Protein–RNA interactions for Protein: Q3V0L5

Lrrc43, Leucine-rich repeat-containing protein 43, mousemouse

Predictions only

Length 667 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrc43Q3V0L5 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Lrrc43Q3V0L5 Prrxl1-202ENSMUST00000186452 2371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Lrrc43Q3V0L5 Gtf2f1-201ENSMUST00000002733 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Lrrc43Q3V0L5 Muc1-201ENSMUST00000041142 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Lrrc43Q3V0L5 Spin1-201ENSMUST00000095797 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Lrrc43Q3V0L5 Phactr2-201ENSMUST00000079698 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Lrrc43Q3V0L5 Dot1l-201ENSMUST00000105336 6808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Lrrc43Q3V0L5 Abra-201ENSMUST00000054742 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Lrrc43Q3V0L5 Cyb5d1-202ENSMUST00000108660 1034 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Lrrc43Q3V0L5 Gcdh-202ENSMUST00000109745 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Lrrc43Q3V0L5 Tmsb10-201ENSMUST00000114048 623 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Lrrc43Q3V0L5 Gm11331-201ENSMUST00000119764 288 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Lrrc43Q3V0L5 Dusp13-204ENSMUST00000120984 976 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Lrrc43Q3V0L5 Gm22985-201ENSMUST00000122754 116 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Lrrc43Q3V0L5 Pdlim2-204ENSMUST00000127836 920 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Lrrc43Q3V0L5 Gm454-201ENSMUST00000160126 751 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Lrrc43Q3V0L5 Gstp1-201ENSMUST00000169613 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Lrrc43Q3V0L5 Gm5523-201ENSMUST00000180415 997 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Lrrc43Q3V0L5 Gm37201-201ENSMUST00000191845 523 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Lrrc43Q3V0L5 4930533L02Rik-201ENSMUST00000194425 1160 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Lrrc43Q3V0L5 Gm43050-201ENSMUST00000201062 338 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Lrrc43Q3V0L5 Gm21027-201ENSMUST00000219300 1236 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Lrrc43Q3V0L5 AC154643.1-201ENSMUST00000225643 625 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Lrrc43Q3V0L5 Rsph1-201ENSMUST00000024832 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Lrrc43Q3V0L5 Kcnk7-201ENSMUST00000052448 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Lrrc43Q3V0L5 Adm2-201ENSMUST00000066991 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Lrrc43Q3V0L5 AU040320-202ENSMUST00000102607 4191 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Lrrc43Q3V0L5 Mme-206ENSMUST00000194150 3345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Lrrc43Q3V0L5 Gm13615-201ENSMUST00000120242 1612 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Lrrc43Q3V0L5 Gm4864-201ENSMUST00000219894 1461 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Lrrc43Q3V0L5 Sema4c-201ENSMUST00000114991 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Lrrc43Q3V0L5 Rsbn1l-201ENSMUST00000036489 5550 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Lrrc43Q3V0L5 Usp33-201ENSMUST00000026507 4153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Lrrc43Q3V0L5 Wwox-201ENSMUST00000004756 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Lrrc43Q3V0L5 F830115B05Rik-201ENSMUST00000197638 1894 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Lrrc43Q3V0L5 Sema3b-201ENSMUST00000073448 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Lrrc43Q3V0L5 Psap-202ENSMUST00000105465 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Lrrc43Q3V0L5 Cnmd-203ENSMUST00000165835 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Lrrc43Q3V0L5 Olfr1428-202ENSMUST00000208391 1368 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Lrrc43Q3V0L5 Krt31-201ENSMUST00000007318 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Lrrc43Q3V0L5 Hnf4a-202ENSMUST00000109411 4362 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Lrrc43Q3V0L5 Usp18-201ENSMUST00000032198 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Lrrc43Q3V0L5 Snx14-204ENSMUST00000165315 3109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Lrrc43Q3V0L5 Kif7-204ENSMUST00000184137 4093 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Lrrc43Q3V0L5 Arid3a-202ENSMUST00000105376 4892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Lrrc43Q3V0L5 Gm4782-201ENSMUST00000168705 2046 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Lrrc43Q3V0L5 Irf3-201ENSMUST00000003284 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Lrrc43Q3V0L5 Pcdha1-202ENSMUST00000193839 4925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Lrrc43Q3V0L5 Mkrn1-201ENSMUST00000031985 3046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Lrrc43Q3V0L5 Tmsb15b1-201ENSMUST00000113071 