Protein–RNA interactions for Protein: Q06348

Prrx2, Paired mesoderm homeobox protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 247 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prrx2Q06348 Gm45224-201ENSMUST00000208203 414 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Prrx2Q06348 Hrc-202ENSMUST00000211327 607 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Prrx2Q06348 Calml4-207ENSMUST00000215968 526 ntTSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
Prrx2Q06348 Gm31793-201ENSMUST00000218557 415 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Prrx2Q06348 Riiad1-201ENSMUST00000029785 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Prrx2Q06348 Ly6g5c-201ENSMUST00000037849 509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Prrx2Q06348 Cyb5d1-201ENSMUST00000051620 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Prrx2Q06348 Jakmip1-201ENSMUST00000043794 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Prrx2Q06348 Ell3-202ENSMUST00000116432 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Prrx2Q06348 Samd4-203ENSMUST00000125113 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Prrx2Q06348 Ctgf-203ENSMUST00000176228 2490 ntTSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
Prrx2Q06348 Dmrta1-201ENSMUST00000052478 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Prrx2Q06348 Ubtf-209ENSMUST00000173870 2936 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Prrx2Q06348 Gm43081-201ENSMUST00000199082 1380 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Prrx2Q06348 Slc35e2-202ENSMUST00000105608 6291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Prrx2Q06348 Hk1-202ENSMUST00000099691 4278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Prrx2Q06348 Phactr3-202ENSMUST00000103066 2680 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
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Prrx2Q06348 Tcp11l1-201ENSMUST00000028597 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
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Prrx2Q06348 Dpp8-201ENSMUST00000034960 4808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Prrx2Q06348 1110002L01Rik-202ENSMUST00000168012 3569 ntTSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
Prrx2Q06348 Prss23-201ENSMUST00000041761 3228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Prrx2Q06348 Kdm4b-201ENSMUST00000025036 4577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Prrx2Q06348 Dppa4-202ENSMUST00000096045 1534 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Prrx2Q06348 Gnaz-202ENSMUST00000159991 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Prrx2Q06348 Slc4a5-201ENSMUST00000039212 5123 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Prrx2Q06348 Pnkd-201ENSMUST00000027370 2937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Prrx2Q06348 Fn1-201ENSMUST00000055226 8315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Prrx2Q06348 Vcpip1-201ENSMUST00000057438 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Prrx2Q06348 Gm43738-201ENSMUST00000200659 2635 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Prrx2Q06348 4930423D22Rik-201ENSMUST00000221909 1674 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
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Prrx2Q06348 Plcb1-202ENSMUST00000110116 7003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Prrx2Q06348 Fip1l1-201ENSMUST00000080164 4673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Prrx2Q06348 Draxin-201ENSMUST00000030862 5200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
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Prrx2Q06348 AC126444.1-201ENSMUST00000225938 1768 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Prrx2Q06348 Gm11568-201ENSMUST00000107434 1145 ntAPPRIS P1 BASIC10.99□□□□□ -0.65
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Prrx2Q06348 Ip6k2-204ENSMUST00000192307 1191 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Prrx2Q06348 Rassf4-202ENSMUST00000203029 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Prrx2Q06348 3300002P13Rik-201ENSMUST00000204020 1092 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
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Prrx2Q06348 AC112680.3-201ENSMUST00000215297 488 ntTSL 3 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Prrx2Q06348 2310002L09Rik-201ENSMUST00000030101 958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
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Prrx2Q06348 Ndufaf7-201ENSMUST00000024887 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
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Prrx2Q06348 Vps26b-201ENSMUST00000034470 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Prrx2Q06348 Rnf220-202ENSMUST00000094853 1675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Prrx2Q06348 Nfib-203ENSMUST00000107245 9116 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
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Prrx2Q06348 Vipr1-201ENSMUST00000035115 4902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Prrx2Q06348 Ctbp2-209ENSMUST00000166439 1997 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Prrx2Q06348 Epb41l5-208ENSMUST00000191046 6870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Prrx2Q06348 Gosr2-202ENSMUST00000107013 1044 ntTSL 2 BASIC10.98□□□□□ -0.65
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Prrx2Q06348 Pla2g10-202ENSMUST00000115807 964 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Prrx2Q06348 Gm8566-201ENSMUST00000120174 465 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Prrx2Q06348 Gm14665-201ENSMUST00000122294 557 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Prrx2Q06348 Dnajb6-202ENSMUST00000012734 1024 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Prrx2Q06348 3110056K07Rik-202ENSMUST00000136690 1063 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Prrx2Q06348 Gm25043-201ENSMUST00000158604 212 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Prrx2Q06348 Gm23699-201ENSMUST00000158835 135 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Prrx2Q06348 Smim22-207ENSMUST00000184439 382 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Prrx2Q06348 Gm43050-201ENSMUST00000201062 338 ntTSL 2 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Prrx2Q06348 4930404N11Rik-201ENSMUST00000020456 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Prrx2Q06348 Gm2511-202ENSMUST00000206158 455 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Prrx2Q06348 Gm18393-201ENSMUST00000208349 1131 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Prrx2Q06348 Gm31224-201ENSMUST00000212682 513 ntTSL 3 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Prrx2Q06348 AC135669.1-202ENSMUST00000216742 540 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Prrx2Q06348 Abracl-204ENSMUST00000220110 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Prrx2Q06348 AC166095.1-201ENSMUST00000223731 1241 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Prrx2Q06348 Tnfrsf17-201ENSMUST00000023140 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Prrx2Q06348 Cd7-201ENSMUST00000026159 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Prrx2Q06348 Rarg-201ENSMUST00000043172 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Prrx2Q06348 Gm22058-201ENSMUST00000083393 310 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.7 ms