMUST00000106928 6573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Pnma8aQ80VM8 Fam118b-203ENSMUST00000121564 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Pnma8aQ80VM8 Fancc-201ENSMUST00000073029 3165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Pnma8aQ80VM8 Ccdc94-201ENSMUST00000086869 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Pnma8aQ80VM8 H2-T22-201ENSMUST00000058801 1534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Pnma8aQ80VM8 Magi1-206ENSMUST00000203688 4969 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Pnma8aQ80VM8 Gal3st4-203ENSMUST00000161647 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Pnma8aQ80VM8 Gtf2ird1-212ENSMUST00000200944 3133 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Pnma8aQ80VM8 Gdf6-201ENSMUST00000057613 3532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Pnma8aQ80VM8 Actn1-201ENSMUST00000021554 3734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Pnma8aQ80VM8 9930014A18Rik-201ENSMUST00000180730 3074 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Pnma8aQ80VM8 Nek1-201ENSMUST00000034065 5401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Pnma8aQ80VM8 4930423D22Rik-201ENSMUST00000221909 1674 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
Pnma8aQ80VM8 Gm8706-201ENSMUST00000197372 1491 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
Pnma8aQ80VM8 Wfdc9-202ENSMUST00000109335 547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Pnma8aQ80VM8 Gm2231-201ENSMUST00000125661 612 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
Pnma8aQ80VM8 Gm11851-201ENSMUST00000132219 692 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Pnma8aQ80VM8 Gm13850-201ENSMUST00000140465 623 ntTSL 3 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Pnma8aQ80VM8 Gm17180-201ENSMUST00000172211 435 ntTSL 3 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Pnma8aQ80VM8 Gm37042-201ENSMUST00000193816 581 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
Pnma8aQ80VM8 Gm19184-201ENSMUST00000196798 928 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
Pnma8aQ80VM8 Gm7172-201ENSMUST00000218047 1152 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
Pnma8aQ80VM8 Brk1-201ENSMUST00000035725 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Pnma8aQ80VM8 Ccdc113-201ENSMUST00000041569 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Pnma8aQ80VM8 Prss2-201ENSMUST00000070380 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Pnma8aQ80VM8 Chst3-201ENSMUST00000068690 5985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Pnma8aQ80VM8 Tars2-201ENSMUST00000029752 2400 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Pnma8aQ80VM8 Cog1-201ENSMUST00000018805 3935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Pnma8aQ80VM8 Gm20605-201ENSMUST00000177545 4464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Pnma8aQ80VM8 Ccdc126-202ENSMUST00000114491 2372 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Pnma8aQ80VM8 Skp1a-201ENSMUST00000037324 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Pnma8aQ80VM8 Rusc1-201ENSMUST00000052539 3316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Pnma8aQ80VM8 Cep68-201ENSMUST00000050611 4804 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Pnma8aQ80VM8 Slc25a25-201ENSMUST00000028160 3294 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Pnma8aQ80VM8 Smug1-201ENSMUST00000064067 3281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Pnma8aQ80VM8 Tufm-202ENSMUST00000106392 1754 ntTSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Pnma8aQ80VM8 Gadl1-203ENSMUST00000121770 1763 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Pnma8aQ80VM8 Golim4-202ENSMUST00000117242 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Pnma8aQ80VM8 Cdk10-212ENSMUST00000213005 1580 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Pnma8aQ80VM8 Lims1-202ENSMUST00000020078 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Pnma8aQ80VM8 Trpv4-204ENSMUST00000112222 2475 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Pnma8aQ80VM8 Hmox2-201ENSMUST00000004172 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Pnma8aQ80VM8 Ankrd61-201ENSMUST00000079624 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Pnma8aQ80VM8 Syngr2-201ENSMUST00000026649 1520 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Pnma8aQ80VM8 Nkd2-201ENSMUST00000022051 4016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Pnma8aQ80VM8 Hdgfl2-210ENSMUST00000225843 2238 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Pnma8aQ80VM8 Trabd2b-201ENSMUST00000094894 6617 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Pnma8aQ80VM8 Ssr1-203ENSMUST00000225246 1825 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Pnma8aQ80VM8 Kcnc1-203ENSMUST00000160433 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Pnma8aQ80VM8 Brd2-201ENSMUST00000025193 4374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Pnma8aQ80VM8 