Protein–RNA interactions for Protein: Q3U6N9

UPF0488 protein C8orf33 homolog, mousemouse

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Length 222 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q3U6N9 Hlf-201ENSMUST00000004051 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Q3U6N9 Rdh19-201ENSMUST00000077530 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Q3U6N9 Wnk1-203ENSMUST00000088644 11330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.18□□□□□ -0.46
Q3U6N9 Tomt-202ENSMUST00000106970 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Q3U6N9 Ssc5d-201ENSMUST00000057612 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Q3U6N9 Cdyl-202ENSMUST00000163595 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Q3U6N9 Saa3-202ENSMUST00000210913 2200 ntTSL 3 BASIC12.18□□□□□ -0.46
Q3U6N9 Ndc80-201ENSMUST00000024851 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Q3U6N9 Cops7a-202ENSMUST00000112439 1328 ntTSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Q3U6N9 Renbp-209ENSMUST00000155597 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.18□□□□□ -0.46
Q3U6N9 Gm21964-203ENSMUST00000219454 1513 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.18□□□□□ -0.46
Q3U6N9 Cdc25c-201ENSMUST00000060710 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Q3U6N9 Pxylp1-203ENSMUST00000119141 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Q3U6N9 Spsb1-202ENSMUST00000105684 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Q3U6N9 Cdc26-202ENSMUST00000107459 654 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.18□□□□□ -0.46
Q3U6N9 Gm14999-201ENSMUST00000121039 624 ntBASIC12.18□□□□□ -0.46
Q3U6N9 Tnfrsf18-203ENSMUST00000122001 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Q3U6N9 Gm12678-201ENSMUST00000154177 692 ntTSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Q3U6N9 Cmtm1-201ENSMUST00000159039 1130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Q3U6N9 Gm20498-202ENSMUST00000164386 1043 ntTSL 2 BASIC12.18□□□□□ -0.46
Q3U6N9 Rps13-201ENSMUST00000170953 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Q3U6N9 Rn7s1-201ENSMUST00000174924 300 ntBASIC12.18□□□□□ -0.46
Q3U6N9 Rn7s2-201ENSMUST00000175032 300 ntBASIC12.18□□□□□ -0.46
Q3U6N9 Gm26461-201ENSMUST00000175064 290 ntBASIC12.18□□□□□ -0.46
Q3U6N9 Ldlrad2-201ENSMUST00000178923 429 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.18□□□□□ -0.46
Q3U6N9 Gm37312-201ENSMUST00000195753 685 ntTSL 5 BASIC12.18□□□□□ -0.46
Q3U6N9 Gm42920-201ENSMUST00000196616 409 ntTSL 3 BASIC12.18□□□□□ -0.46
Q3U6N9 Gm9678-201ENSMUST00000198979 1149 ntBASIC12.18□□□□□ -0.46
Q3U6N9 Caly-204ENSMUST00000211283 975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Q3U6N9 Vmo1-201ENSMUST00000021179 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.18□□□□□ -0.46
Q3U6N9 Gm32468-201ENSMUST00000214199 1040 ntTSL 5 BASIC12.18□□□□□ -0.46
Q3U6N9 AC154222.2-201ENSMUST00000225848 607 ntBASIC12.18□□□□□ -0.46
Q3U6N9 Tmem50a-201ENSMUST00000030626 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Q3U6N9 Adi1-201ENSMUST00000020957 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Q3U6N9 Sirpa-202ENSMUST00000099113 3342 ntTSL 3 BASIC12.18□□□□□ -0.46
Q3U6N9 Cnga3-203ENSMUST00000194195 2083 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.18□□□□□ -0.46
Q3U6N9 Nisch-213ENSMUST00000168206 4990 ntTSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Q3U6N9 Pla2g5-204ENSMUST00000102513 2289 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.18□□□□□ -0.46
Q3U6N9 Eln-201ENSMUST00000015138 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Q3U6N9 Gm15326-202ENSMUST00000128198 1422 ntTSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Q3U6N9 Gm43823-201ENSMUST00000197391 1808 ntBASIC12.18□□□□□ -0.46
Q3U6N9 Elovl6-205ENSMUST00000199910 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Q3U6N9 Asap1-216ENSMUST00000177083 4415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Q3U6N9 Pard3-202ENSMUST00000079777 3394 ntTSL 5 BASIC12.18□□□□□ -0.46
Q3U6N9 Pipox-201ENSMUST00000017597 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Q3U6N9 Il34-204ENSMUST00000150680 1796 ntTSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Q3U6N9 Trim59-201ENSMUST00000107802 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Q3U6N9 Ssh3-202ENSMUST00000113852 2735 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Q3U6N9 Ssh3-201ENSMUST00000037992 2728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Q3U6N9 Proser1-201ENSMUST00000058577 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Q3U6N9 Luc7l3-202ENSMUST00000107820 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.17□□□□□ -0.46
