Protein–RNA interactions for Protein: Q07409

Cntn3, Contactin-3, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cntn3Q07409 Gm43822-201ENSMUST00000200285 476 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
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Cntn3Q07409 Zmym4-201ENSMUST00000106108 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Cntn3Q07409 Tcf4-204ENSMUST00000114978 2437 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Cntn3Q07409 Plekhb1-203ENSMUST00000107044 1806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Cntn3Q07409 Sphk2-203ENSMUST00000210060 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Cntn3Q07409 Clcn3-204ENSMUST00000110301 4099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Cntn3Q07409 Adam11-202ENSMUST00000103081 4620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Cntn3Q07409 Sall3-201ENSMUST00000057950 6886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Cntn3Q07409 Dnmt1-207ENSMUST00000216540 5543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Cntn3Q07409 Smarcd2-203ENSMUST00000106843 2548 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Cntn3Q07409 Rab3a-203ENSMUST00000110092 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Cntn3Q07409 Cd34-201ENSMUST00000016638 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Cntn3Q07409 Ccne2-201ENSMUST00000029866 3006 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
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Cntn3Q07409 Nfyc-203ENSMUST00000118902 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Cntn3Q07409 Phf13-201ENSMUST00000055688 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
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Cntn3Q07409 Zfp444-204ENSMUST00000108567 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
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Cntn3Q07409 Adam33-202ENSMUST00000110232 3165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
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Cntn3Q07409 Ralgapb-203ENSMUST00000109486 8383 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
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Cntn3Q07409 H2-T22-201ENSMUST00000058801 1534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
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Cntn3Q07409 Upk3bl-202ENSMUST00000111137 1119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
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Cntn3Q07409 Tex9-206ENSMUST00000183574 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
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Cntn3Q07409 Bud13-201ENSMUST00000074957 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Cntn3Q07409 Tbc1d8-204ENSMUST00000193823 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Cntn3Q07409 Cdc73-201ENSMUST00000018337 11586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Cntn3Q07409 Slc25a42-201ENSMUST00000063788 3081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Cntn3Q07409 Ormdl1-201ENSMUST00000027266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Cntn3Q07409 Zfp467-206ENSMUST00000114561 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Cntn3Q07409 Nkain3-202ENSMUST00000119374 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Cntn3Q07409 Diaph3-202ENSMUST00000168889 4582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Cntn3Q07409 Diaph3-201ENSMUST00000022599 4582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Cntn3Q07409 Rtl6-201ENSMUST00000069476 4426 ntAPPRIS P1 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Cntn3Q07409 Nmral1-202ENSMUST00000079130 1459 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Cntn3Q07409 Sec62-201ENSMUST00000029256 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Cntn3Q07409 Dph2-201ENSMUST00000030265 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Cntn3Q07409 Rab39-201ENSMUST00000068449 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Cntn3Q07409 Ube2a-201ENSMUST00000016452 1732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Cntn3Q07409 Arhgap20os-204ENSMUST00000152203 2113 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Cntn3Q07409 Cpa1-201ENSMUST00000031806 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Cntn3Q07409 Pde12-201ENSMUST00000052932 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Cntn3Q07409 Ccdc71-201ENSMUST00000061209 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Cntn3Q07409 Ilvbl-212ENSMUST00000220430 2350 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Cntn3Q07409 Fchsd1-201ENSMUST00000043437 4270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Cntn3Q07409 Th-201ENSMUST00000000219 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Cntn3Q07409 Cpq-207ENSMUST00000228916 1842 ntAPPRIS P1 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Cntn3Q07409 Gm20700-201ENSMUST00000176749 2206 ntTSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Cntn3Q07409 Dnase1l1-203ENSMUST00000114189 755 ntTSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Cntn3Q07409 Cbfa2t2-ps1-201ENSMUST00000117165 730 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
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