Gnaz-202ENSMUST00000159991 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Pnma8aQ80VM8 Ppih-203ENSMUST00000106318 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Pnma8aQ80VM8 Pelp1-202ENSMUST00000135148 562 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Pnma8aQ80VM8 Armc2-208ENSMUST00000162405 1135 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Pnma8aQ80VM8 Prss51-202ENSMUST00000165710 953 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Pnma8aQ80VM8 AC110091.3-202ENSMUST00000217104 791 ntTSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Pnma8aQ80VM8 Gm19163-201ENSMUST00000223313 780 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Pnma8aQ80VM8 Comt-201ENSMUST00000000335 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Pnma8aQ80VM8 Gm9823-201ENSMUST00000051212 327 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Pnma8aQ80VM8 Klhl26-201ENSMUST00000066597 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Pnma8aQ80VM8 Pdp1-205ENSMUST00000108301 2635 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Pnma8aQ80VM8 Arhgap10-202ENSMUST00000210519 2295 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Pnma8aQ80VM8 Fetub-201ENSMUST00000023587 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Pnma8aQ80VM8 Phactr3-205ENSMUST00000108917 4858 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Pnma8aQ80VM8 Vash2-201ENSMUST00000047409 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Pnma8aQ80VM8 Sptb-201ENSMUST00000021458 10394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Pnma8aQ80VM8 Dus2-201ENSMUST00000034375 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Pnma8aQ80VM8 Plagl1-201ENSMUST00000121325 3946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Pnma8aQ80VM8 Ifnlr1-201ENSMUST00000074408 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Pnma8aQ80VM8 Atp9a-201ENSMUST00000029060 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Pnma8aQ80VM8 Sstr5-202ENSMUST00000165183 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Pnma8aQ80VM8 Slc25a22-223ENSMUST00000201710 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Pnma8aQ80VM8 Draxin-201ENSMUST00000030862 5200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Pnma8aQ80VM8 Ablim2-203ENSMUST00000114203 1333 ntTSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Pnma8aQ80VM8 Arid3a-201ENSMUST00000019708 5361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Pnma8aQ80VM8 Gpr12-203ENSMUST00000197431 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Pnma8aQ80VM8 Setdb2-201ENSMUST00000095775 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Pnma8aQ80VM8 Noto-201ENSMUST00000089578 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Pnma8aQ80VM8 Nfatc2-204ENSMUST00000109184 6828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Pnma8aQ80VM8 Txn2-202ENSMUST00000100486 676 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Pnma8aQ80VM8 Gm10392-201ENSMUST00000100807 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Pnma8aQ80VM8 Lrguk-202ENSMUST00000101564 967 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Pnma8aQ80VM8 Hspb7-201ENSMUST00000102486 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Pnma8aQ80VM8 Rps3-202ENSMUST00000107096 952 ntTSL 3 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Pnma8aQ80VM8 Gm11751-201ENSMUST00000126187 460 ntTSL 3 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Pnma8aQ80VM8 Gm20521-201ENSMUST00000134077 1245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Pnma8aQ80VM8 Spdye4b-202ENSMUST00000159781 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Pnma8aQ80VM8 2010320O07Rik-201ENSMUST00000160935 525 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Pnma8aQ80VM8 Zdhhc4-208ENSMUST00000161915 1216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Pnma8aQ80VM8 Gcom1-201ENSMUST00000163998 1726 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Pnma8aQ80VM8 Asgr1-201ENSMUST00000018699 1259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Pnma8aQ80VM8 Gm28380-201ENSMUST00000188800 385 ntTSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Pnma8aQ80VM8 Gm38411-201ENSMUST00000197971 941 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Pnma8aQ80VM8 Gm44094-201ENSMUST00000204703 2030 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Pnma8aQ80VM8 Gm39318-201ENSMUST00000214606 1118 ntTSL 3 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Pnma8aQ80VM8 Mcm8-202ENSMUST00000066559 3397 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Pnma8aQ80VM8 n-R5s77-201ENSMUST00000083757 119 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Pnma8aQ80VM8 Mdk-203ENSMUST00000090602 714 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Pnma8aQ80VM8 Prpf38b-201ENSMUST00000029480 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Pnma8aQ80VM8 Frmpd4-204ENSMUST00000112149 8456 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.7 ms