Q3U6N9 Lypd6-201ENSMUST00000053208 3620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Q3U6N9 Kcnq1-201ENSMUST00000009689 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Q3U6N9 Sema6c-203ENSMUST00000107217 3595 ntTSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Q3U6N9 Cyp4f17-201ENSMUST00000165999 1693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.17□□□□□ -0.46
Q3U6N9 Gm4864-201ENSMUST00000219894 1461 ntBASIC12.17□□□□□ -0.46
Q3U6N9 Ntm-203ENSMUST00000115237 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Q3U6N9 Erg-206ENSMUST00000122199 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Q3U6N9 Spon2-201ENSMUST00000046186 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Q3U6N9 Atg16l1-201ENSMUST00000027512 3130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Q3U6N9 Bap1-201ENSMUST00000022458 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Q3U6N9 Rab17-201ENSMUST00000027529 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Q3U6N9 Rbm3-202ENSMUST00000115615 1183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Q3U6N9 Rbm3-203ENSMUST00000115616 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Q3U6N9 Msrb3-202ENSMUST00000130950 561 ntTSL 3 BASIC12.17□□□□□ -0.46
Q3U6N9 Dnajc25-204ENSMUST00000152199 1141 ntTSL 5 BASIC12.17□□□□□ -0.46
Q3U6N9 Gm26361-201ENSMUST00000158868 186 ntBASIC12.17□□□□□ -0.46
Q3U6N9 Cox16-204ENSMUST00000166723 579 ntTSL 2 BASIC12.17□□□□□ -0.46
Q3U6N9 Gm45186-201ENSMUST00000206874 478 ntBASIC12.17□□□□□ -0.46
Q3U6N9 Dhrs2-201ENSMUST00000022820 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Q3U6N9 Nit2-201ENSMUST00000023432 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Q3U6N9 Olfr272-201ENSMUST00000051600 962 ntAPPRIS P1 BASIC12.17□□□□□ -0.46
Q3U6N9 Ccdc70-202ENSMUST00000070649 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Q3U6N9 Gm10312-201ENSMUST00000078515 489 ntBASIC12.17□□□□□ -0.46
Q3U6N9 Hapln4-201ENSMUST00000007738 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Q3U6N9 Tfe3-206ENSMUST00000115679 3239 ntTSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Q3U6N9 Stpg3-201ENSMUST00000043774 1430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Q3U6N9 Zfp429-202ENSMUST00000181071 2117 ntTSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Q3U6N9 Prmt2-203ENSMUST00000099572 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Q3U6N9 Cyth1-204ENSMUST00000106305 3179 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Q3U6N9 Pde4a-203ENSMUST00000115458 2962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Q3U6N9 Tmem218-201ENSMUST00000034632 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Q3U6N9 AC137842.1-201ENSMUST00000227896 2064 ntBASIC12.17□□□□□ -0.46
Q3U6N9 Tmc8-201ENSMUST00000050874 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Q3U6N9 Nlrc3-203ENSMUST00000177551 5403 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Q3U6N9 Cyp2t4-202ENSMUST00000164093 1512 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Q3U6N9 Elf4-202ENSMUST00000114958 6088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Q3U6N9 Rbfox3-201ENSMUST00000017576 3150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Q3U6N9 Prr15l-201ENSMUST00000054311 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Q3U6N9 Nfat5-201ENSMUST00000075922 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Q3U6N9 Slc6a18-210ENSMUST00000223074 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Q3U6N9 H2-T22-203ENSMUST00000080015 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Q3U6N9 Rnps1-201ENSMUST00000088512 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Q3U6N9 Slc39a3-201ENSMUST00000059551 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Q3U6N9 Rhox2c-201ENSMUST00000115190 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Q3U6N9 Gng7-205ENSMUST00000118465 875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Q3U6N9 Gm13388-201ENSMUST00000126659 425 ntTSL 3 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Q3U6N9 Gm13570-201ENSMUST00000140763 309 ntBASIC12.16□□□□□ -0.46
Q3U6N9 Gm17105-201ENSMUST00000163715 652 ntTSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Q3U6N9 Ly6g5b-202ENSMUST00000172854 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 89.1 ms