Protein–RNA interactions for Protein: Q6P5D8

Smchd1, Structural maintenance of chromosomes flexible hinge domain-containing protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,007 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smchd1Q6P5D8 Mlh1-201ENSMUST00000035079 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Smchd1Q6P5D8 Dhx58os-201ENSMUST00000137154 1594 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Smchd1Q6P5D8 Plekhd1-201ENSMUST00000140770 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Smchd1Q6P5D8 Gm7993-201ENSMUST00000200970 1384 ntBASIC14□□□□□ -0.17
Smchd1Q6P5D8 Gpat3-201ENSMUST00000031255 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Smchd1Q6P5D8 Cd247-201ENSMUST00000005907 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Smchd1Q6P5D8 Klk1b16-201ENSMUST00000005933 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Smchd1Q6P5D8 Phyhd1-202ENSMUST00000091132 1353 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Smchd1Q6P5D8 Sox1ot-202ENSMUST00000186174 7420 ntTSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
Smchd1Q6P5D8 Kif11-201ENSMUST00000012587 4819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Smchd1Q6P5D8 AC113441.2-201ENSMUST00000221538 1468 ntBASIC14□□□□□ -0.17
Smchd1Q6P5D8 Rnf123-214ENSMUST00000162355 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Smchd1Q6P5D8 AC126444.1-201ENSMUST00000225938 1768 ntBASIC14□□□□□ -0.17
Smchd1Q6P5D8 Abcg5-201ENSMUST00000066175 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Smchd1Q6P5D8 Gm11210-201ENSMUST00000150203 422 ntTSL 3 BASIC14□□□□□ -0.17
Smchd1Q6P5D8 Ly6g5b-202ENSMUST00000172854 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Smchd1Q6P5D8 Rn7s1-201ENSMUST00000174924 300 ntBASIC14□□□□□ -0.17
Smchd1Q6P5D8 Rn7s2-201ENSMUST00000175032 300 ntBASIC14□□□□□ -0.17
Smchd1Q6P5D8 Gm26461-201ENSMUST00000175064 290 ntBASIC14□□□□□ -0.17
Smchd1Q6P5D8 Rlbp1-202ENSMUST00000179243 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Smchd1Q6P5D8 H2al1g-201ENSMUST00000179859 509 ntAPPRIS P1 BASIC14□□□□□ -0.17
Smchd1Q6P5D8 AC155813.1-201ENSMUST00000213224 590 ntTSL 3 BASIC14□□□□□ -0.17
Smchd1Q6P5D8 Asphd1-201ENSMUST00000052937 730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Smchd1Q6P5D8 Pphln1-202ENSMUST00000068457 3816 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Smchd1Q6P5D8 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Smchd1Q6P5D8 Gdf6-201ENSMUST00000057613 3532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Smchd1Q6P5D8 Asb10-201ENSMUST00000048302 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Smchd1Q6P5D8 Hnf1b-202ENSMUST00000108113 2376 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Smchd1Q6P5D8 Actrt2-201ENSMUST00000060062 1435 ntAPPRIS P1 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Smchd1Q6P5D8 Gm16958-201ENSMUST00000180603 1765 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Smchd1Q6P5D8 Gm43858-201ENSMUST00000199418 1778 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
Smchd1Q6P5D8 Vars-201ENSMUST00000087315 4137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Smchd1Q6P5D8 Spop-202ENSMUST00000107724 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Smchd1Q6P5D8 Cldn15-201ENSMUST00000001790 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Smchd1Q6P5D8 Wdr45-204ENSMUST00000115689 1568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Smchd1Q6P5D8 Trpm1-219ENSMUST00000206314 2323 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Smchd1Q6P5D8 Ccdc28b-202ENSMUST00000106035 821 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Smchd1Q6P5D8 Styxl1-205ENSMUST00000111164 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Smchd1Q6P5D8 Pqbp1-203ENSMUST00000115655 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Smchd1Q6P5D8 Gm13061-201ENSMUST00000137962 664 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Smchd1Q6P5D8 Dnajc25-204ENSMUST00000152199 1141 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Smchd1Q6P5D8 Gm24749-201ENSMUST00000157838 343 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
Smchd1Q6P5D8 Gm25732-201ENSMUST00000175168 60 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
Smchd1Q6P5D8 Gm37388-201ENSMUST00000193984 429 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Smchd1Q6P5D8 Gm35082-202ENSMUST00000208164 525 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Smchd1Q6P5D8 Gm8712-201ENSMUST00000221090 701 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
