Protein–RNA interactions for Protein: P25233

Ndn, Necdin, mousemouse

Predictions only

Length 325 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NdnP25233 Gm1401-201ENSMUST00000122048 772 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
NdnP25233 Plpp7-202ENSMUST00000140762 634 ntTSL 3 BASIC10.28□□□□□ -0.76
NdnP25233 Gm16156-201ENSMUST00000141168 713 ntTSL 3 BASIC10.28□□□□□ -0.76
NdnP25233 Ccl27a-217ENSMUST00000155240 343 ntTSL 2 BASIC10.28□□□□□ -0.76
NdnP25233 1600014C10Rik-207ENSMUST00000179503 784 ntTSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
NdnP25233 Rpl31-205ENSMUST00000194746 703 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
NdnP25233 Tdrkh-208ENSMUST00000200486 1231 ntTSL 3 BASIC10.28□□□□□ -0.76
NdnP25233 Zfp524-203ENSMUST00000209030 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
NdnP25233 Mobp-207ENSMUST00000215512 498 ntTSL 2 BASIC10.28□□□□□ -0.76
NdnP25233 Vsig2-206ENSMUST00000215957 851 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
NdnP25233 AC159635.2-201ENSMUST00000223092 817 ntTSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
NdnP25233 AC093022.5-201ENSMUST00000226841 1079 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
NdnP25233 Ndufb7-201ENSMUST00000036996 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
NdnP25233 Olfr520-201ENSMUST00000098264 951 ntAPPRIS P1 BASIC10.28□□□□□ -0.76
NdnP25233 Ric3-201ENSMUST00000055993 5281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
NdnP25233 Git1-201ENSMUST00000037285 3512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
NdnP25233 Adora1-202ENSMUST00000086465 4968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
NdnP25233 Il9r-202ENSMUST00000128311 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
NdnP25233 Maob-201ENSMUST00000040820 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
NdnP25233 Slc6a9-209ENSMUST00000163288 2107 ntTSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
NdnP25233 Tmod2-201ENSMUST00000064433 9884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
NdnP25233 Gm7642-201ENSMUST00000216345 1809 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
NdnP25233 Mecom-202ENSMUST00000108270 5692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
NdnP25233 Frmd8-201ENSMUST00000025728 4504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
NdnP25233 Togaram1-207ENSMUST00000223166 6386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
NdnP25233 Inpp4a-206ENSMUST00000132615 3038 ntTSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
NdnP25233 Spesp1-201ENSMUST00000056949 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
NdnP25233 Arhgef2-203ENSMUST00000170653 4238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
NdnP25233 Hnrnpa2b1-210ENSMUST00000204188 1518 ntTSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
NdnP25233 Zscan12-203ENSMUST00000225545 4405 ntAPPRIS P1 BASIC10.27□□□□□ -0.76
NdnP25233 Arid5a-204ENSMUST00000115032 4640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
NdnP25233 Msantd3-202ENSMUST00000064807 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
NdnP25233 Gm37660-201ENSMUST00000192754 1732 ntBASIC10.27□□□□□ -0.76
NdnP25233 9330199G10Rik-202ENSMUST00000221607 1728 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
NdnP25233 Tm9sf2-201ENSMUST00000026624 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
NdnP25233 Smtn-203ENSMUST00000075118 3117 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
NdnP25233 Gabpb1-206ENSMUST00000110425 4153 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
NdnP25233 Rasgef1b-203ENSMUST00000146396 3339 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
NdnP25233 Fgd5-202ENSMUST00000113466 5621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
NdnP25233 Afg3l1-201ENSMUST00000001520 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
NdnP25233 Hnrnpf-201ENSMUST00000035493 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
NdnP25233 Enoph1-201ENSMUST00000031268 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
NdnP25233 Gm37613-201ENSMUST00000195677 3580 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
NdnP25233 Chd5-201ENSMUST00000005175 9122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
NdnP25233 Gm26531-201ENSMUST00000181727 1967 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
NdnP25233 Bbs1-201ENSMUST00000053506 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
NdnP25233 A530058N18Rik-205ENSMUST00000143993 550 ntTSL 3 BASIC10.27□□□□□ -0.77
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NdnP25233 Gm20509-201ENSMUST00000174203 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
NdnP25233 Gm3809-201ENSMUST00000180973 1006 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
