Protein–RNA interactions for Protein: Q14B62

ptchd1, Patched domain-containing protein 1, mousemouse

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Length 888 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ptchd1Q14B62 Gm833-201ENSMUST00000143133 884 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
ptchd1Q14B62 AI480526-203ENSMUST00000160099 1017 ntTSL 2 BASIC12.41□□□□□ -0.42
ptchd1Q14B62 Pde8b-207ENSMUST00000162153 2474 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
ptchd1Q14B62 Gm20683-201ENSMUST00000176751 2790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
ptchd1Q14B62 Rab11b-ps2-201ENSMUST00000178377 657 ntBASIC12.41□□□□□ -0.42
ptchd1Q14B62 2810039B14Rik-206ENSMUST00000185040 1113 ntBASIC12.41□□□□□ -0.42
ptchd1Q14B62 CT033793.1-201ENSMUST00000216883 565 ntTSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
ptchd1Q14B62 Pcgf5-203ENSMUST00000224679 1269 ntAPPRIS P5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
ptchd1Q14B62 Cyb5d1-201ENSMUST00000051620 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
ptchd1Q14B62 Usp19-210ENSMUST00000193678 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
ptchd1Q14B62 Fam49b-201ENSMUST00000063838 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
ptchd1Q14B62 Qsox1-202ENSMUST00000111764 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
ptchd1Q14B62 Gm14963-201ENSMUST00000146751 2558 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
ptchd1Q14B62 Spg7-202ENSMUST00000125975 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
ptchd1Q14B62 Acat2-201ENSMUST00000007005 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
ptchd1Q14B62 Usp19-203ENSMUST00000166103 4473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
ptchd1Q14B62 Otx2-201ENSMUST00000118578 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
ptchd1Q14B62 Fzd1-201ENSMUST00000054294 4197 ntAPPRIS P1 BASIC12.41□□□□□ -0.42
ptchd1Q14B62 Gm29530-201ENSMUST00000187556 1956 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
ptchd1Q14B62 Ccdc88c-201ENSMUST00000068411 7542 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
ptchd1Q14B62 Mfsd14b-201ENSMUST00000054730 3251 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
ptchd1Q14B62 Dis3l-203ENSMUST00000120760 3661 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
ptchd1Q14B62 Snrk-203ENSMUST00000120173 4758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
ptchd1Q14B62 Gpsm2-201ENSMUST00000029482 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
ptchd1Q14B62 Adal-205ENSMUST00000119031 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
ptchd1Q14B62 Kcp-203ENSMUST00000101614 4885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
ptchd1Q14B62 Gns-201ENSMUST00000040344 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
ptchd1Q14B62 Gm14168-201ENSMUST00000144818 2197 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
ptchd1Q14B62 Pnoc-201ENSMUST00000059339 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
ptchd1Q14B62 Slc4a2-202ENSMUST00000115047 4264 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
ptchd1Q14B62 Adora1-202ENSMUST00000086465 4968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
ptchd1Q14B62 Ntm-203ENSMUST00000115237 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
ptchd1Q14B62 Wdfy2-201ENSMUST00000014691 6646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
ptchd1Q14B62 Hmga2-203ENSMUST00000159699 3810 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
ptchd1Q14B62 Ero1lb-201ENSMUST00000071973 4239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
ptchd1Q14B62 Fbxo48-201ENSMUST00000061327 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
ptchd1Q14B62 Magi1-206ENSMUST00000203688 4969 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
ptchd1Q14B62 Slc38a7-204ENSMUST00000212270 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
ptchd1Q14B62 Cd74-202ENSMUST00000097563 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
ptchd1Q14B62 Tfdp2-203ENSMUST00000165768 2212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
ptchd1Q14B62 Asph-202ENSMUST00000078139 6694 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
ptchd1Q14B62 Rnpc3-202ENSMUST00000106535 2616 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
ptchd1Q14B62 Sh3kbp1-206ENSMUST00000112456 7317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
ptchd1Q14B62 Tmem53-203ENSMUST00000106434 923 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
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ptchd1Q14B62 Tmem219-203ENSMUST00000120007 1087 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
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ptchd1Q14B62 D230022J07Rik-201ENSMUST00000144735 1062 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
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ptchd1Q14B62 Dctn2-201ENSMUST00000026479 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
ptchd1Q14B62 Clcn4-203ENSMUST00000210061 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
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ptchd1Q14B62 Fam198a-204ENSMUST00000215990 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.43
ptchd1Q14B62 Efhc1-201ENSMUST00000038447 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.43
ptchd1Q14B62 Mul1-202ENSMUST00000105813 3944 ntTSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.43
ptchd1Q14B62 Elovl3-201ENSMUST00000043739 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.43
ptchd1Q14B62 Laptm5-207ENSMUST00000151698 2600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.43
ptchd1Q14B62 Runx1t1-204ENSMUST00000105566 6090 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.43
ptchd1Q14B62 Plekha2-204ENSMUST00000128715 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
ptchd1Q14B62 Arl4a-205ENSMUST00000146905 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
ptchd1Q14B62 Nup98-206ENSMUST00000211235 3748 ntTSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
ptchd1Q14B62 Ablim2-203ENSMUST00000114203 1333 ntTSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
ptchd1Q14B62 Pcdhgb1-201ENSMUST00000192931 4723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
ptchd1Q14B62 P2rx6-201ENSMUST00000023441 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
ptchd1Q14B62 Nacc1-201ENSMUST00000001975 4300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
ptchd1Q14B62 D230025D16Rik-201ENSMUST00000034361 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
ptchd1Q14B62 Tcf4-204ENSMUST00000114978 2437 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
ptchd1Q14B62 Gm8798-201ENSMUST00000211877 1661 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
ptchd1Q14B62 Fgfr3-211ENSMUST00000171509 4020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
ptchd1Q14B62 Fnbp1-206ENSMUST00000113555 1776 ntTSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
ptchd1Q14B62 4930444K16Rik-201ENSMUST00000220438 1767 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
ptchd1Q14B62 Zeb2-201ENSMUST00000028229 5335 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
ptchd1Q14B62 E130308A19Rik-201ENSMUST00000052420 3205 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
ptchd1Q14B62 E130114P18Rik-202ENSMUST00000107068 1132 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC12.39□□□□□ -0.43
ptchd1Q14B62 Cabp1-203ENSMUST00000112112 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
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