Smchd1Q6P5D8 Mettl5-201ENSMUST00000060447 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Smchd1Q6P5D8 Ccdc28a-202ENSMUST00000080860 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Smchd1Q6P5D8 Pjvk-201ENSMUST00000099986 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Smchd1Q6P5D8 Fnbp1-203ENSMUST00000100207 1680 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Smchd1Q6P5D8 Arhgef39-201ENSMUST00000054538 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Smchd1Q6P5D8 Gprc5a-201ENSMUST00000050104 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Smchd1Q6P5D8 Sh2d7-202ENSMUST00000118413 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Smchd1Q6P5D8 H2-Ob-204ENSMUST00000173764 1319 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Smchd1Q6P5D8 Nkx6-3-201ENSMUST00000071588 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Smchd1Q6P5D8 Gm36864-203ENSMUST00000223070 1513 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Smchd1Q6P5D8 Gm9530-201ENSMUST00000181160 3281 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Smchd1Q6P5D8 Reps2-202ENSMUST00000112334 7675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Smchd1Q6P5D8 Dnaja1-210ENSMUST00000164233 5622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Smchd1Q6P5D8 Cd27-201ENSMUST00000032486 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Smchd1Q6P5D8 Atg7-212ENSMUST00000182902 2543 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Smchd1Q6P5D8 Tuba1a-201ENSMUST00000097014 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Smchd1Q6P5D8 Mast2-201ENSMUST00000003908 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Smchd1Q6P5D8 Vps36-201ENSMUST00000033866 3574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Smchd1Q6P5D8 Uchl1os-201ENSMUST00000152002 1685 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Smchd1Q6P5D8 Hmx2-201ENSMUST00000051997 3102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Smchd1Q6P5D8 Tpgs2-201ENSMUST00000115817 4159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Smchd1Q6P5D8 Smyd3-202ENSMUST00000111134 1229 ntTSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Smchd1Q6P5D8 Gm12314-201ENSMUST00000118104 538 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
Smchd1Q6P5D8 Nmb-202ENSMUST00000119428 678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Smchd1Q6P5D8 Gm15547-201ENSMUST00000122152 333 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
Smchd1Q6P5D8 Gm13832-202ENSMUST00000151159 370 ntTSL 3 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Smchd1Q6P5D8 1700031P21Rik-203ENSMUST00000191400 466 ntTSL 3 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Smchd1Q6P5D8 Polr2i-201ENSMUST00000019882 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Smchd1Q6P5D8 Gm5869-201ENSMUST00000200248 1257 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
Smchd1Q6P5D8 Gm44262-201ENSMUST00000204969 372 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
Smchd1Q6P5D8 Gm19605-202ENSMUST00000221514 1084 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Smchd1Q6P5D8 Rps15-202ENSMUST00000068408 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Smchd1Q6P5D8 Inpp5a-202ENSMUST00000097975 2301 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Smchd1Q6P5D8 Gm13003-201ENSMUST00000151040 2904 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Smchd1Q6P5D8 Engase-202ENSMUST00000135383 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Smchd1Q6P5D8 Gm6210-201ENSMUST00000204734 1942 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
Smchd1Q6P5D8 Atp6v1h-201ENSMUST00000044369 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Smchd1Q6P5D8 Gm42840-201ENSMUST00000200303 2251 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
Smchd1Q6P5D8 Ddx23-201ENSMUST00000003450 3187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Smchd1Q6P5D8 Adamts20-201ENSMUST00000035342 6027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Smchd1Q6P5D8 Gm43045-201ENSMUST00000198725 2095 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
Smchd1Q6P5D8 Cwc27-201ENSMUST00000022228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Smchd1Q6P5D8 Sema5b-202ENSMUST00000120756 4646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Smchd1Q6P5D8 Gm595-201ENSMUST00000114928 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Smchd1Q6P5D8 C230066G23Rik-201ENSMUST00000150195 650 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Smchd1Q6P5D8 AC161537.1-201ENSMUST00000226199 1015 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
Smchd1Q6P5D8 Olfr272-201ENSMUST00000051600 962 ntAPPRIS P1 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Smchd1Q6P5D8 Atp6ap1-202ENSMUST00000114171 2157 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Smchd1Q6P5D8 Hdac7-202ENSMUST00000088402 4223 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Smchd1Q6P5D8 Gpr132-201ENSMUST00000021729 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Smchd1Q6P5D8 Fnbp1-202ENSMUST00000075326 1761 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Smchd1Q6P5D8 Gm1661-203ENSMUST00000165128 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Smchd1Q6P5D8 Chd1-202ENSMUST00000024627 7916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Smchd1Q6P5D8 Rabep2-202ENSMUST00000106407 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
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