NdnP25233 Gm27244-201ENSMUST00000184260 380 ntTSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
NdnP25233 Timm13-204ENSMUST00000219896 542 ntTSL 3 BASIC10.27□□□□□ -0.77
NdnP25233 AC123645.1-201ENSMUST00000228469 605 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
NdnP25233 Ly6g6f-201ENSMUST00000038507 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
NdnP25233 Sf3b6-201ENSMUST00000046207 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
NdnP25233 Olfr283-201ENSMUST00000057386 1102 ntAPPRIS P1 BASIC10.27□□□□□ -0.77
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NdnP25233 Unkl-204ENSMUST00000160896 4787 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
NdnP25233 Dcaf4-201ENSMUST00000021645 2008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
NdnP25233 Cyb561d1-201ENSMUST00000065664 4058 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
NdnP25233 Lrrc74b-203ENSMUST00000100123 2231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
NdnP25233 Ino80c-203ENSMUST00000141489 2207 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
NdnP25233 Zfp354c-201ENSMUST00000000632 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
NdnP25233 Rdh11-201ENSMUST00000085254 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
NdnP25233 Zfp114-203ENSMUST00000206547 3154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
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NdnP25233 Tyw1-203ENSMUST00000100662 1867 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
NdnP25233 Zfp64-203ENSMUST00000109162 2848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.27□□□□□ -0.77
NdnP25233 Pck1-201ENSMUST00000029017 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
NdnP25233 4632404M16Rik-201ENSMUST00000197326 2882 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
NdnP25233 Fscn2-201ENSMUST00000026445 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
NdnP25233 Myom3-201ENSMUST00000105854 5575 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
NdnP25233 Gm8337-201ENSMUST00000187358 1938 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
NdnP25233 Hmga1-201ENSMUST00000114888 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
NdnP25233 Pex11b-207ENSMUST00000165842 1562 ntTSL 2 BASIC10.26□□□□□ -0.77
NdnP25233 AC160411.1-201ENSMUST00000218544 4560 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
NdnP25233 Sec22b-201ENSMUST00000029476 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
NdnP25233 Spata20-201ENSMUST00000041705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
NdnP25233 Ephx3-201ENSMUST00000087721 2416 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
NdnP25233 AC087890.1-201ENSMUST00000219321 1823 ntTSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
NdnP25233 Hsd3b6-201ENSMUST00000029463 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
NdnP25233 Gm13613-201ENSMUST00000126240 1444 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
NdnP25233 Pla2g10-201ENSMUST00000023364 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
NdnP25233 Rpe-201ENSMUST00000027157 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
NdnP25233 Arfgap1-204ENSMUST00000108861 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
NdnP25233 1500015A07Rik-201ENSMUST00000184181 1865 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
NdnP25233 Styxl1-208ENSMUST00000178515 1651 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
NdnP25233 Gm45272-203ENSMUST00000211111 1693 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
NdnP25233 Ckm-203ENSMUST00000208710 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
NdnP25233 Gm14169-201ENSMUST00000124676 2519 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
NdnP25233 Arhgap24-202ENSMUST00000073302 3151 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
NdnP25233 Vps25-203ENSMUST00000100414 1220 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
NdnP25233 Plekhb1-202ENSMUST00000107043 931 ntTSL 2 BASIC10.26□□□□□ -0.77
NdnP25233 Rph3al-203ENSMUST00000108420 695 ntTSL 3 BASIC10.26□□□□□ -0.77
NdnP25233 Gm15427-201ENSMUST00000117288 531 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
NdnP25233 Chchd7-205ENSMUST00000120732 711 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
NdnP25233 Rpl18-ps1-201ENSMUST00000121555 525 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
NdnP25233 Sel1l-204ENSMUST00000167466 5544 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
NdnP25233 Mir3113-201ENSMUST00000175478 76 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
NdnP25233 Retsat-204ENSMUST00000176168 1203 ntTSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.6 ms