439 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Lrrc43Q3V0L5 Rhox2c-201ENSMUST00000115190 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Lrrc43Q3V0L5 Gm15245-201ENSMUST00000129410 1186 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Lrrc43Q3V0L5 Hmgn1-202ENSMUST00000133885 261 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Lrrc43Q3V0L5 Gm14024-201ENSMUST00000141964 560 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Lrrc43Q3V0L5 Aknaos-201ENSMUST00000144095 1104 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Lrrc43Q3V0L5 Vmn1r169-201ENSMUST00000170290 915 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Lrrc43Q3V0L5 4933402C06Rik-203ENSMUST00000207559 1227 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Lrrc43Q3V0L5 Gm31224-201ENSMUST00000212682 513 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Lrrc43Q3V0L5 Gm4803-201ENSMUST00000218729 1279 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Lrrc43Q3V0L5 Gm29787-201ENSMUST00000222129 849 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Lrrc43Q3V0L5 Pmis2-201ENSMUST00000051495 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Lrrc43Q3V0L5 2410015M20Rik-201ENSMUST00000052832 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Lrrc43Q3V0L5 Asphd1-201ENSMUST00000052937 730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Lrrc43Q3V0L5 Olfr398-201ENSMUST00000053874 945 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
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Lrrc43Q3V0L5 Ubn2-201ENSMUST00000039127 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Lrrc43Q3V0L5 Rnf103-203ENSMUST00000114179 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Lrrc43Q3V0L5 Cc2d1b-201ENSMUST00000030320 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Lrrc43Q3V0L5 Ngly1-207ENSMUST00000224656 2329 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Lrrc43Q3V0L5 Sgsm1-201ENSMUST00000048112 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Lrrc43Q3V0L5 2900069G24Rik-201ENSMUST00000192780 1311 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Lrrc43Q3V0L5 Pcnx2-204ENSMUST00000131127 3782 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Lrrc43Q3V0L5 Msx3-201ENSMUST00000055353 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Lrrc43Q3V0L5 Mettl1-201ENSMUST00000006915 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Lrrc43Q3V0L5 Cabp7-201ENSMUST00000009219 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Lrrc43Q3V0L5 Gm38577-201ENSMUST00000221531 4545 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Lrrc43Q3V0L5 Olfr1156-203ENSMUST00000216726 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Lrrc43Q3V0L5 Rufy3-203ENSMUST00000196894 3703 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Lrrc43Q3V0L5 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Lrrc43Q3V0L5 Aire-202ENSMUST00000105395 1630 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Lrrc43Q3V0L5 G3bp2-203ENSMUST00000167918 4232 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Lrrc43Q3V0L5 Cyp2d26-201ENSMUST00000006094 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Lrrc43Q3V0L5 CU062626.3-201ENSMUST00000225522 1411 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Lrrc43Q3V0L5 Nptn-206ENSMUST00000176557 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Lrrc43Q3V0L5 Fbxo41-201ENSMUST00000159062 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Lrrc43Q3V0L5 Ptpn6-201ENSMUST00000004377 2308 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Lrrc43Q3V0L5 Fdx1-202ENSMUST00000214013 2759 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Lrrc43Q3V0L5 Nsd3-211ENSMUST00000155861 2834 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Lrrc43Q3V0L5 Tgfbr3-201ENSMUST00000031224 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Lrrc43Q3V0L5 Gm23200-201ENSMUST00000104379 132 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Lrrc43Q3V0L5 Hexim2-202ENSMUST00000107037 1221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Lrrc43Q3V0L5 Gm16066-201ENSMUST00000118575 1086 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Lrrc43Q3V0L5 Gm12714-201ENSMUST00000143391 669 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Lrrc43Q3V0L5 Samd13-204ENSMUST00000147113 729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Lrrc43Q3V0L5 Gm23776-201ENSMUST00000158993 325 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Lrrc43Q3V0L5 Gm8582-201ENSMUST00000164061 789 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Lrrc43Q3V0L5 1700015G11Rik-202ENSMUST00000185758 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Lrrc43Q3V0L5 Gm37853-201ENSMUST00000195748 660 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Lrrc43Q3V0L5 Gm44760-201ENSMUST00000206375 1173 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Lrrc43Q3V0L5 Med27-201ENSMUST00000028139 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
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